RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435991.2

TRAPPC13P1-201, Transcript of trafficking protein particle complex 13 pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene TRAPPC13P1, Length 1,062 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PDFQ9HBH1 243 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 A0A1B0GTI1 187 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 A0A1B0GW15 77 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SC5DO75845 299 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 BCHEP06276 602 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PRPS2P11908 318 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 IL12BP29460 328 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GNRHRP30968 328 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 HOXA9P31269 272 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CDKN2DP55273 166 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RTL4Q6ZR62 310 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FAM92BQ6ZTR7 304 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NKAIN4Q8IVV8 208 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ARRDC1Q8N5I2 433 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MDS2Q8NDY4 140 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 BMFQ96LC9 184 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CYTH2Q99418 400 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 HMG20AQ9NP66 347 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PLSCR3Q9NRY6 295 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RAB23Q9ULC3 237 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 KLF12Q9Y4X4 402 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa3.38□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa3.38□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 H0Y9J4 135 aa3.38□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TCAPO15273 167 aa3.38□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 P01737 135 aa3.38□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 THRAP10827 490 aa3.38□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZNF17P17021 662 aa3.38□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RPS9P46781 194 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZNF136P52737 540 aa3.38□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MLF1P58340 268 aa3.38□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MTPNP58546 118 aa3.38□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TAS2R46P59540 309 aa3.38□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 IFFO1Q0D2I5 559 aa3.38□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NAB1Q13506 487 aa3.38□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 OR1Q1Q15612 314 aa3.38□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TNXAQ16473 311 aa3.38□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NDUFAF6Q330K2 333 aa3.38□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FAM27D1Q5T7N8 215 aa3.38□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 LRRC8AQ8IWT6 810 aa3.38□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PIFOQ8TCI5 191 aa3.38□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 IFT81Q8WYA0 676 aa3.38□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ING5Q8WYH8 240 aa3.38□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 OR51B5Q9H339 312 aa3.38□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZNF442Q9H7R0 627 aa3.38□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NOX3Q9HBY0 568 aa3.38□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RMND1Q9NWS8 449 aa3.38□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GOLGA8IPA6NC78 632 aa3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 F8VP50 259 aa3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 LINC01619G3V211 115 aa3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RP2O75695 350 aa3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SLC22A5O76082 557 aa3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GIMD1P0DJR0 217 aa3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 IGHV1-8P0DP01 117 aa3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 APLNRP35414 380 aa3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 LHX2P50458 406 aa3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 UBE2E1P51965 193 aa3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RESP18Q5W5W9 173 aa3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CYB5R2Q6BCY4 276 aa3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZNF584Q8IVC4 421 aa3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 UBE2E2Q96LR5 201 aa3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZFP3Q96NJ6 502 aa3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CATSPER2Q96P56 530 aa3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MED10Q9BTT4 135 aa3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SFXN3Q9BWM7 321 aa3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NDEL1Q9GZM8 345 aa3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ARV1Q9H2C2 271 aa3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PRORYQ9H606 182 aa3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SLC40A1Q9NP59 571 aa3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 OR2S2Q9NQN1 319 aa3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NECAP2Q9NVZ3 263 aa3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RHBDL2Q9NX52 303 aa3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SIGLEC9Q9Y336 463 aa3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FADS3Q9Y5Q0 445 aa3.37□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.7 ms