RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP19.8■□□□□ 0.76
CAPNS1-207ENST00000589146 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP19.8■□□□□ 0.76
CAPNS1-207ENST00000589146 GNALP38405 381 aa19.8■□□□□ 0.76
CAPNS1-207ENST00000589146 NR4A2P43354 598 aa19.8■□□□□ 0.76
CAPNS1-207ENST00000589146 PLP2Q04941 152 aa19.8■□□□□ 0.76
CAPNS1-207ENST00000589146 GABRA6Q16445 453 aa19.8■□□□□ 0.76
CAPNS1-207ENST00000589146 HIKESHIQ53FT3 197 aa19.8■□□□□ 0.76
CAPNS1-207ENST00000589146 STEAP3Q658P3 488 aa19.8■□□□□ 0.76
CAPNS1-207ENST00000589146 UTS2BQ765I0 119 aa19.8■□□□□ 0.76
CAPNS1-207ENST00000589146 GABRG1Q8N1C3 465 aa19.8■□□□□ 0.76
CAPNS1-207ENST00000589146 OR6M1Q8NGM8 313 aa19.8■□□□□ 0.76
CAPNS1-207ENST00000589146 CHPT1Q8WUD6 406 aa19.8■□□□□ 0.76
CAPNS1-207ENST00000589146 SPSB4Q96A44 273 aa19.8■□□□□ 0.76
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC25A38Q96DW6 304 aa19.8■□□□□ 0.76
CAPNS1-207ENST00000589146 POM121L2Q96KW2 1035 aa19.8■□□□□ 0.76
CAPNS1-207ENST00000589146 PROCRQ9UNN8 238 aa19.8■□□□□ 0.76
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF835Q9Y2P0 537 aa19.8■□□□□ 0.76
CAPNS1-207ENST00000589146 XRCC2O43543 280 aa19.79■□□□□ 0.76
CAPNS1-207ENST00000589146 SULT1B1O43704 296 aa19.79■□□□□ 0.76
CAPNS1-207ENST00000589146 STOMP27105 288 aa19.79■□□□□ 0.76
CAPNS1-207ENST00000589146 SPOCK1Q08629 439 aa19.79■□□□□ 0.76
CAPNS1-207ENST00000589146 GSG1Q2KHT4 349 aa19.79■□□□□ 0.76
CAPNS1-207ENST00000589146 OR5AS1Q8N127 324 aa19.79■□□□□ 0.76
CAPNS1-207ENST00000589146 RAB40AQ8WXH6 277 aa19.79■□□□□ 0.76
CAPNS1-207ENST00000589146 REEP6Q96HR9 211 aa19.79■□□□□ 0.76
CAPNS1-207ENST00000589146 UQCC2Q9BRT2 126 aa19.79■□□□□ 0.76
CAPNS1-207ENST00000589146 TPPPO94811 219 aa19.78■□□□□ 0.76
CAPNS1-207ENST00000589146 RANBP1P43487 201 aa19.78■□□□□ 0.76
CAPNS1-207ENST00000589146 PITPNBP48739 271 aa19.78■□□□□ 0.76
CAPNS1-207ENST00000589146 CAPZA1P52907 286 aa19.78■□□□□ 0.76
CAPNS1-207ENST00000589146 PER3P56645 1201 aa19.78■□□□□ 0.76
CAPNS1-207ENST00000589146 CLDN12P56749 244 aa19.78■□□□□ 0.76
CAPNS1-207ENST00000589146 IL18Q14116 193 aa19.78■□□□□ 0.76
CAPNS1-207ENST00000589146 P2RY14Q15391 338 aa19.78■□□□□ 0.76
CAPNS1-207ENST00000589146 GFOD2Q3B7J2 385 aa19.78■□□□□ 0.76
CAPNS1-207ENST00000589146 PYDC2Q56P42 97 aa19.78■□□□□ 0.76
CAPNS1-207ENST00000589146 GLYATL3Q5SZD4 288 aa19.78■□□□□ 0.76
CAPNS1-207ENST00000589146 PYHIN1Q6K0P9 492 aa19.78■□□□□ 0.76
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF584Q8IVC4 421 aa19.78■□□□□ 0.76
CAPNS1-207ENST00000589146 CMTM4Q8IZR5 234 aa19.78■□□□□ 0.76
CAPNS1-207ENST00000589146 MINDY2Q8NBR6 621 aa19.78■□□□□ 0.76
CAPNS1-207ENST00000589146 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
CAPNS1-207ENST00000589146 PP6455Q8WZ26 134 aa19.78■□□□□ 0.76
CAPNS1-207ENST00000589146 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP19.78■□□□□ 0.76
CAPNS1-207ENST00000589146 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
CAPNS1-207ENST00000589146 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
CAPNS1-207ENST00000589146 OCEL1Q9H607 264 aa19.78■□□□□ 0.76
CAPNS1-207ENST00000589146 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
CAPNS1-207ENST00000589146 PLEKHA1Q9HB21 404 aa19.78■□□□□ 0.76
CAPNS1-207ENST00000589146 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa19.78■□□□□ 0.76
