RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450873.6

RABGEF1-205, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 2,281 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-205ENST00000450873 COPS3Q9UNS2 423 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGEF1-205ENST00000450873 STARD10Q9Y365 291 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGEF1-205ENST00000450873 RTTNQ86VV8 2226 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGEF1-205ENST00000450873 ROS1P08922 2347 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGEF1-205ENST00000450873 APOL3O95236 402 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGEF1-205ENST00000450873 CD8AP01732 235 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGEF1-205ENST00000450873 GCH1P30793 250 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC6A9P48067 706 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGEF1-205ENST00000450873 CXCR4P61073 352 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGEF1-205ENST00000450873 ERVS71-1P61550 626 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGEF1-205ENST00000450873 EGR3Q06889 387 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGEF1-205ENST00000450873 CDK5R2Q13319 367 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGEF1-205ENST00000450873 SWI5Q1ZZU3 235 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGEF1-205ENST00000450873 MST1LQ2TV78 715 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGEF1-205ENST00000450873 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
RABGEF1-205ENST00000450873 LAIR2Q6ISS4 152 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
RABGEF1-205ENST00000450873 LRRN1Q6UXK5 716 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF679Q8IYX0 411 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC25A40Q8TBP6 338 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGEF1-205ENST00000450873 SGCDQ92629 289 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGEF1-205ENST00000450873 LGALS12Q96DT0 336 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGEF1-205ENST00000450873 C18orf12Q96KH6 178 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGEF1-205ENST00000450873 OR8B4Q96RC9 309 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGEF1-205ENST00000450873 MMP27Q9H306 513 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGEF1-205ENST00000450873 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGEF1-205ENST00000450873 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-205ENST00000450873 IRGMA1A4Y4 181 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-205ENST00000450873 FADS2O95864 444 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-205ENST00000450873 DCTDP32321 178 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-205ENST00000450873 CX3CR1P49238 355 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-205ENST00000450873 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-205ENST00000450873 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-205ENST00000450873 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-205ENST00000450873 RAB40BQ12829 278 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-205ENST00000450873 MSMPQ1L6U9 139 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-205ENST00000450873 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-205ENST00000450873 C11orf71Q6IPW1 123 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-205ENST00000450873 NAA40Q86UY6 237 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-205ENST00000450873 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-205ENST00000450873 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-205ENST00000450873 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-205ENST00000450873 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-205ENST00000450873 OR2J1Q9GZK6 312 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-205ENST00000450873 AMBNQ9NP70 447 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-205ENST00000450873 DUSP13Q9UII6 198 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-205ENST00000450873 GPR160Q9UJ42 338 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-205ENST00000450873 IKZF2Q9UKS7 526 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-205ENST00000450873 FZR1Q9UM11 496 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-205ENST00000450873 LRP12Q9Y561 859 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-205ENST00000450873 DSCAMO60469 2012 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-205ENST00000450873 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM129A0AVI4 362 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-205ENST00000450873 J3QRE1 110 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-205ENST00000450873 OVOL3O00110 214 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-205ENST00000450873 RIDAP52758 137 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-205ENST00000450873 CSNK2BP67870 215 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-205ENST00000450873 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-205ENST00000450873 MALLQ13021 153 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-205ENST00000450873 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-205ENST00000450873 SPATA46Q5T0L3 261 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-205ENST00000450873 ACBD7Q8N6N7 88 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-205ENST00000450873 POC5Q8NA72 575 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-205ENST00000450873 TBX5Q99593 518 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-205ENST00000450873 SYT3Q9BQG1 590 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-205ENST00000450873 TPRKBQ9Y3C4 175 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-205ENST00000450873 PLCE1Q9P212 2302 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-205ENST00000450873 DAPL1A0PJW8 107 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-205ENST00000450873 ACOD1A6NK06 481 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-205ENST00000450873 CENPXA8MT69 81 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-205ENST00000450873 CCNKO75909 580 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-205ENST00000450873 IGHV3-13P01766 116 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-205ENST00000450873 CFL1P23528 166 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF45Q02386 682 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-205ENST00000450873 FBXW12Q6X9E4 464 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-205ENST00000450873 LRP11Q86VZ4 500 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-205ENST00000450873 OR52H1Q8NGJ2 320 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-205ENST00000450873 MCFD2Q8NI22 146 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-205ENST00000450873 SNX33Q8WV41 574 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-205ENST00000450873 HAVCR1Q96D42 359 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-205ENST00000450873 DUSP21Q9H596 190 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-205ENST00000450873 ABCB10Q9NRK6 738 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-205ENST00000450873 INPP5EQ9NRR6 644 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-205ENST00000450873 PTTG3PQ9NZH4 202 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-205ENST00000450873 METTL15A6NJ78 407 aa9.07□□□□□ -0.96
RABGEF1-205ENST00000450873 PRR32B1ATL7 298 aa9.07□□□□□ -0.96
RABGEF1-205ENST00000450873 PSMD9O00233 223 aa9.07□□□□□ -0.96
RABGEF1-205ENST00000450873 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
RABGEF1-205ENST00000450873 RAC2P15153 192 aa9.07□□□□□ -0.96
RABGEF1-205ENST00000450873 PAX1P15863 534 aa9.07□□□□□ -0.96
RABGEF1-205ENST00000450873 PRKACAP17612 351 aa9.07□□□□□ -0.96
RABGEF1-205ENST00000450873 MPV17P39210 176 aa9.07□□□□□ -0.96
RABGEF1-205ENST00000450873 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF404Q494X3 552 aa9.07□□□□□ -0.96
RABGEF1-205ENST00000450873 UBE2UQ5VVX9 321 aa9.07□□□□□ -0.96
RABGEF1-205ENST00000450873 STEAP3Q658P3 488 aa9.07□□□□□ -0.96
RABGEF1-205ENST00000450873 SSX6Q7RTT6 188 aa9.07□□□□□ -0.96
RABGEF1-205ENST00000450873 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa9.07□□□□□ -0.96
RABGEF1-205ENST00000450873 RFLNBQ8N5W9 214 aa9.07□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.3 ms