RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 ERGIC1Q969X5 290 aa13.33□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 ASB9Q96DX5 294 aa13.33□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 COG8Q96MW5 612 aa13.33□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 RBP7Q96R05 134 aa13.33□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 WNT10AQ9GZT5 417 aa13.33□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 MUC13Q9H3R2 512 aa13.33□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 ONECUT1Q9UBC0 465 aa13.33□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa13.33□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 EFCAB9A8MZ26 197 aa13.32□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 DVL1O14640 695 aa13.32□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 HLA-DPB1P04440 258 aa13.32□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 IFNW1P05000 195 aa13.32□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 LMO1P25800 156 aa13.32□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 GPR4P46093 362 aa13.32□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 SLC9A3P48764 834 aa13.32□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 SLC34A1Q06495 639 aa13.32□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 ANKDD1AQ495B1 522 aa13.32□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 ZFP1Q6P2D0 407 aa13.32□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 SYT9Q86SS6 491 aa13.32□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 FGFRL1Q8N441 504 aa13.32□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 RNF148Q8N7C7 305 aa13.32□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 Q8N7P7 452 aa13.32□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa13.32□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 DTX3Q8N9I9 347 aa13.32□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 LZICQ8WZA0 190 aa13.32□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 FNDC11Q9BVV2 318 aa13.32□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 EMC7Q9NPA0 242 aa13.32□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 INPP5EQ9NRR6 644 aa13.32□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 C12orf71A8MTZ7 269 aa13.31□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 IQCF6A8MYZ5 107 aa13.31□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 NME4O00746 187 aa13.31□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 DOK2O60496 412 aa13.31□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 GMNNO75496 209 aa13.31□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 BAG2O95816 211 aa13.31□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 PF4P02776 101 aa13.31□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 HSD17B1P14061 328 aa13.31□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 FAHP16930 419 aa13.31□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 IFNA8P32881 189 aa13.31□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 HTR5AP47898 357 aa13.31□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 CD83Q01151 205 aa13.31□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 LIPEQ05469 1076 aa13.31□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 MPPED2Q15777 294 aa13.31□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa13.31□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa13.31□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 TBPL2Q6SJ96 375 aa13.31□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa13.31□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 CBLL1Q75N03 491 aa13.31□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 SPATA24Q86W54 205 aa13.31□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 BHLHE23Q8NDY6 225 aa13.31□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 RORBQ92753 470 aa13.31□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 AJUBAQ96IF1 538 aa13.31□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 Q96M85 177 aa13.31□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 DDOQ99489 341 aa13.31□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 FAM234AQ9H0X4 552 aa13.31□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 S100A14Q9HCY8 104 aa13.31□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 UFSP2Q9NUQ7 469 aa13.31□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 ABCD2Q9UBJ2 740 aa13.31□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 DNAJB11Q9UBS4 358 aa13.31□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 CD300AQ9UGN4 299 aa13.31□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 CXCR6O00574 342 aa13.3□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 NDUFA2O43678 99 aa13.3□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 ANGPTL7O43827 346 aa13.3□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 CD14P08571 375 aa13.3□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 CTLA4P16410 223 aa13.3□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 CD200P41217 278 aa13.3□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 ACSM1Q08AH1 577 aa13.3□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 IFI44LQ53G44 452 aa13.3□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 C1orf94Q6P1W5 598 aa13.3□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF730Q6ZMV8 503 aa13.3□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa13.3□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 DHFR2Q86XF0 187 aa13.3□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 ST8SIA4Q92187 359 aa13.3□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 SLC7A6Q92536 515 aa13.3□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 DPF1Q92782 380 aa13.3□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 HSH2DQ96JZ2 352 aa13.3□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 VCX3BQ9H321 246 aa13.3□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 PTTG3PQ9NZH4 202 aa13.3□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 RNF7Q9UBF6 113 aa13.3□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa13.29□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 PRSS37A4D1T9 235 aa13.29□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 OOEPA6NGQ2 149 aa13.29□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 J3QW42 95 aa13.29□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 IMPA2O14732 288 aa13.29□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF682O95780 498 aa13.29□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 GYPAP02724 150 aa13.29□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 LYL1P12980 280 aa13.29□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 FPR3P25089 353 aa13.29□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 RGS6P49758 472 aa13.29□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 GSK3BP49841 420 aa13.29□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 UBE2E1P51965 193 aa13.29□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 FXYD6P3P58550 94 aa13.29□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 SCRN3Q0VDG4 424 aa13.29□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 OR8B8Q15620 311 aa13.29□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 AANATQ16613 207 aa13.29□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 OTPQ5XKR4 325 aa13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.6 ms