RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 AGFG2O95081 481 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 PAHP00439 452 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 GLRA1P23415 457 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 MMP16P51512 607 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 FXYD4P59646 89 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 CAMK2BQ13554 666 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 GDPD3Q7L5L3 318 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 FJX1Q86VR8 437 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 ZPLD1Q8TCW7 415 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 SLC7A6Q92536 515 aa7.3□□□□□ -1.24
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PTPRD-211ENST00000486161 BANF2Q9H503 90 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa7.3□□□□□ -1.24
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PTPRD-211ENST00000486161 SH2D1BO14796 132 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 TFP02787 698 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF708P17019 499 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 TAS2R31P59538 309 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 LINC00114Q6XXX2 140 aa7.29□□□□□ -1.24
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PTPRD-211ENST00000486161 OR2AE1Q8NHA4 323 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 PTDSS2Q9BVG9 487 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 SLC17A2O00624 439 aa7.29□□□□□ -1.24
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PTPRD-211ENST00000486161 KLF4O43474 513 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 IGHMP01871 453 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 PCSK6P29122 969 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 ACSM1Q08AH1 577 aa7.29□□□□□ -1.24
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PTPRD-211ENST00000486161 C1orf174Q8IYL3 243 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 SHISA5Q8N114 240 aa7.29□□□□□ -1.24
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PTPRD-211ENST00000486161 ZNF519Q8TB69 540 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 ENY2Q9NPA8 101 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 A0A1B0GUH1 482 aa7.29□□□□□ -1.24
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PTPRD-211ENST00000486161 OGG1O15527 345 aa7.29□□□□□ -1.24
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PTPRD-211ENST00000486161 AKR1C4P17516 323 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 Q8IYB0 196 aa7.29□□□□□ -1.24
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PTPRD-211ENST00000486161 C10orf35Q96D05 121 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 ETAA1Q9NY74 926 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 EHFQ9NZC4 300 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 MPC1Q9Y5U8 109 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 A0A1W2PQ09 198 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 CLPSP04118 112 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 ACSM4P0C7M7 580 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 DCTDP32321 178 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 EDDM3BP56851 147 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 MAB21L1Q13394 359 aa7.29□□□□□ -1.24
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PTPRD-211ENST00000486161 SSX6Q7RTT6 188 aa7.29□□□□□ -1.24
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PTPRD-211ENST00000486161 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa7.29□□□□□ -1.24
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PTPRD-211ENST00000486161 DEPPQ9NTK1 212 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 DLL3Q9NYJ7 618 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 GNG12Q9UBI6 72 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 EPXP11678 715 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 Q0VFX4 171 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 SMIM21Q3B7S5 101 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 C2orf76Q3KRA6 126 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF554Q86TJ5 538 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 SGPP2Q8IWX5 399 aa7.28□□□□□ -1.24
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PTPRD-211ENST00000486161 UQCC2Q9BRT2 126 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 ASCL3Q9NQ33 180 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
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PTPRD-211ENST00000486161 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 SPRY3O43610 288 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 KNG1P01042 644 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 EDN3P14138 238 aa7.28□□□□□ -1.24
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PTPRD-211ENST00000486161 GDNFP39905 211 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 KIR2DS4P43632 304 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 TNK1Q13470 666 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 KIR2DS1Q14954 304 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 HYAL4Q2M3T9 481 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 BPIFB2Q8N4F0 458 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 OR2Z1Q8NG97 314 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 OR10K1Q8NGX5 313 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 ZFAND1Q8TCF1 268 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 CMBLQ96DG6 245 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 OCSTAMPQ9BR26 566 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
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