RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503687.2

RABGEF1-211, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 4,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-211ENST00000503687 AGBL5Q8NDL9 886 aa11.41□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa11.41□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa11.41□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 DUSP23Q9BVJ7 150 aa11.41□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa11.41□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa11.41□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 SSX5O60225 188 aa11.41□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 OR8U9P0C7N5 309 aa11.41□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 SLC35A1P78382 337 aa11.41□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 PLCXD3Q63HM9 321 aa11.41□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 NICN1Q9BSH3 213 aa11.41□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 E9PQ18 207 aa11.41□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 PI4KAP42356 2102 aa11.41□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 PPT1P50897 306 aa11.41□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 TAS2R31P59538 309 aa11.41□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 RIN1Q13671 783 aa11.41□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 SP6Q3SY56 376 aa11.41□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 ELFN2Q5R3F8 820 aa11.41□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 THEM4Q5T1C6 240 aa11.41□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 IL22RA1Q8N6P7 574 aa11.41□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 SLC26A10Q8NG04 563 aa11.41□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 CTDSPLO15194 276 aa11.4□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 SOCS1O15524 211 aa11.4□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 SCGNO76038 276 aa11.4□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 APC2O95996 2303 aa11.4□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 TCN2P20062 427 aa11.4□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 PSMB6P28072 239 aa11.4□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 NXPH1P58417 271 aa11.4□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 ZP1P60852 638 aa11.4□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 PPA1Q15181 289 aa11.4□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 VASH2Q86V25 355 aa11.4□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 DEFB123Q8N688 67 aa11.4□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa11.4□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 GJC3Q8NFK1 279 aa11.4□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 AKR7LQ8NHP1 331 aa11.4□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 CCDC74BQ96LY2 380 aa11.4□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 ARPC5LQ9BPX5 153 aa11.4□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 SCPEP1Q9HB40 452 aa11.4□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP11.4□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 LANCL2Q9NS86 450 aa11.4□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 TSPAN15O95858 294 aa11.4□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 CAMLGP49069 296 aa11.4□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 SSR4P51571 173 aa11.4□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 H2BFSP57053 126 aa11.4□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 GGTLC2Q14390 218 aa11.4□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 GNMTQ14749 295 aa11.4□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 TRIM61Q5EBN2 209 aa11.4□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 TMEM200AQ86VY9 491 aa11.4□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 ROBO4Q8WZ75 1007 aa11.4□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 SGCZQ96LD1 299 aa11.4□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 J3QRE1 110 aa11.4□□□□□ -0.59
RABGEF1-211ENST00000503687 M0R135 149 aa11.4□□□□□ -0.59
RABGEF1-211ENST00000503687 EDN3P14138 238 aa11.4□□□□□ -0.59
RABGEF1-211ENST00000503687 C2orf68Q2NKX9 166 aa11.4□□□□□ -0.59
RABGEF1-211ENST00000503687 TUSC1Q2TAM9 212 aa11.4□□□□□ -0.59
RABGEF1-211ENST00000503687 TMEM164Q5U3C3 297 aa11.4□□□□□ -0.59
RABGEF1-211ENST00000503687 TMEM71Q6P5X7 295 aa11.4□□□□□ -0.59
RABGEF1-211ENST00000503687 LINC00696Q6ZRV3 163 aa11.4□□□□□ -0.59
RABGEF1-211ENST00000503687 CDH26Q8IXH8 852 aa11.4□□□□□ -0.59
RABGEF1-211ENST00000503687 EDAQ92838 391 aa11.4□□□□□ -0.59
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF799Q96GE5 643 aa11.4□□□□□ -0.59
RABGEF1-211ENST00000503687 GPR137Q96N19 417 aa11.4□□□□□ -0.59
RABGEF1-211ENST00000503687 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.59
RABGEF1-211ENST00000503687 SMOC1Q9H4F8 434 aa11.4□□□□□ -0.59
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.59
RABGEF1-211ENST00000503687 MYOTQ9UBF9 498 aa11.4□□□□□ -0.59
RABGEF1-211ENST00000503687 OR5H15A6NDH6 313 aa11.39□□□□□ -0.59
RABGEF1-211ENST00000503687 SNAPC5O75971 98 aa11.39□□□□□ -0.59
RABGEF1-211ENST00000503687 B4GALT1P15291 398 aa11.39□□□□□ -0.59
RABGEF1-211ENST00000503687 RPA2P15927 270 aa11.39□□□□□ -0.59
RABGEF1-211ENST00000503687 IL32P24001 234 aa11.39□□□□□ -0.59
RABGEF1-211ENST00000503687 FAM122BQ7Z309 247 aa11.39□□□□□ -0.59
RABGEF1-211ENST00000503687 SLAMF9Q96A28 289 aa11.39□□□□□ -0.59
RABGEF1-211ENST00000503687 A0A096LPE4 126 aa11.39□□□□□ -0.59
RABGEF1-211ENST00000503687 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa11.39□□□□□ -0.59
RABGEF1-211ENST00000503687 A0A1W2PPZ6 126 aa11.39□□□□□ -0.59
RABGEF1-211ENST00000503687 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
RABGEF1-211ENST00000503687 ANKUB1A6NFN9 424 aa11.39□□□□□ -0.59
RABGEF1-211ENST00000503687 K7EPK0 472 aa11.39□□□□□ -0.59
RABGEF1-211ENST00000503687 TNFSF11O14788 317 aa11.39□□□□□ -0.59
RABGEF1-211ENST00000503687 DIRAS3O95661 229 aa11.39□□□□□ -0.59
RABGEF1-211ENST00000503687 CHRM2P08172 466 aa11.39□□□□□ -0.59
RABGEF1-211ENST00000503687 MGMTP16455 207 aa11.39□□□□□ -0.59
RABGEF1-211ENST00000503687 PRKACAP17612 351 aa11.39□□□□□ -0.59
RABGEF1-211ENST00000503687 ENPP1P22413 925 aa11.39□□□□□ -0.59
RABGEF1-211ENST00000503687 GLRA1P23415 457 aa11.39□□□□□ -0.59
RABGEF1-211ENST00000503687 CASRP41180 1078 aa11.39□□□□□ -0.59
RABGEF1-211ENST00000503687 RGS19P49795 217 aa11.39□□□□□ -0.59
RABGEF1-211ENST00000503687 LIMK1P53667 647 aa11.39□□□□□ -0.59
RABGEF1-211ENST00000503687 CARD18P57730 90 aa11.39□□□□□ -0.59
RABGEF1-211ENST00000503687 PLP2Q04941 152 aa11.39□□□□□ -0.59
RABGEF1-211ENST00000503687 CAMK2BQ13554 666 aa11.39□□□□□ -0.59
RABGEF1-211ENST00000503687 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa11.39□□□□□ -0.59
RABGEF1-211ENST00000503687 P4HA3Q7Z4N8 544 aa11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms