RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	WNT5A	P41221	380 aa		11.69	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	MTNR1A	P48039	350 aa		11.69	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	HCCS	P53701	268 aa		11.69	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	GALK2	Q01415	458 aa		11.69	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	MVK	Q03426	396 aa		11.69	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	ALKBH6	Q3KRA9	238 aa		11.69	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	IZUMO2	Q6UXV1	221 aa		11.69	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	RHOU	Q7L0Q8	258 aa		11.69	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	RNF133	Q8WVZ7	376 aa		11.69	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	SLAMF6	Q96DU3	332 aa		11.69	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	AMELY	Q99218	206 aa		11.69	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	SYT3	Q9BQG1	590 aa		11.69	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	MRPL37	Q9BZE1	423 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	KLHDC2	Q9Y2U9	406 aa		11.69	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	HSPE1-MOB4	S4R3N1	261 aa		11.69	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	SNTN	A6NMZ2	147 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	ZNF878	C9JN71	531 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	CDC14B	O60729	498 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	LYN	P07948	512 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	RAD52	P43351	418 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	HSPA13	P48723	471 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	UCP2	P55851	309 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	KRTAP10-3	P60369	221 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	SNTB2	Q13425	540 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	SLC35F2	Q8IXU6	374 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	ZNF101	Q8IZC7	436 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	C8orf59	Q8N0T1	100 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	OR51G2	Q8NGK0	314 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	CNIH3	Q8TBE1	160 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	FBLIM1	Q8WUP2	373 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	THEM6	Q8WUY1	208 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	C4orf45	Q96LM5	186 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	DCLRE1C	Q96SD1	692 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	MNT	Q99583	582 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	ZNF442	Q9H7R0	627 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	CENPM	Q9NSP4	180 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	EIF3K	Q9UBQ5	218 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	LAMP5	Q9UJQ1	280 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	COPS3	Q9UNS2	423 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	TMEM14A	Q9Y6G1	99 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222		J3QRE1	110 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	APOL3	O95236	402 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	FSHB	P01225	129 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	ACSM4	P0C7M7	580 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	FAM157B	P0CG42	384 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	DBT	P11182	482 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	NAT2	P11245	290 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	PRTN3	P24158	256 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	GLRX	P35754	106 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	OPRL1	P41146	370 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	ZNF91	Q05481	1191 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	SCGB2A2	Q13296	93 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	CDK5R2	Q13319	367 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	ARL9	Q6T311	187 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	C1orf174	Q8IYL3	243 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	ASB17	Q8WXJ9	295 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	RNFT2	Q96EX2	444 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	COPS4	Q9BT78	406 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	BCL2L14	Q9BZR8	327 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	ELOVL3	Q9HB03	270 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	TBCCD1	Q9NVR7	557 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	ZNF69	Q9UC07	566 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	WNK1	Q9H4A3	2382 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	PRR32	B1ATL7	298 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222		F5H5K5	113 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	RP2	O75695	350 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	ABHD16A	O95870	558 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	NGF	P01138	241 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	ERCC1	P07992	297 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	OR2T7	P0C7T2	308 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	VSIG8	P0DPA2	414 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	ATP6V1E1	P36543	226 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	SLC15A1	P46059	708 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	RGS6	P49758	472 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	TPTE	P56180	551 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	RPS23	P62266	143 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	GRB2	P62993	217 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	ROM1	Q03395	351 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	LAIR2	Q6ISS4	152 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	UNQ6126/PRO20091	Q6UXV3	157 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	RFPL4B	Q6ZWI9	263 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	SPATC1	Q76KD6	591 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	THAP5	Q7Z6K1	395 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	OR2T27	Q8NH04	317 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	NANP	Q8TBE9	248 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	SPTSSA	Q969W0	71 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	LGALS12	Q96DT0	336 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	KCNJ15	Q99712	375 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	ANKRD60	Q9BZ19	345 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	OR51B6	Q9H340	312 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	C7orf69	Q9H7B7	122 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	ZNF665	Q9H7R5	613 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	AMBN	Q9NP70	447 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	FBXO9	Q9UK97	447 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	EXOG	Q9Y2C4	368 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54

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