RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593200.5

EFTUD2-226, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 485 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-226ENST00000593200 MAP6Q96JE9 813 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 C7orf34Q96L11 122 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 DPAGT1Q9H3H5 408 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 FN3KQ9H479 309 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 TCF7L1Q9HCS4 588 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 C1orf123Q9NWV4 160 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 KAAG1Q9UBP8 84 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 KCNG2Q9UJ96 466 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 C5orf63A6NC05 138 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 OR6C68A6NDL8 312 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 GGT3PA6NGU5 568 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 A6NLC8 198 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 LHBP01229 141 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 GRPP07492 148 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 COX4I1P13073 169 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 NOS3P29474 1203 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 CDONQ4KMG0 1287 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 GLYATL3Q5SZD4 288 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 TEX36Q5VZQ5 186 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF826PQ6ZT77 177 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 VMO1Q7Z5L0 202 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 C1QL4Q86Z23 238 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 PDZD9Q8IXQ8 264 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM86B1Q8N7N1 296 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 SPERTQ8NA61 448 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 SPTSSAQ969W0 71 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 IFT27Q9BW83 186 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 C16orf95Q9H693 158 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 CNTD2Q9H8S5 307 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 ABCD2Q9UBJ2 740 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 KPTNQ9Y664 436 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 A0A1B0GVI7 797 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 BHLHE40O14503 412 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 NDUFAB1O14561 156 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 IDH3BO43837 385 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 TSPAN9O75954 239 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF823P16415 610 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 RPS27P42677 84 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 MZT1Q08AG7 82 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 POU4F2Q12837 409 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 KRT72Q14CN4 511 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 C2orf68Q2NKX9 166 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 DRAM2Q6UX65 266 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 HACD2Q6Y1H2 254 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 FGFRL1Q8N441 504 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 OR56B2PQ8NGI1 322 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 ST8SIA4Q92187 359 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 OPA3Q9H6K4 179 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 EFCAB1Q9HAE3 211 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNRD1Q9P1U0 126 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 VPREB3Q9UKI3 123 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM96BQ9Y3D0 163 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 A0A1B0GW55 424 aa8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 BTBD17A6NE02 478 aa8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 GADD45GO95257 159 aa8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 FBP1P09467 338 aa8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 DUX4L2P0CJ85 424 aa8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 DUX4L3P0CJ86 424 aa8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 DUX4L4P0CJ87 422 aa8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 DUX4L5P0CJ88 424 aa8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 DUX4L6P0CJ89 424 aa8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 DUX4L7P0CJ90 424 aa8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 PSKH1P11801 424 aa8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 GSSP48637 474 aa8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 NUDT2P50583 147 aa8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 SMIM11AP58511 58 aa8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 SPIBQ01892 262 aa8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 PCK2Q16822 640 aa8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 MICBQ29980 383 aa8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 GLYATQ6IB77 296 aa8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 C11orf53Q8IXP5 236 aa8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 LNX2Q8N448 690 aa8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 LY6G5BQ8NDX9 201 aa8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 OR4C15Q8NGM1 316 aa8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 NPRL2Q8WTW4 380 aa8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 SPSB4Q96A44 273 aa8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 DMRTB1Q96MA1 342 aa8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 COPS4Q9BT78 406 aa8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 C14orf119Q9NWQ9 140 aa8.47□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms