RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449058.6

TOM1-210, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOM1, Length 2,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOM1-210	ENST00000449058	EIF3I	Q13347	325 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	TUSC1	Q2TAM9	212 aa		14.92	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	BVES	Q8NE79	360 aa		14.92	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	FBXW5	Q969U6	566 aa		14.92	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	TMEM59	Q9BXS4	323 aa		14.92	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	SIT1	Q9Y3P8	196 aa		14.92	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	NCOA6	Q14686	2063 aa	Predicted RBP	14.92	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	IGHV1-45	A0A0A0MS14	117 aa		14.92	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	RNF222	A6NCQ9	220 aa		14.92	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	DBX1	A6NMT0	343 aa		14.92	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	BCL2L11	O43521	198 aa		14.92	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	GDF9	O60383	454 aa		14.92	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	HCK	P08631	526 aa		14.92	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	NR2C1	P13056	603 aa		14.92	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF133	P52736	654 aa	Predicted RBP	14.92	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	IL11RA	Q14626	422 aa		14.92	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	PNLIPRP3	Q17RR3	467 aa		14.92	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	MICB	Q29980	383 aa		14.92	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	VAX1	Q5SQQ9	334 aa		14.92	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	C10orf128	Q5T292	105 aa		14.92	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	NTNG2	Q96CW9	530 aa		14.92	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	TMEM41A	Q96HV5	264 aa		14.92	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	PPA2	Q9H2U2	334 aa		14.92	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	BANF2	Q9H503	90 aa		14.92	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	RASL12	Q9NYN1	266 aa		14.92	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	MED12	Q93074	2177 aa		14.91	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	AVPR2	P30518	371 aa		14.91	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	FAM189A2	Q15884	450 aa		14.91	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	SGCA	Q16586	387 aa		14.91	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	FOXL2NB	Q6ZUU3	175 aa		14.91	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	ACOT7L	Q6ZUV0	252 aa		14.91	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	MARCH1	Q8TCQ1	289 aa		14.91	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	TMEM54	Q969K7	222 aa		14.91	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	IMMP1L	Q96LU5	166 aa		14.91	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	14.91	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	PILRB	Q9UKJ0	227 aa		14.91	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058		A0A1W2PP11	408 aa		14.91	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	KANTR	A0A1W2PQU2	76 aa		14.91	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	C5orf63	A6NC05	138 aa		14.91	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	CEACAM18	A8MTB9	384 aa		14.91	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	MFNG	O00587	321 aa		14.91	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	RAD51D	O75771	328 aa		14.91	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	UMOD	P07911	640 aa		14.91	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	AKR1C4	P17516	323 aa		14.91	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	MSR1	P21757	451 aa		14.91	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	VAMP1	P23763	118 aa		14.91	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	TAS2R31	P59538	309 aa		14.91	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	LRRC37A5P	Q49AS3	106 aa		14.91	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	ACTBL2	Q562R1	376 aa		14.91	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		14.91	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	OPN5	Q6U736	354 aa		14.91	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		14.91	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	TERB2	Q8NHR7	220 aa		14.91	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	LYZL4	Q96KX0	146 aa		14.91	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	OCSTAMP	Q9BR26	566 aa		14.91	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	ANGPTL4	Q9BY76	406 aa		14.91	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	SHARPIN	Q9H0F6	387 aa		14.91	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF700	Q9H0M5	742 aa		14.91	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058		D6RAR5	112 aa		14.9	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	PRF1	P14222	555 aa		14.9	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	CSNK1A1	P48729	337 aa		14.9	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	ENDOG	Q14249	297 aa	Known RBP	14.9	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		14.9	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	PHYHD1	Q5SRE7	291 aa		14.9	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	PMS2CL	Q68D20	193 aa		14.9	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	FAM89B	Q8N5H3	189 aa		14.9	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	ARRDC1	Q8N5I2	433 aa		14.9	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	RELL2	Q8NC24	303 aa	Predicted RBP	14.9	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	CASTOR1	Q8WTX7	329 aa		14.9	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	PROK2	Q9HC23	129 aa		14.9	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	COQ3	Q9NZJ6	369 aa		14.9	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	HOXD11	P31277	338 aa	Predicted RBP	14.9	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	DLST	P36957	453 aa		14.9	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	ALDH3B1	P43353	468 aa		14.9	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	ECH1	Q13011	328 aa		14.9	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	IFI44	Q8TCB0	444 aa		14.9	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	NABP1	Q96AH0	204 aa		14.9	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	PGAM5	Q96HS1	289 aa		14.9	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	GPER1	Q99527	375 aa		14.9	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	NELFA	Q9H3P2	528 aa		14.9	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	GAREM1	Q9H706	876 aa		14.9	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	KIAA1549	Q9HCM3	1950 aa		14.89	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	TEX46	H3BTG2	121 aa		14.89	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	LGALS8	O00214	317 aa		14.89	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	CRTAP	O75718	401 aa	Predicted RBP	14.89	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	COX6A1	P12074	109 aa		14.89	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	LIF	P15018	202 aa		14.89	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	HIST1H3A	P68431	136 aa		14.89	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	EXT1	Q16394	746 aa		14.89	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	HIST2H3PS2	Q5TEC6	136 aa		14.89	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	HIST2H3A	Q71DI3	136 aa		14.89	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	14.89	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	GJC3	Q8NFK1	279 aa		14.89	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	PXT1	Q8NFP0	134 aa		14.89	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	ARHGAP5-AS1	Q96IT6	56 aa		14.89	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	CYYR1	Q96J86	154 aa		14.89	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	URM1	Q9BTM9	101 aa	Known RBP	14.89	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	EXOSC5	Q9NQT4	235 aa	Known RBP eCLIP	14.89	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	GPR160	Q9UJ42	338 aa		14.89	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058		A0A0U1RQV5	110 aa		14.89	□□□□□ -0.03

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