RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPAG7O75391 227 aa8.11□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LCATP04180 440 aa8.11□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CTXN1P60606 82 aa8.11□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MALLQ13021 153 aa8.11□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ABCA11PQ4W5N1 156 aa8.11□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GCNT6Q5T4J0 391 aa8.11□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C9orf66Q5T8R8 295 aa8.11□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PIGWQ7Z7B1 504 aa8.11□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CNPY4Q8N129 248 aa8.11□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PLPP7Q8NBV4 271 aa8.11□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa8.11□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR4D11Q8NGI4 311 aa8.11□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BCAS4Q8TDM0 211 aa8.11□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GATAD1Q8WUU5 269 aa8.11□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SGTBQ96EQ0 304 aa8.11□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 P2RX4Q99571 388 aa8.11□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 WACQ9BTA9 647 aa8.11□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa8.11□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AIG1Q9NVV5 245 aa8.11□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RPS6KA6Q9UK32 745 aa8.11□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 POLR1DQ9Y2S0 133 aa8.11□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRAPPC13A5PLN9 417 aa8.1□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GGT3PA6NGU5 568 aa8.1□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SEC14L6B5MCN3 397 aa8.1□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SERPINB7O75635 380 aa8.1□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MT-ND1P03886 318 aa8.1□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SHBGP04278 402 aa8.1□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZCCHC18P0CG32 403 aa8.1□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CTLA4P16410 223 aa8.1□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CSNK2BP67870 215 aa8.1□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SCARB2Q14108 478 aa8.1□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DUSP7Q16829 419 aa8.1□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C9orf152Q5JTZ5 239 aa8.1□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CORO6Q6QEF8 472 aa8.1□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR2W3Q7Z3T1 314 aa8.1□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C11orf53Q8IXP5 236 aa8.1□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MICU2Q8IYU8 434 aa8.1□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FNDC8Q8TC99 324 aa8.1□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM255BQ8WV15 326 aa8.1□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ITCHQ96J02 903 aa8.1□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZIM3Q96PE6 472 aa8.1□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRSS27Q9BQR3 290 aa8.1□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC22A4Q9H015 551 aa8.1□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 WDR13Q9H1Z4 485 aa8.1□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SCOCQ9UIL1 159 aa8.1□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HILPDAQ9Y5L2 63 aa8.1□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RHBDL1O75783 438 aa8.09□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LY6G6CO95867 125 aa8.09□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ARG1P05089 322 aa8.09□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IL6P05231 212 aa8.09□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MYF6P23409 242 aa8.09□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CD24P25063 80 aa8.09□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CASQ1P31415 396 aa8.09□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GGT2P36268 569 aa8.09□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GABRA2P47869 451 aa8.09□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CENPAP49450 140 aa8.09□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC34A1Q06495 639 aa8.09□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MPP2Q14168 576 aa8.09□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF260Q3ZCT1 412 aa8.09□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa8.09□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 STUMQ69YW2 141 aa8.09□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NKAIN4Q8IVV8 208 aa8.09□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LRRC8CQ8TDW0 803 aa8.09□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 APOPT1Q96IL0 206 aa8.09□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MPP4Q96JB8 637 aa8.09□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GAFA1Q96PS6 74 aa8.09□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF426Q9BUY5 554 aa8.09□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GRPEL1Q9HAV7 217 aa8.09□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C14orf119Q9NWQ9 140 aa8.09□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HAO2Q9NYQ3 351 aa8.09□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PSMB11A5LHX3 300 aa8.08□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa8.08□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BHLHE40O14503 412 aa8.08□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CDIPTO14735 213 aa8.08□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BMP2P12643 396 aa8.08□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GRK5P34947 590 aa8.08□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 VEGFCP49767 419 aa8.08□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FADDQ13158 208 aa8.08□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SELPLGQ14242 412 aa8.08□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MEP1BQ16820 701 aa8.08□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DEFB136Q30KP8 78 aa8.08□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC2A7Q6PXP3 512 aa8.08□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 WDR82Q6UXN9 313 aa8.08□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DPY19L4Q7Z388 723 aa8.08□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 WDR86Q86TI4 376 aa8.08□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNRF1Q8ND25 227 aa8.08□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM185AQ8NFB2 350 aa8.08□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GPR32P1Q8NGA4 272 aa8.08□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR8S1Q8NH09 359 aa8.08□□□□□ -1.12
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