RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 ADIPOR1Q96A54 375 aa8.85□□□□□ -0.99
HERC3-202ENST00000402738 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
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HERC3-202ENST00000402738 CDRT15L2A8MXV6 281 aa8.85□□□□□ -0.99
HERC3-202ENST00000402738 MFNGO00587 321 aa8.85□□□□□ -0.99
HERC3-202ENST00000402738 SPINK4O60575 86 aa8.85□□□□□ -0.99
HERC3-202ENST00000402738 CRHP06850 196 aa8.85□□□□□ -0.99
HERC3-202ENST00000402738 GUSBP08236 651 aa8.85□□□□□ -0.99
HERC3-202ENST00000402738 CCKARP32238 428 aa8.85□□□□□ -0.99
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HERC3-202ENST00000402738 CEBPEQ15744 281 aa8.85□□□□□ -0.99
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HERC3-202ENST00000402738 MYEOVQ96EZ4 313 aa8.85□□□□□ -0.99
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HERC3-202ENST00000402738 C20orf141Q9NUB4 165 aa8.85□□□□□ -0.99
HERC3-202ENST00000402738 RARRES3Q9UL19 164 aa8.85□□□□□ -0.99
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HERC3-202ENST00000402738 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
HERC3-202ENST00000402738 UBE3DQ7Z6J8 389 aa8.84□□□□□ -0.99
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HERC3-202ENST00000402738 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
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HERC3-202ENST00000402738 CCDC74AQ96AQ1 378 aa8.84□□□□□ -0.99
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HERC3-202ENST00000402738 DAPP1Q9UN19 280 aa8.84□□□□□ -0.99
HERC3-202ENST00000402738 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
HERC3-202ENST00000402738 SHROOM3Q8TF72 1996 aa8.84□□□□□ -0.99
HERC3-202ENST00000402738 HSPB2A8KAH6 182 aa8.84□□□□□ -0.99
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HERC3-202ENST00000402738 HS3ST1O14792 307 aa8.84□□□□□ -0.99
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HERC3-202ENST00000402738 OR5C1Q8NGR4 320 aa8.84□□□□□ -0.99
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HERC3-202ENST00000402738 SIGLEC7Q9Y286 467 aa8.84□□□□□ -0.99
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HERC3-202ENST00000402738 FAM24AA6NFZ4 105 aa8.84□□□□□ -0.99
HERC3-202ENST00000402738 SEMG1P04279 462 aa8.84□□□□□ -0.99
HERC3-202ENST00000402738 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP8.84□□□□□ -0.99
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HERC3-202ENST00000402738 FAM78BQ5VT40 261 aa8.84□□□□□ -0.99
HERC3-202ENST00000402738 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
HERC3-202ENST00000402738 KIRREL2Q6UWL6 708 aa8.84□□□□□ -0.99
HERC3-202ENST00000402738 DPPA3Q6W0C5 159 aa8.84□□□□□ -0.99
HERC3-202ENST00000402738 MISPQ8IVT2 679 aa8.84□□□□□ -0.99
HERC3-202ENST00000402738 GJC3Q8NFK1 279 aa8.84□□□□□ -0.99
HERC3-202ENST00000402738 DTD1Q8TEA8 209 aa8.84□□□□□ -0.99
HERC3-202ENST00000402738 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
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HERC3-202ENST00000402738 KCND3Q9UK17 655 aa8.84□□□□□ -0.99
HERC3-202ENST00000402738 CXorf65A6NEN9 183 aa8.83□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 ZNF814B7Z6K7 855 aa8.83□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 SEMA4FO95754 770 aa8.83□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 ZNF17P17021 662 aa8.83□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 CD22P20273 847 aa8.83□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 CD81P60033 236 aa8.83□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 TGFBR3Q03167 851 aa8.83□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 WDR38Q5JTN6 314 aa8.83□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa8.83□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 OR51F2Q8NH61 342 aa8.83□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 RNF24Q9Y225 148 aa8.83□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 PAM16Q9Y3D7 125 aa8.83□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 H3BNC9 293 aa8.83□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 ANKRD34CP0C6C1 535 aa8.83□□□□□ -1
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