RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582955.5

SMARCE1-218, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 5

Gene SMARCE1, Length 621 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-218ENST00000582955 CA6P23280 308 aa10.65□□□□□ -0.7
SMARCE1-218ENST00000582955 RBMXP38159 391 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
SMARCE1-218ENST00000582955 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
SMARCE1-218ENST00000582955 PRSS45Q7RTY3 260 aa10.65□□□□□ -0.7
SMARCE1-218ENST00000582955 SLC35F2Q8IXU6 374 aa10.65□□□□□ -0.7
SMARCE1-218ENST00000582955 LINC01356Q8N9X3 169 aa10.65□□□□□ -0.7
SMARCE1-218ENST00000582955 OR51G2Q8NGK0 314 aa10.65□□□□□ -0.7
SMARCE1-218ENST00000582955 OR8J1Q8NGP2 316 aa10.65□□□□□ -0.7
SMARCE1-218ENST00000582955 ASB17Q8WXJ9 295 aa10.65□□□□□ -0.7
SMARCE1-218ENST00000582955 EME1Q96AY2 570 aa10.65□□□□□ -0.7
SMARCE1-218ENST00000582955 SGK3Q96BR1 496 aa10.65□□□□□ -0.7
SMARCE1-218ENST00000582955 GAL3ST1Q99999 423 aa10.65□□□□□ -0.7
SMARCE1-218ENST00000582955 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
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SMARCE1-218ENST00000582955 SLC22A4Q9H015 551 aa10.65□□□□□ -0.7
SMARCE1-218ENST00000582955 LPAR2Q9HBW0 351 aa10.65□□□□□ -0.7
SMARCE1-218ENST00000582955 ADGRL4Q9HBW9 690 aa10.65□□□□□ -0.7
SMARCE1-218ENST00000582955 IKZF2Q9UKS7 526 aa10.65□□□□□ -0.7
SMARCE1-218ENST00000582955 COPS3Q9UNS2 423 aa10.65□□□□□ -0.7
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SMARCE1-218ENST00000582955 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP10.65□□□□□ -0.71
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SMARCE1-218ENST00000582955 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa10.64□□□□□ -0.71
SMARCE1-218ENST00000582955 CRLF1O75462 422 aa10.64□□□□□ -0.71
SMARCE1-218ENST00000582955 CFL1P23528 166 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
SMARCE1-218ENST00000582955 HTR1FP30939 366 aa10.64□□□□□ -0.71
SMARCE1-218ENST00000582955 MMP16P51512 607 aa10.64□□□□□ -0.71
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SMARCE1-218ENST00000582955 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa10.64□□□□□ -0.71
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SMARCE1-218ENST00000582955 RFLNBQ8N5W9 214 aa10.64□□□□□ -0.71
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SMARCE1-218ENST00000582955 SPSB4Q96A44 273 aa10.64□□□□□ -0.71
SMARCE1-218ENST00000582955 RAB39BQ96DA2 213 aa10.64□□□□□ -0.71
SMARCE1-218ENST00000582955 MNTQ99583 582 aa10.64□□□□□ -0.71
SMARCE1-218ENST00000582955 ZNF665Q9H7R5 613 aa10.64□□□□□ -0.71
SMARCE1-218ENST00000582955 GCM1Q9NP62 436 aa10.64□□□□□ -0.71
SMARCE1-218ENST00000582955 UBAP1Q9NZ09 502 aa10.64□□□□□ -0.71
SMARCE1-218ENST00000582955 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
SMARCE1-218ENST00000582955 ZNF319Q9P2F9 582 aa10.64□□□□□ -0.71
SMARCE1-218ENST00000582955 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
SMARCE1-218ENST00000582955 DYSFO75923 2080 aa10.64□□□□□ -0.71
SMARCE1-218ENST00000582955 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
SMARCE1-218ENST00000582955 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa10.63□□□□□ -0.71
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SMARCE1-218ENST00000582955 A0A1B0GWJ7 208 aa10.63□□□□□ -0.71
