RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561514.1

PALB2-202, Transcript of partner and localizer of BRCA2, humanhuman

TSL 5

Gene PALB2, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALB2-202ENST00000561514 CYP51A1Q16850 503 aa7.1□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 HFEQ30201 348 aa7.1□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 ZNF718Q3SXZ3 478 aa7.1□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 AGKQ53H12 422 aa7.1□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 FAM27BQ5VT28 67 aa7.1□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 TMEM65Q6PI78 240 aa7.1□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa7.1□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 TIGD4Q8IY51 512 aa7.1□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 DTX3Q8N9I9 347 aa7.1□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 SYT14Q8NB59 555 aa7.1□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 FAM156AQ8NDB6 213 aa7.1□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 OR1J1Q8NGS3 322 aa7.1□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 OR52N1Q8NH53 320 aa7.1□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 HYLS1Q96M11 299 aa7.1□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 TMEM68Q96MH6 324 aa7.1□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 DIRC2Q96SL1 478 aa7.1□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 ZNF251Q9BRH9 671 aa7.1□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 ALG12Q9BV10 488 aa7.1□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 WNT5BQ9H1J7 359 aa7.1□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 MUC13Q9H3R2 512 aa7.1□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 RNF121Q9H920 327 aa7.1□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 DECR2Q9NUI1 292 aa7.1□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 LAMP5Q9UJQ1 280 aa7.1□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 BAIAP2Q9UQB8 552 aa7.1□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa7.1□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 TGP01266 2768 aa7.09□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 MCIDASD6RGH6 385 aa7.09□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 CLDN34H7C241 214 aa7.09□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 TMPRSS2O15393 492 aa7.09□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 KCNAB3O43448 404 aa7.09□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 SLC22A5O76082 557 aa7.09□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 SLC2A10O95528 541 aa7.09□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 IFNA7P01567 189 aa7.09□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 HIST1H2ABP04908 130 aa7.09□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 S100A9P06702 114 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 CST2P09228 141 aa7.09□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 TUBG1P23258 451 aa7.09□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 CPT2P23786 658 aa7.09□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 AQP2P41181 271 aa7.09□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 ARHGDIAP52565 204 aa7.09□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 CSNK2BP67870 215 aa7.09□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 PSG4Q00888 419 aa7.09□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 IFITM3Q01628 133 aa7.09□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 HSF2Q03933 536 aa7.09□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 GLO1Q04760 184 aa7.09□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 CDK5R2Q13319 367 aa7.09□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 GPR50Q13585 617 aa7.09□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 GK3PQ14409 553 aa7.09□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 VMACQ2NL98 169 aa7.09□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 TMEM155Q4W5P6 130 aa7.09□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 AADACL4Q5VUY2 407 aa7.09□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 SHISA2Q6UWI4 295 aa7.09□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa7.09□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 C9orf139Q6ZV77 190 aa7.09□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa7.09□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 LHFPL3Q86UP9 236 aa7.09□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 CALHM3Q86XJ0 350 aa7.09□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 DHRSXQ8N5I4 330 aa7.09□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 ZNF283Q8N7M2 679 aa7.09□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 CLRN3Q8NCR9 226 aa7.09□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 SLC25A40Q8TBP6 338 aa7.09□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 HIST1H2ACQ93077 130 aa7.09□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 MUL1Q969V5 352 aa7.09□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 MND1Q9BWT6 205 aa7.09□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 OR2H1Q9GZK4 316 aa7.09□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 EGLN1Q9GZT9 426 aa7.09□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 GHITMQ9H3K2 345 aa7.09□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 TXNIPQ9H3M7 391 aa7.09□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 C7orf69Q9H7B7 122 aa7.09□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 BIN3Q9NQY0 253 aa7.09□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 TUBG2Q9NRH3 451 aa7.09□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 C20orf141Q9NUB4 165 aa7.09□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 UFSP2Q9NUQ7 469 aa7.09□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa7.09□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 COPS3Q9UNS2 423 aa7.09□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 HIF3AQ9Y2N7 669 aa7.09□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa7.09□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 SNX13Q9Y5W8 968 aa7.09□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 PEX16Q9Y5Y5 336 aa7.09□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa7.08□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 C5orf49A4QMS7 147 aa7.08□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 CCDC182A6NF36 153 aa7.08□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 AQP12BA6NM10 295 aa7.08□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa7.08□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 FXYD1O00168 92 aa7.08□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 RGS5O15539 181 aa7.08□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 FOXH1O75593 365 aa7.08□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 FSTL3O95633 263 aa7.08□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 DHFRP00374 187 aa7.08□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 F13BP05160 661 aa7.08□□□□□ -1.28
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