RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495350.5

CBX1-205, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CBX1, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-205ENST00000495350 FAM216BQ8N7L0 139 aa5□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 GJC3Q8NFK1 279 aa5□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 GPR32P1Q8NGA4 272 aa5□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 OR5AU1Q8NGC0 362 aa5□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 OR51D1Q8NGF3 324 aa5□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 OR4X2Q8NGF9 303 aa5□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 LIPHQ8WWY8 451 aa5□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 SLCO4A1Q96BD0 722 aa5□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 OR52B2Q96RD2 323 aa5□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 CCL13Q99616 98 aa5□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 CCDC28BQ9BUN5 200 aa5□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa5□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 VAPAQ9P0L0 249 aa5□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 GRHPRQ9UBQ7 328 aa5□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 RPS6KA6Q9UK32 745 aa5□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 PITPNC1Q9UKF7 332 aa5□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 HIF3AQ9Y2N7 669 aa5□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 TRAV27A0A087WT01 109 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 HTR3EA5X5Y0 456 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 MEGF11A6BM72 1044 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 CD300LBA8K4G0 201 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 F5H5K5 113 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 BHLHE40O14503 412 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 AHCYL1O43865 530 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 SLC16A7O60669 478 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 OR5F1O95221 314 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 SCG5P05408 212 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 TSPAN19P0C672 248 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 CCDC159P0C7I6 412 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP4.99□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 IFI30P13284 250 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 NDUFB7P17568 137 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 GPX2P18283 190 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 GYS2P54840 703 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 DGCR2P98153 550 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 CD83Q01151 205 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 PCK2Q16822 640 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 ANKDD1AQ495B1 522 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 ZNF826PQ6ZT77 177 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 CCDC121Q6ZUS5 278 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 PIGWQ7Z7B1 504 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 OAFQ86UD1 273 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 NKAIN4Q8IVV8 208 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 GLB1L2Q8IW92 636 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 MICU2Q8IYU8 434 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 Q8N2B8 174 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 FGFRL1Q8N441 504 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 LNX2Q8N448 690 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 GCSAMQ8N6F7 178 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 Q8N7P7 452 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 OR4D11Q8NGI4 311 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 OR8S1Q8NH09 359 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 OR51A7Q8NH64 312 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 RPS4Y2Q8TD47 263 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 LRRC29Q8WV35 223 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 C17orf50Q8WW18 174 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 LZICQ8WZA0 190 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 TNFRSF14Q92956 283 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 BPIFA2Q96DR5 249 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 SPDL1Q96EA4 605 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 ZNF570Q96NI8 536 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 PITX2Q99697 317 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 PRSS27Q9BQR3 290 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 EBF4Q9BQW3 602 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 SIKE1Q9BRV8 207 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 CDCA4Q9BXL8 241 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 MEGF9Q9H1U4 602 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 SH3GLB1Q9Y371 365 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 NDUFAF1Q9Y375 327 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 CAPN7Q9Y6W3 813 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 BIRC6Q9NR09 4857 aa4.98□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 A0A0G2JND7 137 aa4.98□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 A0A1B0GW55 424 aa4.98□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa4.98□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 A0A1W2PPE2 198 aa4.98□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 A0A1W2PPH5 198 aa4.98□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 A0A1W2PR64 198 aa4.98□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 A0A1W2PRV1 198 aa4.98□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 PRSS37A4D1T9 235 aa4.98□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 ACOT8O14734 319 aa4.98□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 SYNGR1O43759 233 aa4.98□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 FCN3O75636 299 aa4.98□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 ACSM4P0C7M7 580 aa4.98□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 DUX4L2P0CJ85 424 aa4.98□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 DUX4L3P0CJ86 424 aa4.98□□□□□ -1.61
CBX1-205ENST00000495350 DUX4L4P0CJ87 422 aa4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.8 ms