RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498160.5

CTDSP1-215, Transcript of CTD small phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDSP1, Length 877 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1-215ENST00000498160 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa15.06■□□□□ 0
CTDSP1-215ENST00000498160 V9GYS6 101 aa15.06■□□□□ 0
CTDSP1-215ENST00000498160 RTTNQ86VV8 2226 aa15.06■□□□□ 0
CTDSP1-215ENST00000498160 COL12A1Q99715 3063 aa15.06■□□□□ 0
CTDSP1-215ENST00000498160 M0R233 179 aa15.05■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 CCRL2O00421 344 aa15.05■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 LALBAP00709 142 aa15.05■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 PPOXP50336 477 aa15.05■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 SLC3A1Q07837 685 aa15.05■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP15.05■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 KRT74Q7RTS7 529 aa15.05■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 SPERTQ8NA61 448 aa15.05■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 OR8G5Q8NG78 346 aa15.05■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 PP6455Q8WZ26 134 aa15.05■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 GHSRQ92847 366 aa15.05■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 NEUROG1Q92886 237 aa15.05■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 PIGTQ969N2 578 aa15.05■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 MUL1Q969V5 352 aa15.05■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP15.05■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 PGLYRP3Q96LB9 341 aa15.05■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 OPALINQ96PE5 141 aa15.05■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa15.05■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 SCOCQ9UIL1 159 aa15.05■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa15.05■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 DHDHQ9UQ10 334 aa15.05■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 MPC1Q9Y5U8 109 aa15.05■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa15.04■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 A0A1B0GTI1 187 aa15.04■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 HLA-DPB1P04440 258 aa15.04■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 DANCRP0C864 163 aa15.04■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 GALP22466 123 aa15.04■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 GNALP38405 381 aa15.04■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 MPV17P39210 176 aa15.04■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 NEDD8Q15843 81 aa15.04■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 PCGF3Q3KNV8 242 aa15.04■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 XAF1Q6GPH4 301 aa15.04■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 OR2T2Q6IF00 324 aa15.04■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 PAMR1Q6UXH9 720 aa15.04■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 OR56B2PQ8NGI1 322 aa15.04■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 OR13C3Q8NGS6 347 aa15.04■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 OR13G1Q8NGZ3 307 aa15.04■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 PHYHIPQ92561 330 aa15.04■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 LYZL4Q96KX0 146 aa15.04■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa15.04■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 SYT3Q9BQG1 590 aa15.04■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 POFUT1Q9H488 388 aa15.04■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 DYNLRB1Q9NP97 96 aa15.04■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 NDUFB11Q9NX14 153 aa15.04■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 TAAR3PQ9P1P4 343 aa15.04■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 PLCE1Q9P212 2302 aa15.04■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 ABCA4P78363 2273 aa15.03■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 GMDSO60547 372 aa15.03■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 GATBO75879 557 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 CST4P01036 141 aa15.03■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 ZNF20P17024 532 aa15.03■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 TNFSF4P23510 183 aa15.03■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 GABRA5P31644 462 aa15.03■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 SWI5Q1ZZU3 235 aa15.03■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 ODF4Q2M2E3 257 aa15.03■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa15.03■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 Q499Y3 187 aa15.03■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 LIPKQ5VXJ0 399 aa15.03■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 PHC2Q8IXK0 858 aa15.03■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 OR14K1Q8NGZ2 314 aa15.03■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 PPP1R14AQ96A00 147 aa15.03■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 CXorf56Q9H5V9 222 aa15.03■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 TMEM100Q9NV29 134 aa15.03■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 A0A1W2PPR1 153 aa15.02■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 ANXA2P2A6NMY6 339 aa15.02■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 RAF1P04049 648 aa15.02■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 ADH4P08319 380 aa15.02■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 OCM2P0CE71 109 aa15.02■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 SMIM18P0DKX4 95 aa15.02■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 TSTQ16762 297 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 CLVS2Q5SYC1 327 aa15.02■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 ZFP41Q8N8Y5 198 aa15.02■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 SLC30A2Q9BRI3 323 aa15.02■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa15.02■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 FZR1Q9UM11 496 aa15.02■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 PIGLQ9Y2B2 252 aa15.02■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
CTDSP1-215ENST00000498160 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa15.01□□□□□ -0.01
CTDSP1-215ENST00000498160 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa15.01□□□□□ -0.01
CTDSP1-215ENST00000498160 A0A1B0GWJ7 208 aa15.01□□□□□ -0.01
CTDSP1-215ENST00000498160 C5orf63A6NC05 138 aa15.01□□□□□ -0.01
CTDSP1-215ENST00000498160 INMTO95050 263 aa15.01□□□□□ -0.01
CTDSP1-215ENST00000498160 ALX3O95076 343 aa15.01□□□□□ -0.01
CTDSP1-215ENST00000498160 ZNF81P51508 661 aa15.01□□□□□ -0.01
CTDSP1-215ENST00000498160 MMP15P51511 669 aa15.01□□□□□ -0.01
CTDSP1-215ENST00000498160 MSMPQ1L6U9 139 aa15.01□□□□□ -0.01
CTDSP1-215ENST00000498160 ZNF787Q6DD87 383 aa15.01□□□□□ -0.01
CTDSP1-215ENST00000498160 UTS2BQ765I0 119 aa15.01□□□□□ -0.01
CTDSP1-215ENST00000498160 SERPINA12Q8IW75 414 aa15.01□□□□□ -0.01
CTDSP1-215ENST00000498160 OR5D14Q8NGL3 314 aa15.01□□□□□ -0.01
CTDSP1-215ENST00000498160 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms