RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-215	ENST00000583289	OR2A4	O95047	310 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	AKR7A3	O95154	331 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	SPARC	P09486	303 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	H2BFM	P0C1H6	154 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	UBB	P0CG47	229 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	TFPI	P10646	304 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	ICAM2	P13598	275 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	TBP	P20226	339 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	PTN	P21246	168 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	TCEA1	P23193	301 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	DNASE1	P24855	282 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	HTR2C	P28335	458 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	HSD11B1	P28845	292 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	AGTR1	P30556	359 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	TAS2R20	P59543	309 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC35A1	P78382	337 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	HSF1	Q00613	529 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	TLE3	Q04726	772 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	CAMK2D	Q13557	499 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	EIF2B1	Q14232	305 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	KCNAB1	Q14722	419 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	FCN2	Q15485	313 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	EXT1	Q16394	746 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	BTBD16	Q32M84	506 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	C2orf76	Q3KRA6	126 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	ESCO2	Q56NI9	601 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	VWA2	Q5GFL6	755 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	C1orf100	Q5SVJ3	147 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	NKAIN2	Q5VXU1	208 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEM225	Q6GV28	225 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	RTL6	Q6ICC9	239 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	LIN54	Q6MZP7	749 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	LPCAT3	Q6P1A2	487 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	OPN5	Q6U736	354 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEM205	Q6UW68	189 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	PGAP1	Q75T13	922 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC35D2	Q76EJ3	337 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	ANKRD37	Q7Z713	158 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	CATSPERD	Q86XM0	798 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	SFTPA2	Q8IWL1	248 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC7A5P1	Q8MH63	180 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC25A45	Q8N413	288 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	METTL27	Q8N6F8	245 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289		Q8N9G6	341 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	GATS	Q8NAP1	163 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEM229B	Q8NBD8	167 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	UXS1	Q8NBZ7	420 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	DNAAF1	Q8NEP3	725 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	NFAM1	Q8NET5	270 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	OR6N1	Q8NGY5	312 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	OR2AJ1	Q8NGZ0	328 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	OR52I2	Q8NH67	350 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	CEP76	Q8TAP6	659 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	ELP5	Q8TE02	316 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	TSLP	Q969D9	159 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	C8orf44	Q96CB5	159 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	C10orf35	Q96D05	121 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	GPR137	Q96N19	417 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	SCGB3A2	Q96PL1	93 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	OR2A7	Q96R45	310 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	NAA11	Q9BSU3	229 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	ABHD6	Q9BV23	337 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	DEFB126	Q9BYW3	111 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	C20orf85	Q9H1P6	137 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	C1orf198	Q9H425	327 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEM138	Q9NPI0	162 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	ALKBH4	Q9NXW9	302 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	SLCO1C1	Q9NYB5	712 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	DHCR7	Q9UBM7	475 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	GHRL	Q9UBU3	117 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF580	Q9UK33	172 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	MGAT4A	Q9UM21	535 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	RCE1	Q9Y256	329 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	HDGFL3	Q9Y3E1	203 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEM184B	Q9Y519	407 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	MAB21L2	Q9Y586	359 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	UNC13C	Q8NB66	2214 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	SPTB	P11277	2137 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	MPDZ	O75970	2070 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	CEP290	O15078	2479 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	TRAV18	A0A075B6X5	111 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEM269	A0A1B0GVZ9	245 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	LOC390937	A0A1W2PQ73	354 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	LINC00862	A6NCI5	91 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	OR2W5	A6NFC9	320 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	TVP23A	A6NH52	213 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	LIPT2	A6NK58	231 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289		A8MU76	341 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	DISC1	C4P0D8	188 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	FTCDNL1	E5RQL4	147 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	C11orf98	E9PRG8	122 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	MS4A18	H0YCH9	400 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	TPD52L2	O43399	206 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	SPRY2	O43597	315 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	CTAG2	O75638	210 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	PMS2P2	O95744	297 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PTPRM-215	ENST00000583289	CYB5A	P00167	134 aa		3.99	□□□□□ -1.77

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