RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497368.1

UBE3C-208, Transcript of ubiquitin protein ligase E3C, human

TSL 2

Gene UBE3C, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBE3C-208	ENST00000497368	BHLHE23	Q8NDY6	225 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	OR8G5	Q8NG78	346 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	OR4K13	Q8NH42	304 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	OR52J3	Q8NH60	311 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	OR2AE1	Q8NHA4	323 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	FNDC8	Q8TC99	324 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	ST7L	Q8TDW4	575 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	ST8SIA2	Q92186	375 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	RAB1C	Q92928	201 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	POP5	Q969H6	163 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	FAM162A	Q96A26	154 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	RBP7	Q96R05	134 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	TBX15	Q96SF7	602 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	MNT	Q99583	582 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	HOPX	Q9BPY8	73 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	KCTD14	Q9BQ13	255 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	WAC	Q9BTA9	647 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	NMNAT2	Q9BZQ4	307 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	HDHD2	Q9H0R4	259 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	LRMDA	Q9H2I8	198 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	GORASP2	Q9H8Y8	452 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	ELOVL3	Q9HB03	270 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	CYSLTR2	Q9NS75	346 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	DECR2	Q9NUI1	292 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	DDX28	Q9NUL7	540 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	ZNF319	Q9P2F9	582 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	RPS6KA6	Q9UK32	745 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	TMEM5	Q9Y2B1	443 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	PCDHGB1	Q9Y5G3	927 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	LYVE1	Q9Y5Y7	322 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	COMMD3-BMI1	R4GMX3	469 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	DNAH7	Q8WXX0	4024 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	PLSCR5	A0PG75	271 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	TVP23A	A6NH52	213 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	PRR32	B1ATL7	298 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	SPRY1	O43609	319 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	FOXH1	O75593	365 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	FSTL3	O95633	263 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	TFF1	P04155	84 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	NR2C1	P13056	603 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	SELL	P14151	372 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	GSTM3	P21266	225 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	MDK	P21741	143 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	GATA3	P23771	443 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	PRTN3	P24158	256 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	PRDX6	P30041	224 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	RRM2	P31350	389 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	LIPA	P38571	399 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	MDH2	P40926	338 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	PTTG1IP	P53801	180 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	DLX1	P56177	255 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	PCBD1	P61457	104 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	ACTG1	P63261	375 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	SPIB	Q01892	262 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	ZNF92	Q03936	586 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	KHDRBS1	Q07666	443 aa	Known RBP eCLIP	4.55	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	TRAP1	Q12931	704 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	FHL2	Q14192	279 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	RFX4	Q33E94	735 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	GLYATL3	Q5SZD4	288 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	WDR25	Q64LD2	544 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	ZNF826P	Q6ZT77	177 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	RHOU	Q7L0Q8	258 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	TMEM179B	Q7Z7N9	219 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	SPIC	Q8N5J4	248 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	GCSAM	Q8N6F7	178 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	CYB561A3	Q8NBI2	242 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	SLC37A3	Q8NCC5	494 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	OR51L1	Q8NGJ5	315 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	OR9Q1	Q8NGQ5	310 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	ZNF418	Q8TF45	676 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	LZIC	Q8WZA0	190 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	APOBEC3D	Q96AK3	386 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	SEH1L	Q96EE3	360 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	ERMAP	Q96PL5	475 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	RBM4	Q9BWF3	364 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	SUCNR1	Q9BXA5	334 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	SIRPD	Q9H106	197 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	RERGL	Q9H628	205 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	SPAG4	Q9NPE6	437 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	RPRD1B	Q9NQG5	326 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	EIF3K	Q9UBQ5	218 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	NUP50	Q9UKX7	468 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	TMCC3	Q9ULS5	477 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	PPP1R3C	Q9UQK1	317 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	KLHDC2	Q9Y2U9	406 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	CDH10	Q9Y6N8	788 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	hCG_38984	A0A1B0GV85	526 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	CLDN34	H7C241	214 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	TRIM77	I1YAP6	450 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	XKRY	O14609	159 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	SOX14	O95416	240 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	GYPB	P06028	91 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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