RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531885.5

CMTM1-215, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM1, Length 590 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM1-215ENST00000531885 SLC7A2P52569 658 aa9.51□□□□□ -0.89
CMTM1-215ENST00000531885 BLMHQ13867 455 aa9.51□□□□□ -0.89
CMTM1-215ENST00000531885 LRRC10Q5BKY1 277 aa9.51□□□□□ -0.89
CMTM1-215ENST00000531885 SAMD5Q5TGI4 173 aa9.51□□□□□ -0.89
CMTM1-215ENST00000531885 NCR3LG1Q68D85 454 aa9.51□□□□□ -0.89
CMTM1-215ENST00000531885 SLC35E4Q6ICL7 350 aa9.51□□□□□ -0.89
CMTM1-215ENST00000531885 SLC18B1Q6NT16 456 aa9.51□□□□□ -0.89
CMTM1-215ENST00000531885 SMARCD3Q6STE5 483 aa9.51□□□□□ -0.89
CMTM1-215ENST00000531885 Q6ZPA2 131 aa9.51□□□□□ -0.89
CMTM1-215ENST00000531885 CFAP77Q6ZQR2 320 aa9.51□□□□□ -0.89
CMTM1-215ENST00000531885 PTCHD4Q6ZW05 846 aa9.51□□□□□ -0.89
CMTM1-215ENST00000531885 ARPINQ7Z6K5 226 aa9.51□□□□□ -0.89
CMTM1-215ENST00000531885 FAM90A1Q86YD7 464 aa9.51□□□□□ -0.89
CMTM1-215ENST00000531885 LINC00346Q8IVM7 164 aa9.51□□□□□ -0.89
CMTM1-215ENST00000531885 SGCDQ92629 289 aa9.51□□□□□ -0.89
CMTM1-215ENST00000531885 CLPTM1LQ96KA5 538 aa9.51□□□□□ -0.89
CMTM1-215ENST00000531885 TSSK2Q96PF2 358 aa9.51□□□□□ -0.89
CMTM1-215ENST00000531885 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
CMTM1-215ENST00000531885 SIRT7Q9NRC8 400 aa9.51□□□□□ -0.89
CMTM1-215ENST00000531885 KCNG2Q9UJ96 466 aa9.51□□□□□ -0.89
CMTM1-215ENST00000531885 B9D1Q9UPM9 204 aa9.51□□□□□ -0.89
CMTM1-215ENST00000531885 SIGLEC7Q9Y286 467 aa9.51□□□□□ -0.89
CMTM1-215ENST00000531885 SNX13Q9Y5W8 968 aa9.51□□□□□ -0.89
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CMTM1-215ENST00000531885 UNC119BA6NIH7 251 aa9.5□□□□□ -0.89
CMTM1-215ENST00000531885 NKX6-3A6NJ46 265 aa9.5□□□□□ -0.89
CMTM1-215ENST00000531885 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa9.5□□□□□ -0.89
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CMTM1-215ENST00000531885 IMPA2O14732 288 aa9.5□□□□□ -0.89
CMTM1-215ENST00000531885 FFAR1O14842 300 aa9.5□□□□□ -0.89
CMTM1-215ENST00000531885 PPP1R3DO95685 299 aa9.5□□□□□ -0.89
CMTM1-215ENST00000531885 TXNDC12O95881 172 aa9.5□□□□□ -0.89
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CMTM1-215ENST00000531885 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
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CMTM1-215ENST00000531885 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CMTM1-215ENST00000531885 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
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CMTM1-215ENST00000531885 KRT72Q14CN4 511 aa9.5□□□□□ -0.89
CMTM1-215ENST00000531885 TAF13Q15543 124 aa9.5□□□□□ -0.89
CMTM1-215ENST00000531885 RFX4Q33E94 735 aa9.5□□□□□ -0.89
CMTM1-215ENST00000531885 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa9.5□□□□□ -0.89
CMTM1-215ENST00000531885 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CMTM1-215ENST00000531885 TEX36Q5VZQ5 186 aa9.5□□□□□ -0.89
CMTM1-215ENST00000531885 PGBD2Q6P3X8 592 aa9.5□□□□□ -0.89
CMTM1-215ENST00000531885 CPLX4Q7Z7G2 160 aa9.5□□□□□ -0.89
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CMTM1-215ENST00000531885 SLC26A10Q8NG04 563 aa9.5□□□□□ -0.89
