RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	ZNF16	P17020	682 aa	Predicted RBP	15	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	DCTD	P32321	178 aa		15	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	IL5RA	Q01344	420 aa		15	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	SLC25A30	Q5SVS4	291 aa		15	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	MOGAT3	Q86VF5	341 aa		15	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	PACRGL	Q8N7B6	248 aa		15	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	OR8S1	Q8NH09	359 aa		15	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	PBOV1	Q9GZY1	135 aa		15	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	GCM1	Q9NP62	436 aa		15	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	FAM206A	Q9NX38	181 aa		15	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	14.99	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	ACOD1	A6NK06	481 aa		14.99	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	INAFM1	C9JVW0	142 aa		14.99	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	GNAL	P38405	381 aa		14.99	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	MFGE8	Q08431	387 aa	Predicted RBP	14.99	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	BCL2L15	Q5TBC7	163 aa		14.99	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	FTMT	Q8N4E7	242 aa		14.99	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		14.99	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	RHOXF1	Q8NHV9	184 aa		14.99	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	HPS1	Q92902	700 aa		14.99	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	MSI2	Q96DH6	328 aa	Known RBP	14.99	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	GAL3ST1	Q99999	423 aa		14.99	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	PAPOLG	Q9BWT3	736 aa	Known RBP	14.99	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	UFSP2	Q9NUQ7	469 aa		14.99	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	UBAP1	Q9NZ09	502 aa		14.99	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	MRM2	Q9UI43	246 aa	Known RBP	14.99	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	ZNF391	Q9UJN7	358 aa		14.99	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	NPTN	Q9Y639	398 aa		14.99	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	DAPL1	A0PJW8	107 aa		14.98	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	METTL15	A6NJ78	407 aa		14.98	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	LRRC30	A6NM36	301 aa		14.98	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902		A8MV72	311 aa	Predicted RBP	14.98	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902		H0YHG0	523 aa		14.98	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	DLGAP1	O14490	977 aa		14.98	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	PNP	P00491	289 aa		14.98	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	TGFA	P01135	160 aa		14.98	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	GRP	P07492	148 aa		14.98	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	IRF2	P14316	349 aa		14.98	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	GABRB1	P18505	474 aa		14.98	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	MMP16	P51512	607 aa		14.98	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	MZT1	Q08AG7	82 aa		14.98	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	MAB21L1	Q13394	359 aa		14.98	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	C6orf52	Q5T4I8	152 aa		14.98	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	PRAMEF6	Q5VXH4	476 aa		14.98	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	FAM220A	Q7Z4H9	259 aa		14.98	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	DHRSX	Q8N5I4	330 aa		14.98	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	OR51E1	Q8TCB6	317 aa		14.98	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		14.98	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	FAM71F1	Q96KD3	344 aa	Predicted RBP	14.98	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	LYZL4	Q96KX0	146 aa		14.98	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	SIGLEC11	Q96RL6	698 aa		14.98	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	SOX7	Q9BT81	388 aa		14.98	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	VCX	Q9H320	206 aa		14.98	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	AMBN	Q9NP70	447 aa		14.98	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	GPR84	Q9NQS5	396 aa		14.98	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	GNG8	Q9UK08	70 aa		14.98	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902		R4GMQ9	66 aa		14.98	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902		A0A0U1RQV5	110 aa		14.97	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902		A0A1B0GWJ7	208 aa		14.97	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	IFNL4	K9M1U5	179 aa		14.97	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	CLIC3	O95833	236 aa		14.97	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	CYB5R3	P00387	301 aa	Predicted RBP	14.97	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	DBT	P11182	482 aa	Known RBP	14.97	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	CD200	P41217	278 aa		14.97	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	ACTC1	P68032	377 aa		14.97	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	ACTA1	P68133	377 aa		14.97	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	ZNF91	Q05481	1191 aa		14.97	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	SNCB	Q16143	134 aa		14.97	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	TP53I3	Q53FA7	332 aa		14.97	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	OGFRL1	Q5TC84	451 aa	Predicted RBP	14.97	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	TTC23	Q5W5X9	447 aa		14.97	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	FAM166A	Q6J272	317 aa		14.97	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	KLB	Q86Z14	1044 aa		14.97	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	SPERT	Q8NA61	448 aa		14.97	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	OR11L1	Q8NGX0	322 aa		14.97	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	PIGC	Q92535	297 aa		14.97	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	MOB1A	Q9H8S9	216 aa		14.97	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	FN3KRP	Q9HA64	309 aa		14.97	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	LPAR2	Q9HBW0	351 aa		14.97	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	C14orf119	Q9NWQ9	140 aa		14.97	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	NKX1-2	Q9UD57	310 aa	Predicted RBP	14.97	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	NUFIP1	Q9UHK0	495 aa	Known RBP	14.97	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	OR52A1	Q9UKL2	312 aa		14.97	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	PCDHB10	Q9UN67	800 aa		14.97	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	RHBDD3	Q9Y3P4	386 aa		14.97	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	PCDHGB1	Q9Y5G3	927 aa		14.97	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	SNX5	Q9Y5X3	404 aa		14.97	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	WNK2	Q9Y3S1	2297 aa		14.97	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	DOCK11	Q5JSL3	2073 aa		14.96	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902		A6NLC8	198 aa		14.96	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	TMEM178B	H3BS89	294 aa		14.96	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	CASQ2	O14958	399 aa	Predicted RBP	14.96	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	SULT1C4	O75897	302 aa		14.96	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	ZNF205	O95201	554 aa		14.96	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	MAP2K3	P46734	347 aa		14.96	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	CDH15	P55291	814 aa		14.96	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	BTG1	P62324	171 aa		14.96	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	ZNF85	Q03923	595 aa		14.96	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	SLC34A1	Q06495	639 aa		14.96	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	OR8B8	Q15620	311 aa		14.96	□□□□□ -0.01

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