RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 Q6ZT83 130 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 Q8N402 240 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 MRI1Q9BV20 369 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 OR10A2Q9H208 303 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 ABCG5Q9H222 651 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 NEK6Q9HC98 313 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM138Q9NPI0 162 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 MEGF11A6BM72 1044 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 CGAP01215 116 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 TPOP07202 933 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 BDKRB2P30411 391 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 EFNB2P52799 333 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 TBRG1Q3YBR2 411 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 C1orf100Q5SVJ3 147 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 GLT8D1Q68CQ7 371 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 OR2A2Q6IF42 318 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 CD163Q86VB7 1156 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 OR4D6Q8NGJ1 314 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 OR6K3Q8NGY3 331 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 STARD4Q96DR4 205 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 FAHP16930 419 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF20P17024 532 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 HTR2CP28335 458 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 TALDO1P37837 337 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 POU3F4P49335 361 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 C2orf76Q3KRA6 126 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 CRIP3Q6Q6R5 217 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 C3P1Q6ZMU1 363 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 NKAIN3Q8N8D7 197 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 SYNPRQ8TBG9 265 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 SSC4DQ8WTU2 575 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM3DQ96BQ1 224 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 MS4A3Q96HJ5 214 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 REEP6Q96HR9 211 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 CNTD2Q9H8S5 307 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 ETV7Q9Y603 341 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 SULT1B1O43704 296 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 LANCL1O43813 399 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 SSX4O60224 188 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 WDR1O75083 606 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 LYZL6O75951 148 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 COX5BP10606 129 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 RAB3AP20336 220 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 STOMP27105 288 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 ARR3P36575 388 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 SCAND1P57086 179 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 TSC22D1Q15714 1073 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 RAB11BQ15907 218 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 IZUMO1Q8IYV9 350 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 GABRG1Q8N1C3 465 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 JAGN1Q8N5M9 183 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM122AQ96E09 287 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 POM121L2Q96KW2 1035 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 SPACA5Q96QH8 159 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 NBEAQ8NFP9 2946 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 RAD51DO75771 328 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 CCNKO75909 580 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 HLA-DQB1P01920 261 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 GABRA1P14867 456 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 COX5AP20674 150 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF92Q03936 586 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 UBE2V2Q15819 145 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 PGAP1Q75T13 922 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 OR6M1Q8NGM8 313 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM57AQ8TBR7 257 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 HAVCR1Q96D42 359 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 PIGLQ9Y2B2 252 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 C5orf49A4QMS7 147 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 LDLRAD4O15165 306 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 UBL3O95164 117 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 CRYZL1O95825 349 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 TAB1Q15750 504 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 GABRA6Q16445 453 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 GSG1Q2KHT4 349 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 MDP1Q86V88 176 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 BEX2Q9BXY8 128 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 PLEKHA1Q9HB21 404 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 SPEF1Q9Y4P9 236 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 ATRXP46100 2492 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A1W2PR80 420 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 PLA2G10O15496 165 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 SPNP16150 400 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 CCNOP22674 350 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 ART1P52961 327 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM3AP98173 230 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 C1orf185Q5T7R7 199 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 PYHIN1Q6K0P9 492 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 GDPD3Q7L5L3 318 aa8.1□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.8 ms