RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540783.5

RAPGEF4-215, Transcript of Rap guanine nucleotide exchange factor 4, human

TSL 2 BASIC

Gene RAPGEF4, Length 3,974 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAPGEF4-215	ENST00000540783	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	FCGR2A	P12318	317 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	PRKX	P51817	358 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	CSNK2A1	P68400	391 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	CEBPE	Q15744	281 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	MPPED2	Q15777	294 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	MOGAT2	Q3SYC2	334 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	OR52W1	Q6IF63	320 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	MRPL14	Q6P1L8	145 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	ACOT7L	Q6ZUV0	252 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	JAZF1	Q86VZ6	243 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	OR5M8	Q8NGP6	311 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	OR2G2	Q8NGZ5	317 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	CCDC107	Q8WV48	283 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	CMBL	Q96DG6	245 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	SEH1L	Q96EE3	360 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	CNTNAP3B	Q96NU0	1288 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	SPSB2	Q99619	263 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	PIGQ	Q9BRB3	760 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	CST11	Q9H112	138 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	ASCL3	Q9NQ33	180 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	TAS2R8	Q9NYW2	309 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	IL17B	Q9UHF5	180 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	LAMP5	Q9UJQ1	280 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	TMED7	Q9Y3B3	224 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	ETV7	Q9Y603	341 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	HS3ST3B1	Q9Y662	390 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	SPEG	Q15772	3267 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	AHCTF1	Q8WYP5	2266 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	TDRD6	O60522	2096 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	ASCC3	Q8N3C0	2202 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783		K7ENP7	123 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	TXNL1	O43396	289 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	GLCE	O94923	617 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	HLA-DQA2	P01906	255 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	TACSTD2	P09758	323 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	SMIM10L1	P0DMW3	83 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	RPS4Y1	P22090	263 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	MAPK3	P27361	379 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	CTXN1	P60606	82 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	PPP1R1A	Q13522	171 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	RAB11B	Q15907	218 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	EIF2S3L	Q2VIR3	472 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	ZNF684	Q5T5D7	378 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	INO80C	Q6PI98	192 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	GFRAL	Q6UXV0	394 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	PRSS35	Q8N3Z0	413 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	EXD3	Q8N9H8	876 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	ACBD4	Q8NC06	268 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	BHLHE23	Q8NDY6	225 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	OR4A4P	Q8NGN8	299 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	PHYHIP	Q92561	330 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	SMIM10	Q96HG1	83 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	GSN-AS1	Q9NRJ2	163 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	ZFP57	Q9NU63	452 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	DNAJB12	Q9NXW2	375 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	MYOT	Q9UBF9	498 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	VSIG4	Q9Y279	399 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	OR4C45	A6NMZ5	311 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	ZNF208	O43345	1280 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	OR2F2	O95006	317 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	ONECUT2	O95948	504 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	PPT1	P50897	306 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	CHAF1B	Q13112	559 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	OR2F1	Q13607	317 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	GGTLC2	Q14390	218 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	INPP5J	Q15735	1006 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	CDNF	Q49AH0	187 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	KRTCAP3	Q53RY4	240 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	GLYATL3	Q5SZD4	288 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	MDGA2	Q7Z553	956 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	PPP1R32	Q7Z5V6	425 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	OR5AP2	Q8NGF4	316 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	OR13C8	Q8NGS7	320 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	DCUN1D4	Q92564	292 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	CYYR1	Q96J86	154 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	MOGAT1	Q96PD6	335 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	RSRP1	Q9BUV0	290 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	BCL2L14	Q9BZR8	327 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	PARP12	Q9H0J9	701 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	URB1	O60287	2271 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	IGHV1-45	A0A0A0MS14	117 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783		A0A1W2PPE3	182 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	CYR61	O00622	381 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	OR2J2	O76002	312 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	CYB5A	P00167	134 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	PNMT	P11086	282 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	PTGER4	P35408	488 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	SPOCK1	Q08629	439 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	WDR38	Q5JTN6	314 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	FHL5	Q5TD97	284 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RAPGEF4-215	ENST00000540783	DHRS7B	Q6IAN0	325 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6

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