RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528484.5

CMTM1-211, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CMTM1, Length 726 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM1-211ENST00000528484 ZNF823P16415 610 aa9.51□□□□□ -0.89
CMTM1-211ENST00000528484 SLC7A2P52569 658 aa9.51□□□□□ -0.89
CMTM1-211ENST00000528484 BLMHQ13867 455 aa9.51□□□□□ -0.89
CMTM1-211ENST00000528484 LRRC10Q5BKY1 277 aa9.51□□□□□ -0.89
CMTM1-211ENST00000528484 SAMD5Q5TGI4 173 aa9.51□□□□□ -0.89
CMTM1-211ENST00000528484 NCR3LG1Q68D85 454 aa9.51□□□□□ -0.89
CMTM1-211ENST00000528484 SLC35E4Q6ICL7 350 aa9.51□□□□□ -0.89
CMTM1-211ENST00000528484 SLC18B1Q6NT16 456 aa9.51□□□□□ -0.89
CMTM1-211ENST00000528484 SMARCD3Q6STE5 483 aa9.51□□□□□ -0.89
CMTM1-211ENST00000528484 Q6ZPA2 131 aa9.51□□□□□ -0.89
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CMTM1-211ENST00000528484 FAM90A1Q86YD7 464 aa9.51□□□□□ -0.89
CMTM1-211ENST00000528484 LINC00346Q8IVM7 164 aa9.51□□□□□ -0.89
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CMTM1-211ENST00000528484 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
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CMTM1-211ENST00000528484 ZNF826PQ6ZT77 177 aa9.49□□□□□ -0.89
CMTM1-211ENST00000528484 CBLL1Q75N03 491 aa9.49□□□□□ -0.89
CMTM1-211ENST00000528484 DPY19L4Q7Z388 723 aa9.49□□□□□ -0.89
CMTM1-211ENST00000528484 OR6V1Q8N148 313 aa9.49□□□□□ -0.89
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CMTM1-211ENST00000528484 C11orf44Q8N8P7 122 aa9.49□□□□□ -0.89
CMTM1-211ENST00000528484 OR51G2Q8NGK0 314 aa9.49□□□□□ -0.89
CMTM1-211ENST00000528484 LRRC29Q8WV35 223 aa9.49□□□□□ -0.89
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CMTM1-211ENST00000528484 COPS4Q9BT78 406 aa9.49□□□□□ -0.89
CMTM1-211ENST00000528484 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa9.49□□□□□ -0.89
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CMTM1-211ENST00000528484 NECAP2Q9NVZ3 263 aa9.49□□□□□ -0.89
CMTM1-211ENST00000528484 DNAJB11Q9UBS4 358 aa9.49□□□□□ -0.89
CMTM1-211ENST00000528484 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa9.49□□□□□ -0.89
CMTM1-211ENST00000528484 ENPP4Q9Y6X5 453 aa9.49□□□□□ -0.89
CMTM1-211ENST00000528484 LOC100653049A0A140TA62 436 aa9.48□□□□□ -0.89
CMTM1-211ENST00000528484 A0A1W2PQ09 198 aa9.48□□□□□ -0.89
CMTM1-211ENST00000528484 DCTN6O00399 190 aa9.48□□□□□ -0.89
CMTM1-211ENST00000528484 XRCC2O43543 280 aa9.48□□□□□ -0.89
CMTM1-211ENST00000528484 EDF1O60869 148 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
CMTM1-211ENST00000528484 KRT34O76011 436 aa9.48□□□□□ -0.89
CMTM1-211ENST00000528484 SERPINA1P01009 418 aa9.48□□□□□ -0.89
CMTM1-211ENST00000528484 LHBP01229 141 aa9.48□□□□□ -0.89
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