CAPNS1-207ENST00000589146 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa19.77■□□□□ 0.76
CAPNS1-207ENST00000589146 IL2RAP01589 272 aa19.77■□□□□ 0.76
CAPNS1-207ENST00000589146 SERPINA5P05154 406 aa19.77■□□□□ 0.76
CAPNS1-207ENST00000589146 EDN3P14138 238 aa19.77■□□□□ 0.76
CAPNS1-207ENST00000589146 PRF1P14222 555 aa19.77■□□□□ 0.76
CAPNS1-207ENST00000589146 HTR2CP28335 458 aa19.77■□□□□ 0.76
CAPNS1-207ENST00000589146 ART1P52961 327 aa19.77■□□□□ 0.76
CAPNS1-207ENST00000589146 P2RY6Q15077 328 aa19.77■□□□□ 0.76
CAPNS1-207ENST00000589146 BAK1Q16611 211 aa19.77■□□□□ 0.76
CAPNS1-207ENST00000589146 Q6ZNX1 250 aa19.77■□□□□ 0.76
CAPNS1-207ENST00000589146 MDP1Q86V88 176 aa19.77■□□□□ 0.76
CAPNS1-207ENST00000589146 C17orf78Q8N4C9 275 aa19.77■□□□□ 0.76
CAPNS1-207ENST00000589146 SSC4DQ8WTU2 575 aa19.77■□□□□ 0.76
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM3DQ96BQ1 224 aa19.77■□□□□ 0.76
CAPNS1-207ENST00000589146 SORCS2Q96PQ0 1159 aa19.77■□□□□ 0.76
CAPNS1-207ENST00000589146 PRRG2O14669 202 aa19.76■□□□□ 0.75
CAPNS1-207ENST00000589146 LDLRAD4O15165 306 aa19.76■□□□□ 0.75
CAPNS1-207ENST00000589146 HLA-DQB1P01920 261 aa19.76■□□□□ 0.75
CAPNS1-207ENST00000589146 CSF3P09919 207 aa19.76■□□□□ 0.75
CAPNS1-207ENST00000589146 IL7P13232 177 aa19.76■□□□□ 0.75
CAPNS1-207ENST00000589146 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
CAPNS1-207ENST00000589146 MNDAP41218 407 aa19.76■□□□□ 0.75
CAPNS1-207ENST00000589146 OXA1LQ15070 435 aa19.76■□□□□ 0.75
CAPNS1-207ENST00000589146 ZBTB37Q5TC79 503 aa19.76■□□□□ 0.75
CAPNS1-207ENST00000589146 BEND4Q6ZU67 534 aa19.76■□□□□ 0.75
CAPNS1-207ENST00000589146 OR8H2Q8N162 312 aa19.76■□□□□ 0.75
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF610Q8N9Z0 462 aa19.76■□□□□ 0.75
CAPNS1-207ENST00000589146 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa19.76■□□□□ 0.75
CAPNS1-207ENST00000589146 OR52N4Q8NGI2 321 aa19.76■□□□□ 0.75
CAPNS1-207ENST00000589146 OR13C9Q8NGT0 318 aa19.76■□□□□ 0.75
CAPNS1-207ENST00000589146 SETD6Q8TBK2 473 aa19.76■□□□□ 0.75
CAPNS1-207ENST00000589146 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
CAPNS1-207ENST00000589146 HAVCR1Q96D42 359 aa19.76■□□□□ 0.75
CAPNS1-207ENST00000589146 SFXN3Q9BWM7 321 aa19.76■□□□□ 0.75
CAPNS1-207ENST00000589146 CHST5Q9GZS9 411 aa19.76■□□□□ 0.75
CAPNS1-207ENST00000589146 PRORYQ9H606 182 aa19.76■□□□□ 0.75
CAPNS1-207ENST00000589146 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
CAPNS1-207ENST00000589146 A0A0G2JMP0 313 aa19.75■□□□□ 0.75
CAPNS1-207ENST00000589146 A0A0X1KG70 313 aa19.75■□□□□ 0.75
CAPNS1-207ENST00000589146 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa19.75■□□□□ 0.75
CAPNS1-207ENST00000589146 CIB4A0PJX0 185 aa19.75■□□□□ 0.75
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM8BA6NDV4 472 aa19.75■□□□□ 0.75
CAPNS1-207ENST00000589146 A6NIN4 97 aa19.75■□□□□ 0.75
CAPNS1-207ENST00000589146 CTDSPLO15194 276 aa19.75■□□□□ 0.75
CAPNS1-207ENST00000589146 GLI4P10075 376 aa19.75■□□□□ 0.75
CAPNS1-207ENST00000589146 MAP2K3P46734 347 aa19.75■□□□□ 0.75
CAPNS1-207ENST00000589146 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
CAPNS1-207ENST00000589146 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa19.75■□□□□ 0.75
CAPNS1-207ENST00000589146 OR8B8Q15620 311 aa19.75■□□□□ 0.75
CAPNS1-207ENST00000589146 C2orf76Q3KRA6 126 aa19.75■□□□□ 0.75
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