RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497508.1

TMEM18-208, Transcript of transmembrane protein 18, human

TSL 2

Gene TMEM18, Length 1,706 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM18-208	ENST00000497508	NKAIN3	Q8N8D7	197 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	OR8B12	Q8NGG6	310 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	C15orf40	Q8WUR7	153 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	STARD4	Q96DR4	205 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	ZFP3	Q96NJ6	502 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	SFXN3	Q9BWM7	321 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	PLEKHA1	Q9HB21	404 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	SLC17A5	Q9NRA2	495 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	TMEM38B	Q9NVV0	291 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	NPAP1	Q9NZP6	1156 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	LOC100289279	A0A1B0GTE1	492 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	FAM240B	A0A1B0GVZ2	78 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	LMX1B	O60663	402 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	ITGA5	P08648	1049 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	FAM157B	P0CG42	384 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	CCL1	P22362	96 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	DDOST	P39656	456 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	TFF3	Q07654	80 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	GUSBP1	Q15486	140 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	ELFN2	Q5R3F8	820 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	C1orf100	Q5SVJ3	147 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	AGAP6	Q5VW22	663 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	FAM214B	Q7L5A3	538 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	DRAXIN	Q8NBI3	349 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	OR6M1	Q8NGM8	313 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	OR51E1	Q8TCB6	317 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	SLC25A28	Q96A46	364 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	FAM3D	Q96BQ1	224 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	FGGY	Q96C11	551 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	FOXRED1	Q96CU9	486 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	ITPKC	Q96DU7	683 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	GMPPA	Q96IJ6	420 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	OPN3	Q9H1Y3	402 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	MMP28	Q9H239	520 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	C12orf49	Q9H741	205 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	EMC3	Q9P0I2	261 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	DCHS2	Q6V1P9	2916 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	APOC1	P02654	83 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	AGTR1	P30556	359 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	PTH2R	P49190	550 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	POU3F4	P49335	361 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	MRPS10	P82664	201 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	SNTB1	Q13884	538 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	GPR176	Q14439	515 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	SLC36A2	Q495M3	483 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	TMEM69	Q5SWH9	247 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	PLET1	Q6UQ28	207 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	FAM57B	Q71RH2	274 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	LINGO2	Q7L985	606 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	ZC3HAV1	Q7Z2W4	902 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	SERPINA12	Q8IW75	414 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	UBE2J2	Q8N2K1	259 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	LRRC18	Q8N456	261 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	PLPP7	Q8NBV4	271 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	OR51D1	Q8NGF3	324 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	OR1J2	Q8NGS2	313 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	RNF121	Q9H920	327 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	CRLF2	Q9HC73	371 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	GPR35	Q9HC97	309 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	NPDC1	Q9NQX5	325 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	CACNG2	Q9Y698	323 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	HCFC1	P51610	2035 aa		12.73	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	LOC390937	A0A1W2PQ73	354 aa		12.73	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	GABARAP	H6UMI1	98 aa		12.73	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	IL18BP	O95998	194 aa		12.73	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	CRH	P06850	196 aa		12.73	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	CD3G	P09693	182 aa		12.73	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	SLC2A1	P11166	492 aa		12.73	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNF20	P17024	532 aa		12.73	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	CDK2	P24941	298 aa		12.73	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	HTR2C	P28335	458 aa		12.73	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	BDKRB2	P30411	391 aa		12.73	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	CAPZA1	P52907	286 aa		12.73	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	SPOCK1	Q08629	439 aa		12.73	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	RAB35	Q15286	201 aa		12.73	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	12.73	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	STK11	Q15831	433 aa		12.73	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	C2orf76	Q3KRA6	126 aa		12.73	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNF529	Q6P280	563 aa		12.73	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	DOK3	Q7L591	496 aa		12.73	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	PRSS45	Q7RTY3	260 aa		12.73	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	NUFIP2	Q7Z417	695 aa	Known RBP	12.73	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	LYPD6	Q86Y78	171 aa		12.73	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	OR1M1	Q8NGA1	313 aa		12.73	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	OR51A2	Q8NGJ7	313 aa		12.73	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	FBXO17	Q96EF6	278 aa		12.73	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	ADAT3	Q96EY9	351 aa	Predicted RBP	12.73	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	PGAM5	Q96HS1	289 aa		12.73	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	C7orf50	Q9BRJ6	194 aa	Known RBP	12.73	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	LINC00470	Q9BZP3	86 aa		12.73	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	GPR84	Q9NQS5	396 aa		12.73	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	PARPBP	Q9NWS1	579 aa		12.73	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	NOSIP	Q9Y314	301 aa	Known RBP	12.73	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	OTX1	P32242	354 aa	Predicted RBP	12.72	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	GNAL	P38405	381 aa		12.72	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	TAS2R20	P59543	309 aa		12.72	□□□□□ -0.37

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