RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464611.1

ACTB-208, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-208ENST00000464611 OR52N4Q8NGI2 321 aa7.53□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 OR4D10Q8NGI6 311 aa7.53□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 OR52H1Q8NGJ2 320 aa7.53□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 OR51A2Q8NGJ7 313 aa7.53□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 OR5M1Q8NGP8 315 aa7.53□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 OR4K15Q8NH41 348 aa7.53□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 TMEM54Q969K7 222 aa7.53□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 SPTSSAQ969W0 71 aa7.53□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 PPP1R14AQ96A00 147 aa7.53□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 RAB3CQ96E17 227 aa7.53□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 TMEM41AQ96HV5 264 aa7.53□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 CCDC74BQ96LY2 380 aa7.53□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 OR5B2Q96R09 309 aa7.53□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 S100A13Q99584 98 aa7.53□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 SLC6A7Q99884 636 aa7.53□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 PIGQQ9BRB3 760 aa7.53□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 PDCD10Q9BUL8 212 aa7.53□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 NMES1Q9C002 83 aa7.53□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 FXYD6Q9H0Q3 95 aa7.53□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 TMEM185BQ9H7F4 350 aa7.53□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 ZNF224Q9NZL3 707 aa7.53□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 EDARQ9UNE0 448 aa7.53□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 LHFPL6Q9Y693 200 aa7.53□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa7.52□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 A0A1W2PQM1 296 aa7.52□□□□□ -1.21
ACTB-208ENST00000464611 TMEM235A6NFC5 223 aa7.52□□□□□ -1.21
ACTB-208ENST00000464611 MFSD2BA6NFX1 497 aa7.52□□□□□ -1.21
ACTB-208ENST00000464611 A8MXK9 166 aa7.52□□□□□ -1.21
ACTB-208ENST00000464611 D6RAR5 112 aa7.52□□□□□ -1.21
ACTB-208ENST00000464611 PRSS44E7EML9 344 aa7.52□□□□□ -1.21
ACTB-208ENST00000464611 EFSO43281 561 aa7.52□□□□□ -1.21
ACTB-208ENST00000464611 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
ACTB-208ENST00000464611 GDF9O60383 454 aa7.52□□□□□ -1.21
ACTB-208ENST00000464611 RAD1O60671 282 aa7.52□□□□□ -1.21
ACTB-208ENST00000464611 WDPCPO95876 746 aa7.52□□□□□ -1.21
ACTB-208ENST00000464611 CFDP00746 253 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
ACTB-208ENST00000464611 IGLV3-1P01715 115 aa7.52□□□□□ -1.21
ACTB-208ENST00000464611 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
ACTB-208ENST00000464611 NMBP08949 121 aa7.52□□□□□ -1.21
ACTB-208ENST00000464611 PET100P0DJ07 73 aa7.52□□□□□ -1.21
ACTB-208ENST00000464611 NAT2P11245 290 aa7.52□□□□□ -1.21
ACTB-208ENST00000464611 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
ACTB-208ENST00000464611 STARP49675 285 aa7.52□□□□□ -1.21
ACTB-208ENST00000464611 SSR4P51571 173 aa7.52□□□□□ -1.21
ACTB-208ENST00000464611 PRKXP51817 358 aa7.52□□□□□ -1.21
ACTB-208ENST00000464611 RAC1P63000 192 aa7.52□□□□□ -1.21
