RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC30A2	Q9BRI3	323 aa		14.58	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	OPA3	Q9H6K4	179 aa		14.58	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	NARFL	Q9H6Q4	476 aa		14.58	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	IKZF2	Q9UKS7	526 aa		14.58	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	N6AMT1	Q9Y5N5	214 aa		14.58	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	CACNG2	Q9Y698	323 aa		14.58	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	XRCC2	O43543	280 aa		14.57	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	ENTPD6	O75354	484 aa		14.57	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	CFL1	P23528	166 aa	Known RBP	14.57	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	OPRL1	P41146	370 aa		14.57	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	GATA4	P43694	442 aa		14.57	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	14.57	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	IL18R1	Q13478	541 aa		14.57	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	PGAP1	Q75T13	922 aa		14.57	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	MRPL21	Q7Z2W9	205 aa	Known RBP	14.57	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	RHOXF1	Q8NHV9	184 aa		14.57	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	UBE2F	Q969M7	185 aa		14.57	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	OR10A2	Q9H208	303 aa		14.57	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	POFUT1	Q9H488	388 aa		14.57	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	PATZ1	Q9HBE1	687 aa	Known RBP	14.57	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	ACOD1	A6NK06	481 aa		14.56	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424		A8MXK9	166 aa		14.56	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424		E9PQ18	207 aa		14.56	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424		H0YAE9	185 aa		14.56	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	TBX1	O43435	398 aa		14.56	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	MDH2	P40926	338 aa	Known RBP	14.56	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	RIDA	P52758	137 aa	Known RBP	14.56	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	HCCS	P53701	268 aa		14.56	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	BTG1	P62324	171 aa		14.56	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	ACTC1	P68032	377 aa		14.56	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	ACTA1	P68133	377 aa		14.56	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	EGR3	Q06889	387 aa		14.56	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	TIGD6	Q17RP2	521 aa		14.56	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	FAHD2B	Q6P2I3	314 aa	Predicted RBP	14.56	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	C1QL2	Q7Z5L3	287 aa		14.56	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	KLB	Q86Z14	1044 aa		14.56	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	ENTHD1	Q8IYW4	607 aa		14.56	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF679	Q8IYX0	411 aa		14.56	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	PLPP7	Q8NBV4	271 aa		14.56	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	OR10H4	Q8NGA5	316 aa		14.56	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF418	Q8TF45	676 aa	Predicted RBP	14.56	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	FAHD2A	Q96GK7	314 aa		14.56	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	PGAM5	Q96HS1	289 aa		14.56	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	OR2V2	Q96R30	315 aa		14.56	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	ADGRL4	Q9HBW9	690 aa		14.56	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	GCM1	Q9NP62	436 aa		14.56	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM100	Q9NV29	134 aa		14.56	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	NKX1-2	Q9UD57	310 aa	Predicted RBP	14.56	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	RPL36	Q9Y3U8	105 aa	Known RBP	14.56	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424		H0YJX3	145 aa		14.55	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM178B	H3BS89	294 aa		14.55	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	KRT8	P05787	483 aa		14.55	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	PSKH1	P11801	424 aa		14.55	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	DCTD	P32321	178 aa		14.55	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	CAPG	P40121	348 aa		14.55	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	CXCR4	P61073	352 aa		14.55	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	RIPK1	Q13546	671 aa		14.55	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	SNCB	Q16143	134 aa		14.55	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF829	Q3KNS6	432 aa	Predicted RBP	14.55	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	KLHL22	Q53GT1	634 aa		14.55	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		14.55	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	OR2T2	Q6IF00	324 aa		14.55	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF322	Q6U7Q0	402 aa	Predicted RBP	14.55	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	LRRN1	Q6UXK5	716 aa		14.55	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	NAA40	Q86UY6	237 aa		14.55	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	C1orf87	Q8N0U7	546 aa		14.55	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	NANP	Q8TBE9	248 aa		14.55	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	SPRYD4	Q8WW59	207 aa	Predicted RBP	14.55	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	ITLN1	Q8WWA0	313 aa		14.55	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	RNFT2	Q96EX2	444 aa		14.55	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	SIGLEC11	Q96RL6	698 aa		14.55	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	JMJD8	Q96S16	334 aa		14.55	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	C19orf24	Q9BVV8	132 aa		14.55	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	TMPRSS13	Q9BYE2	586 aa		14.55	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	BRD7	Q9NPI1	651 aa		14.55	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	PCDHB10	Q9UN67	800 aa		14.55	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	LRP12	Q9Y561	859 aa		14.55	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	HSPE1-MOB4	S4R3N1	261 aa		14.55	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	FBN3	Q75N90	2809 aa		14.54	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	IRGM	A1A4Y4	181 aa		14.54	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	GGT3P	A6NGU5	568 aa		14.54	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	LRRC30	A6NM36	301 aa		14.54	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424		F5H0A9	414 aa	Predicted RBP	14.54	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF121	P58317	390 aa	Predicted RBP	14.54	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	ROM1	Q03395	351 aa		14.54	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	GK2	Q14410	553 aa	Predicted RBP	14.54	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	14.54	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF691	Q5VV52	312 aa		14.54	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	PLEKHG7	Q6ZR37	379 aa		14.54	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM57B	Q71RH2	274 aa		14.54	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	C8orf59	Q8N0T1	100 aa	Predicted RBP	14.54	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	SPERT	Q8NA61	448 aa		14.54	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424		Q8TCH9	128 aa		14.54	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	ITFG2	Q969R8	447 aa		14.54	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	MEGF10	Q96KG7	1140 aa		14.54	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	OR8B4	Q96RC9	309 aa		14.54	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	AMELY	Q99218	206 aa		14.54	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	ADI1	Q9BV57	179 aa		14.54	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	RGCC	Q9H4X1	137 aa		14.54	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	METTL17	Q9H7H0	456 aa	Predicted RBP	14.54	□□□□□ -0.08

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