RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 PLBD1Q6P4A8 553 aa4.75□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 LRRN1Q6UXK5 716 aa4.75□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 CFAP77Q6ZQR2 320 aa4.75□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 COLCA1Q6ZS62 124 aa4.75□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC16A9Q7RTY1 509 aa4.75□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 DPY19L4Q7Z388 723 aa4.75□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 THAP5Q7Z6K1 395 aa4.75□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 COMMD2Q86X83 199 aa4.75□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 CPOQ8IVL8 374 aa4.75□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 TIGD4Q8IY51 512 aa4.75□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 OR5AS1Q8N127 324 aa4.75□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 BHLHE23Q8NDY6 225 aa4.75□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 CCDC54Q8NEL0 328 aa4.75□□□□□ -1.65
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CLSTN3-215ENST00000544584 OR51L1Q8NGJ5 315 aa4.75□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa4.75□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 OTOSQ8NHW6 89 aa4.75□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 Q8TCH9 128 aa4.75□□□□□ -1.65
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CLSTN3-215ENST00000544584 RNF133Q8WVZ7 376 aa4.75□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 ITLN1Q8WWA0 313 aa4.75□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC7A6Q92536 515 aa4.75□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 STMN2Q93045 179 aa4.75□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 YIPF5Q969M3 257 aa4.75□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 REEP6Q96HR9 211 aa4.75□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 PGAM5Q96HS1 289 aa4.75□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 MEGF10Q96KG7 1140 aa4.75□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 OR8B2Q96RD0 313 aa4.75□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 MICU1Q9BPX6 476 aa4.75□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
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CLSTN3-215ENST00000544584 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa4.75□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 OCEL1Q9H607 264 aa4.75□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 MOB1AQ9H8S9 216 aa4.75□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 MARCH7Q9H992 704 aa4.75□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 NTN4Q9HB63 628 aa4.75□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC25A19Q9HC21 320 aa4.75□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 GCM1Q9NP62 436 aa4.75□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 IMPAD1Q9NX62 359 aa4.75□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 TREM2Q9NZC2 230 aa4.75□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 ERVK-18Q9QC07 812 aa4.75□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 RNF7Q9UBF6 113 aa4.75□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 PPIAL4AQ9Y536 164 aa4.75□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa4.75□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 MPC1Q9Y5U8 109 aa4.75□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 MGAM2Q2M2H8 2515 aa4.75□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 A0A0G2JK05 382 aa4.74□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa4.74□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa4.74□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa4.74□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 A6NLC8 198 aa4.74□□□□□ -1.65
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CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa4.74□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM178BH3BS89 294 aa4.74□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 GPR37O15354 613 aa4.74□□□□□ -1.65
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CLSTN3-215ENST00000544584 MPZL2O60487 215 aa4.74□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 ECDO95905 644 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 SERPINA3P01011 423 aa4.74□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 IGHV2-70P01814 119 aa4.74□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 GYPBP06028 91 aa4.74□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 PPIAL4GP0DN37 164 aa4.74□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 RPS2P15880 293 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 DCTDP32321 178 aa4.74□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 MAP2K3P46734 347 aa4.74□□□□□ -1.65
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CLSTN3-215ENST00000544584 EGR3Q06889 387 aa4.74□□□□□ -1.65
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CLSTN3-215ENST00000544584 OR8B8Q15620 311 aa4.74□□□□□ -1.65
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CLSTN3-215ENST00000544584 MSMPQ1L6U9 139 aa4.74□□□□□ -1.65
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CLSTN3-215ENST00000544584 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa4.74□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 ARMCX4Q5H9R4 360 aa4.74□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 AVPI1Q5T686 147 aa4.74□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 ZBTB37Q5TC79 503 aa4.74□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 MEDAGQ5VYS4 303 aa4.74□□□□□ -1.65
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CLSTN3-215ENST00000544584 FAHD1Q6P587 224 aa4.74□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 USP43Q70EL4 1123 aa4.74□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
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CLSTN3-215ENST00000544584 FAM220AQ7Z4H9 259 aa4.74□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa4.74□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 EGFL6Q8IUX8 553 aa4.74□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF679Q8IYX0 411 aa4.74□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 BPIFB2Q8N4F0 458 aa4.74□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF511Q8NB15 262 aa4.74□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 OR8D4Q8NGM9 314 aa4.74□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 OR8J1Q8NGP2 316 aa4.74□□□□□ -1.65
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