SMARCE1-218ENST00000582955 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa10.63□□□□□ -0.71
SMARCE1-218ENST00000582955 PRR32B1ATL7 298 aa10.63□□□□□ -0.71
SMARCE1-218ENST00000582955 B4DSR2 109 aa10.63□□□□□ -0.71
SMARCE1-218ENST00000582955 FAM157AC9JC47 383 aa10.63□□□□□ -0.71
SMARCE1-218ENST00000582955 ANKRD65E5RJM6 399 aa10.63□□□□□ -0.71
SMARCE1-218ENST00000582955 IFNL4K9M1U5 179 aa10.63□□□□□ -0.71
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SMARCE1-218ENST00000582955 APOL3O95236 402 aa10.63□□□□□ -0.71
SMARCE1-218ENST00000582955 SBK2P0C263 348 aa10.63□□□□□ -0.71
SMARCE1-218ENST00000582955 ATP6V1E1P36543 226 aa10.63□□□□□ -0.71
SMARCE1-218ENST00000582955 DDOSTP39656 456 aa10.63□□□□□ -0.71
SMARCE1-218ENST00000582955 CD200P41217 278 aa10.63□□□□□ -0.71
SMARCE1-218ENST00000582955 RIDAP52758 137 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
SMARCE1-218ENST00000582955 LMO4P61968 165 aa10.63□□□□□ -0.71
SMARCE1-218ENST00000582955 ROM1Q03395 351 aa10.63□□□□□ -0.71
SMARCE1-218ENST00000582955 POU4F2Q12837 409 aa10.63□□□□□ -0.71
SMARCE1-218ENST00000582955 ZSCAN26Q16670 478 aa10.63□□□□□ -0.71
SMARCE1-218ENST00000582955 CHRFAM7AQ494W8 412 aa10.63□□□□□ -0.71
SMARCE1-218ENST00000582955 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa10.63□□□□□ -0.71
SMARCE1-218ENST00000582955 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
SMARCE1-218ENST00000582955 ZNF679Q8IYX0 411 aa10.63□□□□□ -0.71
SMARCE1-218ENST00000582955 OR8B12Q8NGG6 310 aa10.63□□□□□ -0.71
SMARCE1-218ENST00000582955 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
SMARCE1-218ENST00000582955 RFKQ969G6 155 aa10.63□□□□□ -0.71
SMARCE1-218ENST00000582955 UBE2FQ969M7 185 aa10.63□□□□□ -0.71
SMARCE1-218ENST00000582955 C1orf159Q96HA4 380 aa10.63□□□□□ -0.71
SMARCE1-218ENST00000582955 HRASLS5Q96KN8 279 aa10.63□□□□□ -0.71
SMARCE1-218ENST00000582955 OR8B4Q96RC9 309 aa10.63□□□□□ -0.71
SMARCE1-218ENST00000582955 MBOAT4Q96T53 435 aa10.63□□□□□ -0.71
SMARCE1-218ENST00000582955 TBX5Q99593 518 aa10.63□□□□□ -0.71
SMARCE1-218ENST00000582955 SLC29A1Q99808 456 aa10.63□□□□□ -0.71
SMARCE1-218ENST00000582955 RGCCQ9H4X1 137 aa10.63□□□□□ -0.71
SMARCE1-218ENST00000582955 UFSP2Q9NUQ7 469 aa10.63□□□□□ -0.71
SMARCE1-218ENST00000582955 CLN6Q9NWW5 311 aa10.63□□□□□ -0.71
SMARCE1-218ENST00000582955 HAO2Q9NYQ3 351 aa10.63□□□□□ -0.71
SMARCE1-218ENST00000582955 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa10.63□□□□□ -0.71
SMARCE1-218ENST00000582955 GMPPBQ9Y5P6 360 aa10.63□□□□□ -0.71
SMARCE1-218ENST00000582955 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
SMARCE1-218ENST00000582955 ABCA2Q9BZC7 2435 aa10.62□□□□□ -0.71
SMARCE1-218ENST00000582955 LRRC30A6NM36 301 aa10.62□□□□□ -0.71
SMARCE1-218ENST00000582955 TMEM178BH3BS89 294 aa10.62□□□□□ -0.71
SMARCE1-218ENST00000582955 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
SMARCE1-218ENST00000582955 IGHV2-70P01814 119 aa10.62□□□□□ -0.71
SMARCE1-218ENST00000582955 IGHV2-5P01817 119 aa10.62□□□□□ -0.71
SMARCE1-218ENST00000582955 MSMBP08118 114 aa10.62□□□□□ -0.71
SMARCE1-218ENST00000582955 IRF2P14316 349 aa10.62□□□□□ -0.71
SMARCE1-218ENST00000582955 GNALP38405 381 aa10.62□□□□□ -0.71
SMARCE1-218ENST00000582955 GSK3AP49840 483 aa10.62□□□□□ -0.71
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