RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509355.5

PDE4D-217, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 847 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-217ENST00000509355 Q8NBF4 154 aa3.61□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 CCDC197Q8NCU1 140 aa3.61□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 C17orf47Q8NEP4 570 aa3.61□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 OR4K17Q8NGC6 315 aa3.61□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 OR13C5Q8NGS8 318 aa3.61□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 OR4F5Q8NH21 305 aa3.61□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 DOK4Q8TEW6 326 aa3.61□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP3.61□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 CITED1Q99966 193 aa3.61□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 AIF1LQ9BQI0 150 aa3.61□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 ERVK-6Q9BXR3 956 aa3.61□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP3.61□□□□□ -1.83
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PDE4D-217ENST00000509355 RAB1BQ9H0U4 201 aa3.61□□□□□ -1.83
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PDE4D-217ENST00000509355 ZNF665Q9H7R5 613 aa3.61□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
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PDE4D-217ENST00000509355 ZNF319Q9P2F9 582 aa3.61□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa3.61□□□□□ -1.83
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PDE4D-217ENST00000509355 EML6Q6ZMW3 1958 aa3.6□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa3.6□□□□□ -1.83
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PDE4D-217ENST00000509355 A0A0X1KG70 313 aa3.6□□□□□ -1.83
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PDE4D-217ENST00000509355 H3BTX0 84 aa3.6□□□□□ -1.83
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PDE4D-217ENST00000509355 SMIM10L1P0DMW3 83 aa3.6□□□□□ -1.83
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PDE4D-217ENST00000509355 GGT1P19440 569 aa3.6□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 PGCP20142 388 aa3.6□□□□□ -1.83
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PDE4D-217ENST00000509355 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP3.6□□□□□ -1.83
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PDE4D-217ENST00000509355 GIFP27352 417 aa3.6□□□□□ -1.83
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PDE4D-217ENST00000509355 CCR4P51679 360 aa3.6□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 CARD18P57730 90 aa3.6□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 CDKL1Q00532 357 aa3.6□□□□□ -1.83
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PDE4D-217ENST00000509355 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 ROS1P08922 2347 aa3.59□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 A0A1W2PR80 420 aa3.59□□□□□ -1.83
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PDE4D-217ENST00000509355 A8MVM7 634 aa3.59□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 C4orf51C9J302 202 aa3.59□□□□□ -1.83
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