RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589550.1

PIK3C3-211, Transcript of phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

TSL 3

Gene PIK3C3, Length 597 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3-211ENST00000589550 PIGGQ5H8A4 983 aa3.71□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 ACTL10Q5JWF8 245 aa3.71□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 FAM27D1Q5T7N8 215 aa3.71□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.71□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 CDRT4Q8N9R6 151 aa3.71□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 ZFAND1Q8TCF1 268 aa3.71□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 LRRC45Q96CN5 670 aa3.71□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 FAM210BQ96KR6 192 aa3.71□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 CATSPER2Q96P56 530 aa3.71□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 PYGO2Q9BRQ0 406 aa3.71□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP3.71□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 EDA2RQ9HAV5 297 aa3.71□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP3.71□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 FBXO8Q9NRD0 319 aa3.71□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 RHBDL2Q9NX52 303 aa3.71□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 MS4A12Q9NXJ0 267 aa3.71□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa3.71□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa3.71□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 A0A0J9YXV3 536 aa3.7□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 hCG_2039718K7EN88 272 aa3.7□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 PLPP3O14495 311 aa3.7□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 HAT1O14929 419 aa3.7□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 E2F6O75461 281 aa3.7□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 ACTL6AO96019 429 aa3.7□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 KLK2P20151 261 aa3.7□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 P2RY2P41231 377 aa3.7□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 CRATP43155 626 aa3.7□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 RGS6P49758 472 aa3.7□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 SLC35A1P78382 337 aa3.7□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 ARG2P78540 354 aa3.7□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 COTL1Q14019 142 aa3.7□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 OR1Q1Q15612 314 aa3.7□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 ORMDL2Q53FV1 153 aa3.7□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 ZNF691Q5VV52 312 aa3.7□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 PLET1Q6UQ28 207 aa3.7□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 LYG1Q8N1E2 194 aa3.7□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 C11orf42Q8N5U0 333 aa3.7□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 OR7G1Q8NGA0 311 aa3.7□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 OR10G6Q8NH81 332 aa3.7□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa3.7□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 ABHD3Q8WU67 409 aa3.7□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 ZFP3Q96NJ6 502 aa3.7□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 RDH12Q96NR8 316 aa3.7□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 SERPINB11Q96P15 392 aa3.7□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 SULT4A1Q9BR01 284 aa3.7□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 TOLLIPQ9H0E2 274 aa3.7□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 ARV1Q9H2C2 271 aa3.7□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 PLEKHA1Q9HB21 404 aa3.7□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 MAT2BQ9NZL9 334 aa3.7□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 AP3M1Q9Y2T2 418 aa3.7□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 SIGLEC9Q9Y336 463 aa3.7□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 PALLDQ8WX93 1383 aa3.7□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa3.7□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa3.7□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa3.69□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 A0A1B0GTI1 187 aa3.69□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 NKX2-6A6NCS4 301 aa3.69□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 LINC01619G3V211 115 aa3.69□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 M0R1B8 84 aa3.69□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 RAD51BO15315 384 aa3.69□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 SNAI2O43623 268 aa3.69□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 CBR3O75828 277 aa3.69□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 GABARAPO95166 117 aa3.69□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 SLC35G6P0C7Q6 338 aa3.69□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 PGAM1P18669 254 aa3.69□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 UBE2AP49459 152 aa3.69□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 OR2B6P58173 313 aa3.69□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 DSCR10P59022 87 aa3.69□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 GNB2P62879 340 aa3.69□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 PMS2P3Q13401 168 aa3.69□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 IRF4Q15306 451 aa3.69□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 OR4D1Q15615 310 aa3.69□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 TCEAL5Q5H9L2 206 aa3.69□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 AVPI1Q5T686 147 aa3.69□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 RESP18Q5W5W9 173 aa3.69□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 LINC00612Q8N6U2 182 aa3.69□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 LINC01555Q8NAE3 123 aa3.69□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 CYB561A3Q8NBI2 242 aa3.69□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 RDH5Q92781 318 aa3.69□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 TCEAL3Q969E4 200 aa3.69□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 ARL5BQ96KC2 179 aa3.69□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 CEP170P1Q96L14 293 aa3.69□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 FAM19A4Q96LR4 140 aa3.69□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 GABRG3Q99928 467 aa3.69□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa3.69□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 SPNS1Q9H2V7 528 aa3.69□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 CARMIL3Q8ND23 1372 aa3.68□□□□□ -1.82
PIK3C3-211ENST00000589550 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa3.68□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms