RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 MMP26Q9NRE1 261 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGEF1-206ENST00000461017 UFSP2Q9NUQ7 469 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGEF1-206ENST00000461017 HIF1ANQ9NWT6 349 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM160Q9NX00 188 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM206AQ9NX38 181 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGEF1-206ENST00000461017 USE1Q9NZ43 259 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGEF1-206ENST00000461017 KCNS2Q9ULS6 477 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGEF1-206ENST00000461017 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGEF1-206ENST00000461017 ISPDA4D126 451 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGEF1-206ENST00000461017 GGT3PA6NGU5 568 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGEF1-206ENST00000461017 B4DSR2 109 aa5.87□□□□□ -1.47
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RABGEF1-206ENST00000461017 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
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RABGEF1-206ENST00000461017 GSK3AP49840 483 aa5.87□□□□□ -1.47
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RABGEF1-206ENST00000461017 POU4F2Q12837 409 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGEF1-206ENST00000461017 MALLQ13021 153 aa5.87□□□□□ -1.47
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RABGEF1-206ENST00000461017 CHRFAM7AQ494W8 412 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGEF1-206ENST00000461017 NXNL2Q5VZ03 156 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC35F2Q8IXU6 374 aa5.87□□□□□ -1.47
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RABGEF1-206ENST00000461017 CBR4Q8N4T8 237 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGEF1-206ENST00000461017 OR51G2Q8NGK0 314 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGEF1-206ENST00000461017 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM186Q96B77 213 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGEF1-206ENST00000461017 PGAM5Q96HS1 289 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGEF1-206ENST00000461017 OR8B4Q96RC9 309 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGEF1-206ENST00000461017 TBX5Q99593 518 aa5.87□□□□□ -1.47
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RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM246Q9BRR3 403 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGEF1-206ENST00000461017 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGEF1-206ENST00000461017 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
RABGEF1-206ENST00000461017 UBAP1Q9NZ09 502 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGEF1-206ENST00000461017 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
RABGEF1-206ENST00000461017 LAMP5Q9UJQ1 280 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGEF1-206ENST00000461017 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A1B0GTI1 187 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A1B0GW55 424 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
RABGEF1-206ENST00000461017 A6NIN4 97 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGEF1-206ENST00000461017 CEACAM18A8MTB9 384 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGEF1-206ENST00000461017 J3QRE1 110 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGEF1-206ENST00000461017 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
RABGEF1-206ENST00000461017 XRCC2O43543 280 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGEF1-206ENST00000461017 ENTPD6O75354 484 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGEF1-206ENST00000461017 TFF1P04155 84 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGEF1-206ENST00000461017 GRPP07492 148 aa5.86□□□□□ -1.47
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RABGEF1-206ENST00000461017 DUX4L5P0CJ88 424 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGEF1-206ENST00000461017 DUX4L6P0CJ89 424 aa5.86□□□□□ -1.47
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RABGEF1-206ENST00000461017 AMY2BP19961 511 aa5.86□□□□□ -1.47
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RABGEF1-206ENST00000461017 BTG1P62324 171 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGEF1-206ENST00000461017 CSNK2BP67870 215 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGEF1-206ENST00000461017 PAX2Q02962 417 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGEF1-206ENST00000461017 ROM1Q03395 351 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF85Q03923 595 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGEF1-206ENST00000461017 OR8B8Q15620 311 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGEF1-206ENST00000461017 TIGD6Q17RP2 521 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGEF1-206ENST00000461017 GFOD2Q3B7J2 385 aa5.86□□□□□ -1.47
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RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF684Q5T5D7 378 aa5.86□□□□□ -1.47
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RABGEF1-206ENST00000461017 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF841Q6ZN19 808 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGEF1-206ENST00000461017 RHOUQ7L0Q8 258 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGEF1-206ENST00000461017 KRT77Q7Z794 578 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF679Q8IYX0 411 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGEF1-206ENST00000461017 PQLC1Q8N2U9 271 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGEF1-206ENST00000461017 GCSAMQ8N6F7 178 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGEF1-206ENST00000461017 HPSE2Q8WWQ2 592 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGEF1-206ENST00000461017 RAB1CQ92928 201 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGEF1-206ENST00000461017 HRASLS5Q96KN8 279 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGEF1-206ENST00000461017 GAL3ST1Q99999 423 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGEF1-206ENST00000461017 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
RABGEF1-206ENST00000461017 BEX2Q9BXY8 128 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGEF1-206ENST00000461017 PBOV1Q9GZY1 135 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGEF1-206ENST00000461017 SHARPINQ9H0F6 387 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGEF1-206ENST00000461017 OR10A2Q9H208 303 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGEF1-206ENST00000461017 RASSF4Q9H2L5 321 aa5.86□□□□□ -1.47
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