RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588972.1

ATG4D-210, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4D, Length 632 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-210ENST00000588972 PGAM4Q8N0Y7 254 aa6.55□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 NSL1Q96IY1 281 aa6.55□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 TIGARQ9NQ88 270 aa6.55□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 SEC14L4Q9UDX3 406 aa6.55□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 TMCC3Q9ULS5 477 aa6.55□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 AP3M1Q9Y2T2 418 aa6.55□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 SH3GLB1Q9Y371 365 aa6.55□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
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ATG4D-210ENST00000588972 A8MVM7 634 aa6.54□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 LRRN3E7EW58 273 aa6.54□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 CYTIPO60759 359 aa6.54□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 AKR7A3O95154 331 aa6.54□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 LYPD3O95274 346 aa6.54□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 CGAP01215 116 aa6.54□□□□□ -1.36
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ATG4D-210ENST00000588972 CALB2P22676 271 aa6.54□□□□□ -1.36
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ATG4D-210ENST00000588972 CDKN1AP38936 164 aa6.54□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 RPS5P46782 204 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
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ATG4D-210ENST00000588972 ACKR1Q16570 336 aa6.54□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 ODF4Q2M2E3 257 aa6.54□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 ULK3Q6PHR2 472 aa6.54□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 CORO6Q6QEF8 472 aa6.54□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 WDR88Q6ZMY6 472 aa6.54□□□□□ -1.36
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ATG4D-210ENST00000588972 FAM86B1Q8N7N1 296 aa6.54□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 TMEM99Q8N816 258 aa6.54□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa6.54□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 RASSF5Q8WWW0 418 aa6.54□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 SLC38A4Q969I6 547 aa6.54□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 SLC25A36Q96CQ1 311 aa6.54□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 SLC47A1Q96FL8 570 aa6.54□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 PSD2Q9BQI7 771 aa6.54□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 TMEM27Q9HBJ8 222 aa6.54□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 NDE1Q9NXR1 346 aa6.54□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 BLOC1S6Q9UL45 172 aa6.54□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 SLC7A7Q9UM01 511 aa6.54□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 PROCRQ9UNN8 238 aa6.54□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa6.54□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa6.54□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 V9GYQ6 96 aa6.54□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 ABCA1O95477 2261 aa6.53□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 USF3Q68DE3 2245 aa6.53□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 A0A087WUJ7 227 aa6.53□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF716A6NP11 495 aa6.53□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 DEFB108AA8MXU0 73 aa6.53□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 FTCDNL1E5RQL4 147 aa6.53□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
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ATG4D-210ENST00000588972 AHSA1O95433 338 aa6.53□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 IFNA14P01570 189 aa6.53□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 GPIP06744 558 aa6.53□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 YES1P07947 543 aa6.53□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 HSD17B1P14061 328 aa6.53□□□□□ -1.36
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ATG4D-210ENST00000588972 YAP1P46937 504 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 TAS2R41P59536 307 aa6.53□□□□□ -1.36
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ATG4D-210ENST00000588972 SLC35A1P78382 337 aa6.53□□□□□ -1.36
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ATG4D-210ENST00000588972 KRTAP1-1Q07627 177 aa6.53□□□□□ -1.36
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ATG4D-210ENST00000588972 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa6.53□□□□□ -1.36
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ATG4D-210ENST00000588972 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 GLYATQ6IB77 296 aa6.53□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF613Q6PF04 617 aa6.53□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa6.53□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 OR6K3Q8NGY3 331 aa6.53□□□□□ -1.36
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ATG4D-210ENST00000588972 FAM46BQ96A09 425 aa6.53□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa6.53□□□□□ -1.36
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ATG4D-210ENST00000588972 TAPBPLQ9BX59 468 aa6.53□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 POTEKPQ9BYX7 375 aa6.53□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 C12orf10Q9HB07 376 aa6.53□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF226Q9NYT6 803 aa6.53□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 CD300AQ9UGN4 299 aa6.53□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 TRAPPC4Q9Y296 219 aa6.53□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa6.52□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 A0A087X0K7 114 aa6.52□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa6.52□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 TRAPPC13A5PLN9 417 aa6.52□□□□□ -1.37
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