RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494395.1

ITGB1-217, Transcript of integrin subunit beta 1, humanhuman

TSL 3

Gene ITGB1, Length 562 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB1-217ENST00000494395 DEGS2Q6QHC5 323 aa7.4□□□□□ -1.22
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ITGB1-217ENST00000494395 SSX6Q7RTT6 188 aa7.4□□□□□ -1.22
ITGB1-217ENST00000494395 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
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ITGB1-217ENST00000494395 OR13G1Q8NGZ3 307 aa7.4□□□□□ -1.22
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ITGB1-217ENST00000494395 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
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ITGB1-217ENST00000494395 KRT77Q7Z794 578 aa7.38□□□□□ -1.23
ITGB1-217ENST00000494395 ENTHD1Q8IYW4 607 aa7.38□□□□□ -1.23
ITGB1-217ENST00000494395 OR51G2Q8NGK0 314 aa7.38□□□□□ -1.23
ITGB1-217ENST00000494395 RHOXF1Q8NHV9 184 aa7.38□□□□□ -1.23
ITGB1-217ENST00000494395 CCL17Q92583 94 aa7.38□□□□□ -1.23
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