RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490163.5

UBXN4-208, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene UBXN4, Length 3,394 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-208ENST00000490163 GLTPD2A6NH11 291 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 TCP10L2B9ZVM9 353 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 G3V2T6 193 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 SMLR1H3BR10 107 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 M0QZ92 97 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 SLC1A7O00341 560 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 PDCD5O14737 125 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 PHYHO14832 338 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 CNMDO75829 334 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 LYPLA2O95372 231 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 COX5BP10606 129 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 ATP6V1B2P21281 511 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 YWHABP31946 246 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 CA5AP35218 305 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 PLA2G5P39877 138 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 PSMD8P48556 350 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 RAB2AP61019 212 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 NTHL1P78549 312 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 ZNF33AQ06730 810 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 GTDC1Q4AE62 458 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 OR2B11Q5JQS5 317 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 THEM4Q5T1C6 240 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 AVPI1Q5T686 147 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 CYB5R2Q6BCY4 276 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 PAMR1Q6UXH9 720 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 SPAG16Q8N0X2 631 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 C19orf18Q8NEA5 215 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 OR4C15Q8NGM1 316 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 SCARB1Q8WTV0 552 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 HTR3CQ8WXA8 447 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 S100PBPQ96BU1 408 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 YIPF6Q96EC8 236 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 Q96MT0 163 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 ZNF778Q96MU6 729 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 RDH12Q96NR8 316 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 AMBNQ9NP70 447 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 RAB9BQ9NP90 201 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 SIX2Q9NPC8 291 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 CLN6Q9NWW5 311 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 DCDC2Q9UHG0 476 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 ZNF222Q9UK12 451 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 MGAT4DA6NG13 374 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 CLDN24A6NM45 220 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 GNGT2O14610 69 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 TNFSF11O14788 317 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 PLIN3O60664 434 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 ATG12O94817 140 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 ANXA3P12429 323 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 MAP2K4P45985 399 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 GNG10P50151 68 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 ATP5J2P56134 94 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 ERVPABLB-1P60509 514 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 AP1S1P61966 158 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 PRR3P79522 188 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 GLO1Q04760 184 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 CD47Q08722 323 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 C2orf80Q0P641 193 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 UNC119Q13432 240 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 ASAH1Q13510 395 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 TFDP2Q14188 446 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 MICAQ29983 383 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 LINC00303Q3SY05 128 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 PTPN20Q4JDL3 420 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 ANKRD22Q5VYY1 191 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 C22orf42Q6IC83 251 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 WDR82Q6UXN9 313 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 C10orf107Q8IVU9 208 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 RFLNBQ8N5W9 214 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 C12orf29Q8N999 325 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 CDRT4Q8N9R6 151 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 ITFG1Q8TB96 612 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 SORT1Q99523 831 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 VAT1Q99536 393 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 RSG1Q9BU20 258 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 C20orf27Q9GZN8 174 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 POPDC2Q9HBU9 364 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 CHRAC1Q9NRG0 131 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa2.35□□□□□ -2.03
UBXN4-208ENST00000490163 C19orf12Q9NSK7 152 aa2.35□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.6 ms