RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470953.1

VARS-222, Transcript of valyl-tRNA synthetase, human

TSL 3

Gene VARS, Length 392 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VARS-222	ENST00000470953	OR9Q1	Q8NGQ5	310 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	KLF14	Q8TD94	323 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	GIPC3	Q8TF64	312 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	SPTSSA	Q969W0	71 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	ZDHHC16	Q969W1	377 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	APOBEC3D	Q96AK3	386 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	ZNF75A	Q96N20	296 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	TSSK2	Q96PF2	358 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	DIRC2	Q96SL1	478 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	ATF6B	Q99941	703 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	GAL3ST1	Q99999	423 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	BTBD10	Q9BSF8	475 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	COPS4	Q9BT78	406 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	CHID1	Q9BWS9	393 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	TSSK6	Q9BXA6	273 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	HCAR1	Q9BXC0	346 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	PRRG3	Q9BZD7	231 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	C1orf21	Q9H246	121 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	SRA1	Q9HD15	236 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	VCX3A	Q9NNX9	186 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	TBCCD1	Q9NVR7	557 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	PTTG3P	Q9NZH4	202 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	NDUFA13	Q9P0J0	144 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	ATPIF1	Q9UII2	106 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	KCNG2	Q9UJ96	466 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	INSIG2	Q9Y5U4	225 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	hCG_2014768	A0A024R1R8	64 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	IGLV3-9	A0A075B6K5	115 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	LOC100509620	A0A075B734	347 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	TRAV40	A0A0B4J280	105 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	TCRBV5S2	A0A599	114 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	TVP23A	A6NH52	213 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	ZSCAN5B	A6NJL1	495 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953		E9PQ18	207 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953		F5H5K5	113 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953		J3QW42	95 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	GPR137B	O60478	399 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	PTP4A3	O75365	173 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	IGHV1-46	P01743	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	IGHV3-13	P01766	116 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	LCAT	P04180	440 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	MELTF	P08582	738 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	TNFRSF1A	P19438	455 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	TUBG1	P23258	451 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	HSD11B1	P28845	292 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	FMO3	P31513	532 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	GGT2	P36268	569 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	TPTE	P56180	551 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	FXYD6P3	P58550	94 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	RPS7	P62081	194 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	PAX8	Q06710	450 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	ECH1	Q13011	328 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	RBMY1F	Q15415	496 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	MICA	Q29983	383 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	FAM209A	Q5JX71	171 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	C1orf146	Q5VVC0	180 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	CFAP77	Q6ZQR2	320 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	ADGRG5	Q8IZF4	528 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	OR5AS1	Q8N127	324 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	OR6V1	Q8N148	313 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	ZSCAN4	Q8NAM6	433 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	BHLHE23	Q8NDY6	225 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	SLC26A10	Q8NG04	563 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	OR51L1	Q8NGJ5	315 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	SPRYD4	Q8WW59	207 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	SLC7A6	Q92536	515 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	CCL17	Q92583	94 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	RAB1C	Q92928	201 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	ZNF582	Q96NG8	517 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	DCLRE1C	Q96SD1	692 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	COQ7	Q99807	217 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	FUZ	Q9BT04	418 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	MSL2	Q9HCI7	577 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	TUBG2	Q9NRH3	451 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	TAS2R1	Q9NYW7	299 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	B9D1	Q9UPM9	204 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	LHFPL6	Q9Y693	200 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	IGLV1-36	A0A0B4J1U3	117 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	TMEM238L	A0A1B0GVL6	79 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	OR6C68	A6NDL8	312 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	ARRDC5	A6NEK1	342 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	GGT3P	A6NGU5	568 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	LRRC30	A6NM36	301 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	ZNF878	C9JN71	531 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953		M0R135	149 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	BHLHE40	O14503	412 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	TBX1	O43435	398 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	FKBP6	O75344	327 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	FOXH1	O75593	365 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	ATP5H	O75947	161 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	GAST	P01350	101 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	SCG5	P05408	212 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	GYPB	P06028	91 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63

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