RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574322.5

CTDNEP1-210, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-210ENST00000574322 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
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CTDNEP1-210ENST00000574322 KIR2DL3P43628 341 aa24.83■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 PLA2G7Q13093 441 aa24.83■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 DNM1P46Q6ZS02 220 aa24.83■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 SIAH3Q8IW03 269 aa24.83■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa24.83■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 CLCF1Q9UBD9 225 aa24.83■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa24.83■■□□□ 1.57
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CTDNEP1-210ENST00000574322 CHAC2Q8WUX2 184 aa24.83■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF224Q9NZL3 707 aa24.83■■□□□ 1.57
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CTDNEP1-210ENST00000574322 PATE4P0C8F1 98 aa24.82■■□□□ 1.56
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CTDNEP1-210ENST00000574322 OR52N4Q8NGI2 321 aa24.82■■□□□ 1.56
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR13C9Q8NGT0 318 aa24.82■■□□□ 1.56
CTDNEP1-210ENST00000574322 AKR7LQ8NHP1 331 aa24.82■■□□□ 1.56
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CTDNEP1-210ENST00000574322 TAS2R20P59543 309 aa24.81■■□□□ 1.56
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CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF391Q9UJN7 358 aa24.81■■□□□ 1.56
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CTDNEP1-210ENST00000574322 FREM1Q5H8C1 2179 aa24.81■■□□□ 1.56
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CTDNEP1-210ENST00000574322 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
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CTDNEP1-210ENST00000574322 THBS4P35443 961 aa24.81■■□□□ 1.56
CTDNEP1-210ENST00000574322 HTR5AP47898 357 aa24.81■■□□□ 1.56
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CTDNEP1-210ENST00000574322 FGD2Q7Z6J4 655 aa24.81■■□□□ 1.56
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR4D6Q8NGJ1 314 aa24.81■■□□□ 1.56
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CTDNEP1-210ENST00000574322 COX5BP10606 129 aa24.79■■□□□ 1.56
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CTDNEP1-210ENST00000574322 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa24.79■■□□□ 1.56
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CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC6A1P30531 599 aa24.78■■□□□ 1.56
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CTDNEP1-210ENST00000574322 MMP28Q9H239 520 aa24.78■■□□□ 1.56
CTDNEP1-210ENST00000574322 AUNIPQ9H7T9 357 aa24.78■■□□□ 1.56
CTDNEP1-210ENST00000574322 CACNA1GO43497 2377 aa24.77■■□□□ 1.56
CTDNEP1-210ENST00000574322 PRF1P14222 555 aa24.77■■□□□ 1.56
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
CTDNEP1-210ENST00000574322 GUSBP1Q15486 140 aa24.77■■□□□ 1.56
CTDNEP1-210ENST00000574322 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
CTDNEP1-210ENST00000574322 PLET1Q6UQ28 207 aa24.77■■□□□ 1.56
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