RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497327.1

GGPS1-208, Transcript of geranylgeranyl diphosphate synthase 1, human

TSL 3

Gene GGPS1, Length 868 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGPS1-208	ENST00000497327	STUB1	Q9UNE7	303 aa		4.65	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	TP53TG5	Q9Y2B4	290 aa		4.65	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	GRIP1	Q9Y3R0	1128 aa		4.65	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	LHFPL6	Q9Y693	200 aa		4.65	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	TNRC6A	Q8NDV7	1962 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	MAP1B	P46821	2468 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327		A0A1B0GTH9	108 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	MED19	A0JLT2	244 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	OR6C65	A6NJZ3	312 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	SLC22A20	A6NK97	555 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	OR4C45	A6NMZ5	311 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	MRPL33	O75394	65 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	ZNF254	O75437	659 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	PNP	P00491	289 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	HLA-DPB1	P04440	258 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	TACSTD2	P09758	323 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	ZNF823	P16415	610 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	DCTD	P32321	178 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	PSMB10	P40306	273 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	OPRL1	P41146	370 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	CCR9	P51686	369 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	TDGF1P3	P51864	188 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	GBX2	P52951	348 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	LSM3	P62310	102 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	PMS2P11	Q13670	270 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	EIF2B1	Q14232	305 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	RSPO1	Q2MKA7	263 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	TIMM50	Q3ZCQ8	353 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	KRTCAP3	Q53RY4	240 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	LCE1E	Q5T753	118 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	TSPO2	Q5TGU0	170 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	NSUN5P2	Q63ZY6	315 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	CORO6	Q6QEF8	472 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	LRRN1	Q6UXK5	716 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	NUFIP2	Q7Z417	695 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	DCXR	Q7Z4W1	244 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	ZNF679	Q8IYX0	411 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	TEX19	Q8NA77	164 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	OR2G2	Q8NGZ5	317 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	OR52N5	Q8NH56	324 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	THEM6	Q8WUY1	208 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	HSD17B8	Q92506	261 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	RGP1	Q92546	391 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	GHSR	Q92847	366 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	TMEM203	Q969S6	136 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	MSI2	Q96DH6	328 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	SMIM19	Q96E16	107 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	MRPL48	Q96GC5	212 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	COQ7	Q99807	217 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	TTYH2	Q9BSA4	534 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	DCUN1D5	Q9BTE7	237 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	MED18	Q9BUE0	208 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	TTTY10	Q9BZA0	68 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	ULBP2	Q9BZM5	246 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	SLIRP	Q9GZT3	109 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	NXF2	Q9GZY0	626 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	PRORY	Q9H606	182 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	EXO5	Q9H790	373 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	CALHM2	Q9HA72	323 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	ELOVL3	Q9HB03	270 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	GLRX2	Q9NS18	164 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	SLC7A10	Q9NS82	523 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	TMEM38B	Q9NVV0	291 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	EMC3	Q9P0I2	261 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	LAMP5	Q9UJQ1	280 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	GNG8	Q9UK08	70 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	CAMK2A	Q9UQM7	478 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	NOSIP	Q9Y314	301 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	TLN1	Q9Y490	2541 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	ARPC4-TTLL3	A0A0A6YYG9	625 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	LOC100506127	A0A0U1RQW1	187 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	PNMA8C	A0A1B0GUJ8	204 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	GABRP	O00591	440 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	RER1	O15258	196 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	PIN1P1	O15428	100 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	ZNHIT1	O43257	154 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	GPRIN2	O60269	458 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	TMCC2	O75069	709 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	KRT8	P05787	483 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	CST2	P09228	141 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	FCGR2A	P12318	317 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	NPR2	P20594	1047 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	MSR1	P21757	451 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	AGTR1	P30556	359 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	OTX1	P32242	354 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	KIR3DL2	P43630	455 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	OR3A2	P47893	321 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	GDI2	P50395	445 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	TUBA1B	P68363	451 aa		4.63	□□□□□ -1.67

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