RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 HAS2Q92819 552 aa9.46□□□□□ -0.9
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SH3BP2-209ENST00000504450 SLC6A15Q9H2J7 730 aa9.46□□□□□ -0.9
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SH3BP2-209ENST00000504450 PGAM5Q96HS1 289 aa9.45□□□□□ -0.9
SH3BP2-209ENST00000504450 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
SH3BP2-209ENST00000504450 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
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SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
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SH3BP2-209ENST00000504450 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP9.44□□□□□ -0.9
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