RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 A0A0U1RQV5 110 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 A0A1W2PPR1 153 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 OR4C45A6NMZ5 311 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 E7EQL1 145 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 CTAG2O75638 210 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 INMTO95050 263 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 ZFPL1O95159 310 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 OR4A8P0C604 315 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 SMIM18P0DKX4 95 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 CELP19835 753 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 TUBG1P23258 451 aa7.31□□□□□ -1.24
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SGMS1-211ENST00000626236 GCH1P30793 250 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 MPV17P39210 176 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 BDH1Q02338 343 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 TLE4Q04727 773 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 ACSM1Q08AH1 577 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 MSMPQ1L6U9 139 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF718Q3SXZ3 478 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 ARMCX4Q5H9R4 360 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 UBE2UQ5VVX9 321 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
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SGMS1-211ENST00000626236 LRP11Q86VZ4 500 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 RDH10Q8IZV5 341 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 OR5AK2Q8NH90 309 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 SYNPRQ8TBG9 265 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 UFD1Q92890 307 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 FBXW5Q969U6 566 aa7.31□□□□□ -1.24
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SGMS1-211ENST00000626236 CMBLQ96DG6 245 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 SMIM19Q96E16 107 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 LYZL4Q96KX0 146 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 OPALINQ96PE5 141 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 MGLLQ99685 303 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 SYT3Q9BQG1 590 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 SOX7Q9BT81 388 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
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SGMS1-211ENST00000626236 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 RGCCQ9H4X1 137 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 OPA3Q9H6K4 179 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF442Q9H7R0 627 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 UBTD1Q9HAC8 227 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 VCX3AQ9NNX9 186 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 ISYNA1Q9NPH2 558 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 GPR84Q9NQS5 396 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 TUBG2Q9NRH3 451 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 DUSP13Q9UII6 198 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF391Q9UJN7 358 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 CMAHPQ9Y471 501 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa7.31□□□□□ -1.24
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SGMS1-211ENST00000626236 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa7.3□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 A0A1B0GVI7 797 aa7.3□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa7.3□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 FAM221AA4D161 298 aa7.3□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 GGT3PA6NGU5 568 aa7.3□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM212A6NML5 194 aa7.3□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 VSTM5A8MXK1 200 aa7.3□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 H3BSA7 217 aa7.3□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 HS3ST1O14792 307 aa7.3□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 OGG1O15527 345 aa7.3□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 SYT7O43581 403 aa7.3□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 CLPTM1O96005 669 aa7.3□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 IGLV3-1P01715 115 aa7.3□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 ISG15P05161 165 aa7.3□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF250P15622 560 aa7.3□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 CFL1P23528 166 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 SERPINF1P36955 418 aa7.3□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 FAM3AP98173 230 aa7.3□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 PSG7Q13046 419 aa7.3□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 ADIPOQQ15848 244 aa7.3□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 TSTQ16762 297 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 ALKBH6Q3KRA9 238 aa7.3□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM255AQ5JRV8 349 aa7.3□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM244Q5VVB8 128 aa7.3□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 LIPKQ5VXJ0 399 aa7.3□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 OR2T2Q6IF00 324 aa7.3□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 FBXW12Q6X9E4 464 aa7.3□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 DOK3Q7L591 496 aa7.3□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 OR5AS1Q8N127 324 aa7.3□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 FBXL14Q8N1E6 418 aa7.3□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 BHLHE23Q8NDY6 225 aa7.3□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 RPS4Y2Q8TD47 263 aa7.3□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 GHSRQ92847 366 aa7.3□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 SPSB4Q96A44 273 aa7.3□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 DHRS9Q9BPW9 319 aa7.3□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 PLK3Q9H4B4 646 aa7.3□□□□□ -1.24
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