RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466274.1

NCL-208, Transcript of nucleolin, human

TSL 2

Gene NCL, Length 671 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NCL-208	ENST00000466274	PRR18	Q8N4B5	295 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	TRIML2	Q8N7C3	387 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	PCYOX1L	Q8NBM8	494 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	FBXO25	Q8TCJ0	367 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	H1FX	Q92522	213 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	RNFT2	Q96EX2	444 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	NAPG	Q99747	312 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	HCAR1	Q9BXC0	346 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	SLC22A4	Q9H015	551 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	DPH5	Q9H2P9	285 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	SMURF2	Q9HAU4	748 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	UFSP2	Q9NUQ7	469 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	ZIM2	Q9NZV7	527 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	ZNF443	Q9Y2A4	671 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	LYVE1	Q9Y5Y7	322 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	PRSS51	A0A1B0GVH4	220 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274		A0A1W2PPH5	198 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274		A0A1W2PRG6	482 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	PSMB11	A5LHX3	300 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	TMEM247	A6NEH6	219 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	IQCF6	A8MYZ5	107 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274		M0QYG6	137 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	AZIN1	O14977	448 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	POLR3G	O15318	223 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	SLC16A6	O15403	523 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	MLNR	O43193	412 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	C1QC	P02747	245 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	BGLAP	P02818	100 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	VIM	P08670	466 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	LINC00032	P0C843	101 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	PRG2	P13727	222 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	CDA	P32320	146 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	DAP3	P51398	398 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	CRISP3	P54108	245 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	DLX1	P56177	255 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	CAV1	Q03135	178 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	MAB21L1	Q13394	359 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	MELK	Q14680	651 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	PLA1A	Q53H76	456 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	BEND6	Q5SZJ8	279 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	TEX36	Q5VZQ5	186 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	C1orf94	Q6P1W5	598 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	ANKRD46	Q86W74	232 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	ZNF695	Q8IW36	515 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	CLECL1	Q8IZS7	167 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	LSMEM1	Q8N8F7	131 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	NOXO1	Q8NFA2	376 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	OR9Q1	Q8NGQ5	310 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	OR8U1	Q8NH10	309 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	AEN	Q8WTP8	325 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	ACOT11	Q8WXI4	607 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	MALSU1	Q96EH3	234 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	ZNF347	Q96SE7	839 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	ATF6B	Q99941	703 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	SLC35A5	Q9BS91	424 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	MRPL15	Q9P015	296 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	P2RX2	Q9UBL9	471 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	SLC13A4	Q9UKG4	626 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	IGKV1D-42	A0A075B6H8	117 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	IGLV1-36	A0A0B4J1U3	117 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274		A0A1B0GWA3	101 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274		A0A1B0GWJ7	208 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	hCG_1807616	A0A1W2PRN6	198 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	DOK2	O60496	412 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	CPSF4	O95639	269 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	HLA-DPB1	P04440	258 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	HCK	P08631	526 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	MYL2	P10916	166 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	ACADS	P16219	412 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	LAP3	P28838	519 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	GRK5	P34947	590 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	NUP214	P35658	2090 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	CEBPD	P49716	269 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	ERF	P50548	548 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	RAB13	P51153	203 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	DYNLT3	P51808	116 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	ZNF133	P52736	654 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	NCALD	P61601	193 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	SCRN3	Q0VDG4	424 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	OR8G1	Q15617	311 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	MPPED2	Q15777	294 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	HHAT	Q5VTY9	493 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	PRAMEF6	Q5VXH4	476 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	ZNF429	Q86V71	674 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	C10orf111	Q8N326	155 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	COMMD1	Q8N668	190 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	FNDC5	Q8NAU1	212 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	BHLHE23	Q8NDY6	225 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	OR2T11	Q8NH01	316 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	FNDC8	Q8TC99	324 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NCL-208	ENST00000466274	NABP1	Q96AH0	204 aa		4.59	□□□□□ -1.67

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