CMTM1-215ENST00000531885 FANK1Q8TC84 345 aa9.5□□□□□ -0.89
CMTM1-215ENST00000531885 SLC7A13Q8TCU3 470 aa9.5□□□□□ -0.89
CMTM1-215ENST00000531885 HSH2DQ96JZ2 352 aa9.5□□□□□ -0.89
CMTM1-215ENST00000531885 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa9.5□□□□□ -0.89
CMTM1-215ENST00000531885 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa9.5□□□□□ -0.89
CMTM1-215ENST00000531885 PLXNB1O43157 2135 aa9.5□□□□□ -0.89
CMTM1-215ENST00000531885 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa9.49□□□□□ -0.89
CMTM1-215ENST00000531885 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa9.49□□□□□ -0.89
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CMTM1-215ENST00000531885 A0A1W2PRM7 423 aa9.49□□□□□ -0.89
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CMTM1-215ENST00000531885 PTP4A3O75365 173 aa9.49□□□□□ -0.89
CMTM1-215ENST00000531885 TIPRLO75663 272 aa9.49□□□□□ -0.89
CMTM1-215ENST00000531885 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
CMTM1-215ENST00000531885 DDOSTP39656 456 aa9.49□□□□□ -0.89
CMTM1-215ENST00000531885 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
CMTM1-215ENST00000531885 ZNF92Q03936 586 aa9.49□□□□□ -0.89
CMTM1-215ENST00000531885 ACSM1Q08AH1 577 aa9.49□□□□□ -0.89
CMTM1-215ENST00000531885 POU4F2Q12837 409 aa9.49□□□□□ -0.89
CMTM1-215ENST00000531885 IKZF1Q13422 519 aa9.49□□□□□ -0.89
CMTM1-215ENST00000531885 DGCR6Q14129 220 aa9.49□□□□□ -0.89
CMTM1-215ENST00000531885 DRAM2Q6UX65 266 aa9.49□□□□□ -0.89
CMTM1-215ENST00000531885 ZNF826PQ6ZT77 177 aa9.49□□□□□ -0.89
CMTM1-215ENST00000531885 CBLL1Q75N03 491 aa9.49□□□□□ -0.89
CMTM1-215ENST00000531885 DPY19L4Q7Z388 723 aa9.49□□□□□ -0.89
CMTM1-215ENST00000531885 OR6V1Q8N148 313 aa9.49□□□□□ -0.89
CMTM1-215ENST00000531885 GCSAMQ8N6F7 178 aa9.49□□□□□ -0.89
CMTM1-215ENST00000531885 C11orf44Q8N8P7 122 aa9.49□□□□□ -0.89
CMTM1-215ENST00000531885 OR51G2Q8NGK0 314 aa9.49□□□□□ -0.89
CMTM1-215ENST00000531885 LRRC29Q8WV35 223 aa9.49□□□□□ -0.89
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CMTM1-215ENST00000531885 COPS4Q9BT78 406 aa9.49□□□□□ -0.89
CMTM1-215ENST00000531885 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa9.49□□□□□ -0.89
CMTM1-215ENST00000531885 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CMTM1-215ENST00000531885 NECAP2Q9NVZ3 263 aa9.49□□□□□ -0.89
CMTM1-215ENST00000531885 DNAJB11Q9UBS4 358 aa9.49□□□□□ -0.89
CMTM1-215ENST00000531885 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa9.49□□□□□ -0.89
CMTM1-215ENST00000531885 ENPP4Q9Y6X5 453 aa9.49□□□□□ -0.89
CMTM1-215ENST00000531885 LOC100653049A0A140TA62 436 aa9.48□□□□□ -0.89
CMTM1-215ENST00000531885 A0A1W2PQ09 198 aa9.48□□□□□ -0.89
CMTM1-215ENST00000531885 DCTN6O00399 190 aa9.48□□□□□ -0.89
CMTM1-215ENST00000531885 XRCC2O43543 280 aa9.48□□□□□ -0.89
CMTM1-215ENST00000531885 EDF1O60869 148 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
CMTM1-215ENST00000531885 KRT34O76011 436 aa9.48□□□□□ -0.89
CMTM1-215ENST00000531885 SERPINA1P01009 418 aa9.48□□□□□ -0.89
CMTM1-215ENST00000531885 LHBP01229 141 aa9.48□□□□□ -0.89
CMTM1-215ENST00000531885 PAICSP22234 425 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
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