RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353258.7

GDE1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDE1, Length 2,958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-201ENST00000353258 NNATQ16517 81 aa14.96□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 POC1AQ8NBT0 407 aa14.96□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 MR1Q95460 341 aa14.96□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 LURAP1Q96LR2 239 aa14.96□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 TNFP01375 233 aa14.95□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 FSTP19883 344 aa14.95□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 MAS1LP35410 378 aa14.95□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 DNASE1L1P49184 302 aa14.95□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 ZNF74Q16587 644 aa14.95□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 SPNS3Q6ZMD2 512 aa14.95□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 C2orf50Q96LR7 162 aa14.95□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 CYP8B1Q9UNU6 501 aa14.95□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 A0A0J9YY10 115 aa14.95□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 CSTAP01040 98 aa14.95□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 ERV3-1Q14264 604 aa14.95□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 GFI1BQ5VTD9 330 aa14.95□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 ZNF529Q6P280 563 aa14.95□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 OR13C9Q8NGT0 318 aa14.95□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 OR4K15Q8NH41 348 aa14.95□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 TERB2Q8NHR7 220 aa14.95□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 TCTN2Q96GX1 697 aa14.95□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 LPAR4Q99677 370 aa14.95□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 LYRM4Q9HD34 91 aa14.95□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 KCNJ16Q9NPI9 418 aa14.95□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 FBXO7Q9Y3I1 522 aa14.95□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 LRP4O75096 1905 aa14.95□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 HRKO00198 91 aa14.94□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 RENP00797 406 aa14.94□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 SFTPBP07988 381 aa14.94□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 OR13C7P0DN81 318 aa14.94□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 DRD1P21728 446 aa14.94□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 FHITP49789 147 aa14.94□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 ZNF84P51523 738 aa14.94□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 CHAF1BQ13112 559 aa14.94□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 HIST2H3AQ71DI3 136 aa14.94□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 ZNF679Q8IYX0 411 aa14.94□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 OR2I1PQ8NGU4 316 aa14.94□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 S100A13Q99584 98 aa14.94□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 SEC16AO15027 2179 aa14.94□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 B4DGG1 531 aa14.94□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 F10P00742 488 aa14.94□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 PKIAP61925 76 aa14.94□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 LSM6P62312 80 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 RAB1AP62820 205 aa14.94□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 TDGQ13569 410 aa14.94□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 C14orf28Q4W4Y0 310 aa14.94□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 AVL9Q8NBF6 648 aa14.94□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 TMEM104Q8NE00 496 aa14.94□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 OR13C3Q8NGS6 347 aa14.94□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 MISP3Q96FF7 219 aa14.94□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 GPR61Q9BZJ8 451 aa14.94□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP14.94□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 ZNF726A6NNF4 738 aa14.94□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 TSTD3H0UI37 97 aa14.94□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 LMX1BO60663 402 aa14.94□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 JTBO76095 146 aa14.94□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 IGHV4-34P06331 123 aa14.94□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 SPARCP09486 303 aa14.94□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 RPL12P30050 165 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 SPEM2Q0P670 501 aa14.94□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 UNC119Q13432 240 aa14.94□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 Q6ZS52 159 aa14.94□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 PTX4Q96A99 478 aa14.94□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 RAB22AQ9UL26 194 aa14.94□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 GPR132Q9UNW8 380 aa14.94□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 SEC14L6B5MCN3 397 aa14.93□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 K7EPK0 472 aa14.93□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 CD37P11049 281 aa14.93□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 CTSEP14091 401 aa14.93□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 FCGR2CP31995 323 aa14.93□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 THBS4P35443 961 aa14.93□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 YPEL5P62699 121 aa14.93□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 HHEXQ03014 270 aa14.93□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 ZNF674Q2M3X9 581 aa14.93□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 C1orf100Q5SVJ3 147 aa14.93□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa14.93□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 ZNF610Q8N9Z0 462 aa14.93□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 GPBAR1Q8TDU6 330 aa14.93□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 SMOC1Q9H4F8 434 aa14.93□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 PISDQ9UG56 409 aa14.93□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 KIF26BQ2KJY2 2108 aa14.93□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 MEGF11A6BM72 1044 aa14.93□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 TXNDC12O95881 172 aa14.93□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 CASP6P55212 293 aa14.93□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 TMEM33P57088 247 aa14.93□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 SLC26A5P58743 744 aa14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.6 ms