RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233072.9

CPS1-201, Transcript of carbamoyl-phosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CPS1, Length 5,821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1-201ENST00000233072 FGF2P09038 288 aa6.51□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 SULT1A3P0DMM9 295 aa6.51□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 SULT1A4P0DMN0 295 aa6.51□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 SPP1P10451 314 aa6.51□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 C21orf58P58505 322 aa6.51□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 CCL7P80098 99 aa6.51□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 BAMBIQ13145 260 aa6.51□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 OR4C5Q8NGB2 326 aa6.51□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 OTOSQ8NHW6 89 aa6.51□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 C14orf79Q96F83 325 aa6.51□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 TMEM56Q96MV1 263 aa6.51□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 CXCL16Q9H2A7 254 aa6.51□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 FBXO34Q9NWN3 711 aa6.51□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 A0A0B4J2E0 115 aa6.51□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 A0A1B0GX12 115 aa6.51□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 HMX2A2RU54 273 aa6.51□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 CXCL13O43927 109 aa6.51□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 GUSBP08236 651 aa6.51□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 STAG3L2P0CL84 134 aa6.51□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 OR13C7P0DN81 318 aa6.51□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 SLC25A6P12236 298 aa6.51□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 RPL11P62913 178 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 TOR2AQ5JU69 321 aa6.51□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 DEGS2Q6QHC5 323 aa6.51□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 SUMF1Q8NBK3 374 aa6.51□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 SMIM4Q8WVI0 70 aa6.51□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 CLDN23Q96B33 292 aa6.51□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 TMEM18Q96B42 140 aa6.51□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 OR8B4Q96RC9 309 aa6.51□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 TPPP3Q9BW30 176 aa6.51□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 HES4Q9HCC6 221 aa6.51□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 COL18A1P39060 1754 aa6.51□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 SLC17A2O00624 439 aa6.51□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 LRP3O75074 770 aa6.51□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 NKX2-2O95096 273 aa6.51□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 MYOGP15173 224 aa6.51□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 GNB2P62879 340 aa6.51□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 OR1C1Q15619 314 aa6.51□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 GSG1Q2KHT4 349 aa6.51□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 C11orf91Q3C1V1 193 aa6.51□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 ADAM5Q6NVV9 412 aa6.51□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 CD300LDQ6UXZ3 194 aa6.51□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa6.51□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 OR52N4Q8NGI2 321 aa6.51□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 OR10Z1Q8NGY1 313 aa6.51□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 ROBO4Q8WZ75 1007 aa6.51□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 C10orf35Q96D05 121 aa6.51□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 SIGLEC11Q96RL6 698 aa6.51□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 FOXB1Q99853 325 aa6.51□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 NRSN2Q9GZP1 204 aa6.51□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 OR6C68A6NDL8 312 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 NXPH3O95157 252 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 PRR35P0CG20 571 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 GABRB1P18505 474 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 FGF7P21781 194 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 SSPNQ14714 243 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 CORO6Q6QEF8 472 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 CRLF2Q9HC73 371 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 ANKRD10Q9NXR5 420 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 LRRC3CA6NJW4 275 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 CIDEAO60543 219 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 AQP8O94778 261 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 OR5H8P0DN80 308 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 APEHP13798 732 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 HRH1P35367 487 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 HAAOP46952 286 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 EMP3P54852 163 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 PJVKQ0ZLH3 352 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 PRSS45Q7RTY3 260 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 ANKRD37Q7Z713 158 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 ZNF561Q8N587 486 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 OR4S1Q8NGB4 309 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 WDFY2Q96P53 400 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 GSX2Q9BZM3 304 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 AKIP1Q9NQ31 210 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 A4GNTQ9UNA3 340 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 SLC22A13Q9Y226 551 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 SLC2A10O95528 541 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 FABP5Q01469 135 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 MYBPHQ13203 477 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 ZNF766Q5HY98 468 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 OR2A1Q8NGT9 310 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 OR2G2Q8NGZ5 317 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 GPBAR1Q8TDU6 330 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 DOK1Q99704 481 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 NMES1Q9C002 83 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 IL21Q9HBE4 155 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 DLEC1Q9Y238 1755 aa6.5□□□□□ -1.37
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