RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019982.8

Gtf3c6-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c6, Length 887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr215Q8VF82 310 aa9.52□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr483Q8VG05 315 aa9.52□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr676Q8VGZ9 317 aa9.52□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc2a10Q8VHD6 536 aa9.52□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dtnbp1Q91WZ8 352 aa9.52□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Catsper1Q91ZR5 686 aa9.52□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Prmt3Q922H1 532 aa9.52□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pwp1Q99LL5 501 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fars2Q99M01 451 aa9.52□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mcts2Q9CQ21 181 aa9.52□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rnf151Q9CQ29 239 aa9.52□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 4933400A11RikQ9CR52 288 aa9.52□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pgm3Q9CYR6 542 aa9.52□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Borcs8Q9D6Y4 120 aa9.52□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ppp1r35Q9D8C8 260 aa9.52□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr934Q9EQ87 310 aa9.52□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc6a14Q9JMA9 638 aa9.52□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Adh4Q9QYY9 377 aa9.52□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fbxo15Q9QZN0 433 aa9.52□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Syt9Q9R0N9 491 aa9.52□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Igkv4-80A0A075B5L7 116 aa9.51□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp433A0A0J9YUD4 600 aa9.51□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rpl13a-ps1A0A140T8K2 203 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PvrigA0A1B0GS01 234 aa9.51□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr560A0A1B0GSU5 314 aa9.51□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm32687A0A1W2P6H7 600 aa9.51□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Aadacl2B2RWD2 401 aa9.51□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr623E9Q382 317 aa9.51□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gpr31F8VQN3 319 aa9.51□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cyp2j8G3UZ38 503 aa9.51□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1360K9J6X0 313 aa9.51□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Psmc3ipO35047 217 aa9.51□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cacng2O88602 323 aa9.51□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mup4P11590 178 aa9.51□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rps6ka3P18654 740 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hnf1aP22361 628 aa9.51□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Taf1aP97357 453 aa9.51□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm10645Q3UPY1 145 aa9.51□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Q5EBG8 199 aa9.51□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 SctrQ5FWI2 447 aa9.51□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Actr3bQ641P0 418 aa9.51□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1359Q7TQU5 313 aa9.51□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1101Q7TR59 310 aa9.51□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rcn3Q8BH97 328 aa9.51□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dmrta1Q8CFG4 490 aa9.51□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Snapc1Q8K0S9 389 aa9.51□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn1r30Q8R2D2 302 aa9.51□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Grk5Q8VEB1 590 aa9.51□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ctrb1Q9CR35 263 aa9.51□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pbdc1Q9D0B6 198 aa9.51□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Snapc3Q9D2C9 407 aa9.51□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc48a1Q9D8M3 146 aa9.51□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Q9DA42 136 aa9.51□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mettl15Q9DCL4 406 aa9.51□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Htra1Q9R118 480 aa9.51□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Trav6-7-dv9A0A075B639 125 aa9.5□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr418A0A140T8J6 310 aa9.5□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1034A0A1L1ST14 310 aa9.5□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Klri1B2KG20 248 aa9.5□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Yjefn3F6W8I0 251 aa9.5□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 9130019O22RikG3X941 543 aa9.5□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr190K7N5T5 307 aa9.5□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 OtpO09113 325 aa9.5□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Alx3O70137 343 aa9.5□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tulp3O88413 460 aa9.5□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Orm2P07361 207 aa9.5□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rrm2P11157 390 aa9.5□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gpd1P13707 349 aa9.5□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lmo4P61969 165 aa9.5□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gdpgp1Q3TLS3 386 aa9.5□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lrcol1Q3URS3 161 aa9.5□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Snx33Q4VAA7 574 aa9.5□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PiglQ5SX19 252 aa9.5□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Snrnp70Q62376 448 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 RfflQ6ZQM0 377 aa9.5□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Eci3Q78JN3 317 aa9.5□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr776Q7TRI3 312 aa9.5□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 SynprQ8BGN8 265 aa9.5□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mettl6Q8BVH9 282 aa9.5□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mblac1Q8BWY4 260 aa9.5□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rbm14Q8C2Q3 669 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Faim2Q8K097 317 aa9.5□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmem19Q91W52 336 aa9.5□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tram2Q924Z5 370 aa9.5□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 CenpmQ9CQA0 180 aa9.5□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc25a30Q9CR58 291 aa9.5□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Actr6Q9D864 396 aa9.5□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr948Q9EQ95 321 aa9.5□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Khdrbs3Q9R226 346 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Oasl2Q9Z2F2 508 aa9.5□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm16432A0A0A6YXX9 775 aa9.49□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm13083A2AGW5 501 aa9.49□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm8267E9Q207 261 aa9.49□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr199F6ZUS0 308 aa9.49□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm8888J3QPX5 126 aa9.49□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm8857L7N291 182 aa9.49□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Bet1O35623 118 aa9.49□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 P01726 129 aa9.49□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hoxa3P02831 443 aa9.49□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 P04219 140 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 43.9 ms