ACTB-208ENST00000464611 SORDQ00796 357 aa7.52□□□□□ -1.21
ACTB-208ENST00000464611 MC2RQ01718 297 aa7.52□□□□□ -1.21
ACTB-208ENST00000464611 PCOLCEQ15113 449 aa7.52□□□□□ -1.21
ACTB-208ENST00000464611 STK11Q15831 433 aa7.52□□□□□ -1.21
ACTB-208ENST00000464611 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
ACTB-208ENST00000464611 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa7.52□□□□□ -1.21
ACTB-208ENST00000464611 FAM27BQ5VT28 67 aa7.52□□□□□ -1.21
ACTB-208ENST00000464611 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
ACTB-208ENST00000464611 GUSBP11Q6P575 273 aa7.52□□□□□ -1.21
ACTB-208ENST00000464611 UQCC3Q6UW78 93 aa7.52□□□□□ -1.21
ACTB-208ENST00000464611 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa7.52□□□□□ -1.21
ACTB-208ENST00000464611 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa7.52□□□□□ -1.21
ACTB-208ENST00000464611 SLC16A14Q7RTX9 510 aa7.52□□□□□ -1.21
ACTB-208ENST00000464611 MDGA2Q7Z553 956 aa7.52□□□□□ -1.21
ACTB-208ENST00000464611 TMED4Q7Z7H5 227 aa7.52□□□□□ -1.21
ACTB-208ENST00000464611 GLRX5Q86SX6 157 aa7.52□□□□□ -1.21
ACTB-208ENST00000464611 PIP4P1Q86T03 277 aa7.52□□□□□ -1.21
ACTB-208ENST00000464611 BIVMQ86UB2 503 aa7.52□□□□□ -1.21
ACTB-208ENST00000464611 GALNT16Q8N428 558 aa7.52□□□□□ -1.21
ACTB-208ENST00000464611 ZNF283Q8N7M2 679 aa7.52□□□□□ -1.21
ACTB-208ENST00000464611 WDSUB1Q8N9V3 476 aa7.52□□□□□ -1.21
ACTB-208ENST00000464611 SLC38A9Q8NBW4 561 aa7.52□□□□□ -1.21
ACTB-208ENST00000464611 OR10G3Q8NGC4 313 aa7.52□□□□□ -1.21
ACTB-208ENST00000464611 OR52B4Q8NGK2 314 aa7.52□□□□□ -1.21
ACTB-208ENST00000464611 OR10S1Q8NGN2 331 aa7.52□□□□□ -1.21
ACTB-208ENST00000464611 OR13C8Q8NGS7 320 aa7.52□□□□□ -1.21
ACTB-208ENST00000464611 COQ8AQ8NI60 647 aa7.52□□□□□ -1.21
ACTB-208ENST00000464611 IFI44Q8TCB0 444 aa7.52□□□□□ -1.21
ACTB-208ENST00000464611 OR51E1Q8TCB6 317 aa7.52□□□□□ -1.21
ACTB-208ENST00000464611 PAQR8Q8TEZ7 354 aa7.52□□□□□ -1.21
ACTB-208ENST00000464611 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
ACTB-208ENST00000464611 FBXW5Q969U6 566 aa7.52□□□□□ -1.21
ACTB-208ENST00000464611 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
ACTB-208ENST00000464611 PGAM5Q96HS1 289 aa7.52□□□□□ -1.21
ACTB-208ENST00000464611 IMMP1LQ96LU5 166 aa7.52□□□□□ -1.21
ACTB-208ENST00000464611 FOXN4Q96NZ1 517 aa7.52□□□□□ -1.21
ACTB-208ENST00000464611 TECTBQ96PL2 329 aa7.52□□□□□ -1.21
ACTB-208ENST00000464611 ZPBPQ9BS86 351 aa7.52□□□□□ -1.21
ACTB-208ENST00000464611 TMEM59Q9BXS4 323 aa7.52□□□□□ -1.21
ACTB-208ENST00000464611 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
ACTB-208ENST00000464611 LPAR5Q9H1C0 372 aa7.52□□□□□ -1.21
ACTB-208ENST00000464611 OR10A2Q9H208 303 aa7.52□□□□□ -1.21
ACTB-208ENST00000464611 ZNF160Q9HCG1 818 aa7.52□□□□□ -1.21
ACTB-208ENST00000464611 RAB18Q9NP72 206 aa7.52□□□□□ -1.21
ACTB-208ENST00000464611 ZFP57Q9NU63 452 aa7.52□□□□□ -1.21
ACTB-208ENST00000464611 SDHAF2Q9NX18 166 aa7.52□□□□□ -1.21
ACTB-208ENST00000464611 KLK13Q9UKR3 277 aa7.52□□□□□ -1.21
ACTB-208ENST00000464611 TNFSF18Q9UNG2 199 aa7.52□□□□□ -1.21
ACTB-208ENST00000464611 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
ACTB-208ENST00000464611 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa7.52□□□□□ -1.21
ACTB-208ENST00000464611 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
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