RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491581.5

HDAC3-211, Transcript of histone deacetylase 3, humanhuman

TSL 3

Gene HDAC3, Length 777 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC3-211ENST00000491581 OR2T4Q8NH00 348 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 OR2T29Q8NH02 315 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 Q8TCH9 128 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 LHX4Q969G2 390 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 LYZL4Q96KX0 146 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 COG8Q96MW5 612 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 JMJD8Q96S16 334 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 FEVQ99581 238 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 KCNJ15Q99712 375 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 ABHD6Q9BV23 337 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 CHIAQ9BZP6 476 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 WDR13Q9H1Z4 485 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 OR51V1Q9H2C8 321 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 NTN4Q9HB63 628 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 TUBG2Q9NRH3 451 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 ACTR3BQ9P1U1 418 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 RNF7Q9UBF6 113 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 MIOXQ9UGB7 285 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 CMYA5Q8N3K9 4069 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 A0A0U1RQK1 487 aa7.36□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 LRRC30A6NM36 301 aa7.36□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 DVL1O14640 695 aa7.36□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 ACOT8O14734 319 aa7.36□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 IGHV4-59P01825 116 aa7.36□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 IRF2P14316 349 aa7.36□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 POU1F1P28069 291 aa7.36□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 FMO3P31513 532 aa7.36□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 IKZF1Q13422 519 aa7.36□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 TAF13Q15543 124 aa7.36□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 WDR38Q5JTN6 314 aa7.36□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 LCN8Q6JVE9 175 aa7.36□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 PLBD1Q6P4A8 553 aa7.36□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 PGM2L1Q6PCE3 622 aa7.36□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 DRAM2Q6UX65 266 aa7.36□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 BTNL3Q6UXE8 466 aa7.36□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 LRRN1Q6UXK5 716 aa7.36□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 BTN2A1Q7KYR7 527 aa7.36□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 DHFR2Q86XF0 187 aa7.36□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 ADGRG5Q8IZF4 528 aa7.36□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 OR11L1Q8NGX0 322 aa7.36□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 LRRC29Q8WV35 223 aa7.36□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 ST8SIA4Q92187 359 aa7.36□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 SPTSSAQ969W0 71 aa7.36□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 TMIGD2Q96BF3 282 aa7.36□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 REEP6Q96HR9 211 aa7.36□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 CCT8L2Q96SF2 557 aa7.36□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF747Q9BV97 191 aa7.36□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 TRIM15Q9C019 465 aa7.36□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 SIRPDQ9H106 197 aa7.36□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 FN3KRPQ9HA64 309 aa7.36□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa7.35□□□□□ -1.23
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HDAC3-211ENST00000491581 OOEPA6NGQ2 149 aa7.35□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF878C9JN71 531 aa7.35□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 H3BN98 237 aa7.35□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 H3BSH0 61 aa7.35□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 J3QW42 95 aa7.35□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 LGALS8O00214 317 aa7.35□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 CDIPTO14735 213 aa7.35□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 IDH3BO43837 385 aa7.35□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 RHBDL1O75783 438 aa7.35□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 DCTN3O75935 186 aa7.35□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 TOX4O94842 621 aa7.35□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 LHBP01229 141 aa7.35□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 MELTFP08582 738 aa7.35□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 IFNGR2P38484 337 aa7.35□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 GSK3AP49840 483 aa7.35□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 SLC25A1P53007 311 aa7.35□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 ERVFRD-1P60508 538 aa7.35□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 ECH1Q13011 328 aa7.35□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 SCGB2A2Q13296 93 aa7.35□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 GINS1Q14691 196 aa7.35□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 TIGD6Q17RP2 521 aa7.35□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 WDR82Q6UXN9 313 aa7.35□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 TIGD4Q8IY51 512 aa7.35□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 OR2T33Q8NG76 320 aa7.35□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 CANT1Q8WVQ1 401 aa7.35□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 C17orf50Q8WW18 174 aa7.35□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 HPSE2Q8WWQ2 592 aa7.35□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 NSL1Q96IY1 281 aa7.35□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 WDFY2Q96P53 400 aa7.35□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 INTS14Q96SY0 518 aa7.35□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 THTPAQ9BU02 230 aa7.35□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 REEP1Q9H902 201 aa7.35□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 SIRT7Q9NRC8 400 aa7.35□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 A6NIN4 97 aa7.34□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF850A8MQ14 1090 aa7.34□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF879B4DU55 563 aa7.34□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 PHYHO14832 338 aa7.34□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 AKR7A2O43488 359 aa7.34□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 KRT36O76013 467 aa7.34□□□□□ -1.23
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