RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635397.1

SMARCA2-241, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 2, humanhuman

TSL 4

Gene SMARCA2, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2-241ENST00000635397 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa3.56□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 PGA5P0DJD9 388 aa3.56□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 WARSP23381 471 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 IL32P24001 234 aa3.56□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 DNASE1L1P49184 302 aa3.56□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 PAFAH1B2P68402 229 aa3.56□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 SLC7A9P82251 487 aa3.56□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 HMGCS1Q01581 520 aa3.56□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 PON3Q15166 354 aa3.56□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 GCSAMLQ5JQS6 135 aa3.56□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 THEM4Q5T1C6 240 aa3.56□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 CPTPQ5TA50 214 aa3.56□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 ZNF470Q6ECI4 717 aa3.56□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 CD300LGQ6UXG3 332 aa3.56□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 ZNF493Q6ZR52 646 aa3.56□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 ABHD13Q7L211 337 aa3.56□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa3.56□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 FAM9CQ8IZT9 166 aa3.56□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 SLC34A3Q8N130 599 aa3.56□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 NPWQ8N729 165 aa3.56□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 LINC00469Q8N7U9 141 aa3.56□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 OR4S2Q8NH73 311 aa3.56□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 SEH1LQ96EE3 360 aa3.56□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 ZNF681Q96N22 645 aa3.56□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 UQCC2Q9BRT2 126 aa3.56□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 REEP1Q9H902 201 aa3.56□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 NECAP2Q9NVZ3 263 aa3.56□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 ENPP5Q9UJA9 477 aa3.56□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa3.56□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 ERCC6Q03468 1493 aa3.55□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa3.55□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 PLAC8L1A1L4L8 177 aa3.55□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 SEC14L6B5MCN3 397 aa3.55□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa3.55□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 DFFAO00273 331 aa3.55□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 SLC16A7O60669 478 aa3.55□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 ALOX12BO75342 701 aa3.55□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 CDK14O94921 469 aa3.55□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 TPM3P06753 285 aa3.55□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 GNAO1P09471 354 aa3.55□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 PGA4P0DJD7 388 aa3.55□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 PGA3P0DJD8 388 aa3.55□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 PSG2P11465 335 aa3.55□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 ADRB3P13945 408 aa3.55□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 TCP1P17987 556 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 HOXA9P31269 272 aa3.55□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 PFN2P35080 140 aa3.55□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 CEACAM3P40198 252 aa3.55□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 COTL1Q14019 142 aa3.55□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 TAL2Q16559 108 aa3.55□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 CHRFAM7AQ494W8 412 aa3.55□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 TMEM255AQ5JRV8 349 aa3.55□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 FAHD1Q6P587 224 aa3.55□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 LYPD2Q6UXB3 125 aa3.55□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 OR10W1Q8NGF6 305 aa3.55□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 OR51A7Q8NH64 312 aa3.55□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP3.55□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 SGTBQ96EQ0 304 aa3.55□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 TAAR1Q96RJ0 339 aa3.55□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 NDEL1Q9GZM8 345 aa3.55□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 OR2S2Q9NQN1 319 aa3.55□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 RMND1Q9NWS8 449 aa3.55□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 VAPAQ9P0L0 249 aa3.55□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 CES1P1Q9UKY3 287 aa3.55□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa3.55□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa3.54□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 SYCE1LA8MT33 242 aa3.54□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 H7C1H1 209 aa3.54□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 H7C2Y5 167 aa3.54□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 GATCO43716 136 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 CD5LO43866 347 aa3.54□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 RDH16O75452 317 aa3.54□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 RETP07949 1114 aa3.54□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 ERGP11308 486 aa3.54□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 ARL2P36404 184 aa3.54□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 VSNL1P62760 191 aa3.54□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 RPL31P62899 125 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 ST3GAL4Q11206 333 aa3.54□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 ZFP90Q8TF47 636 aa3.54□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 CREB3L1Q96BA8 519 aa3.54□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 GALNT14Q96FL9 552 aa3.54□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 ZNF799Q96GE5 643 aa3.54□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 CYYR1Q96J86 154 aa3.54□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 BTN2A3PQ96KV6 586 aa3.54□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 RNF145Q96MT1 663 aa3.54□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 C1orf198Q9H425 327 aa3.54□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.2 ms