RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585685.5

APOC4-APOC2-201, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 5

Gene APOC4-APOC2, Length 1,829 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LPAR5Q9H1C0 372 aa14.53□□□□□ -0.08
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 UBQLN2Q9UHD9 624 aa14.53□□□□□ -0.08
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PADI1Q9ULC6 663 aa14.53□□□□□ -0.08
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LEUTXA8MZ59 168 aa14.52□□□□□ -0.08
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MCRIP1C9JLW8 97 aa14.52□□□□□ -0.08
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF35P13682 527 aa14.52□□□□□ -0.08
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZIC4Q8N9L1 334 aa14.52□□□□□ -0.08
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RAC3P60763 192 aa14.52□□□□□ -0.09
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GVQW1Q8N7I0 195 aa14.5□□□□□ -0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZDHHC22Q8N966 263 aa14.5□□□□□ -0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ULBP2Q9BZM5 246 aa14.5□□□□□ -0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ANAPC10Q9UM13 185 aa14.5□□□□□ -0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa14.5□□□□□ -0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa14.5□□□□□ -0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 A0A0G2JMM0 328 aa14.5□□□□□ -0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 A0A1W2PPB8 328 aa14.5□□□□□ -0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 A0A1W2PRS3 328 aa14.5□□□□□ -0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR5H15A6NDH6 313 aa14.5□□□□□ -0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TUBAL3A6NHL2 446 aa14.5□□□□□ -0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KIR3DP1A8MWS1 328 aa14.5□□□□□ -0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SSX5O60225 188 aa14.5□□□□□ -0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DHRS3O75911 302 aa14.5□□□□□ -0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CXADRP78310 365 aa14.5□□□□□ -0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
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