RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495327.1

RBM28-208, Transcript of RNA binding motif protein 28, human

TSL 2

Gene RBM28, Length 395 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM28-208	ENST00000495327	SBK2	P0C263	348 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	CA6	P23280	308 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	RBMX	P38159	391 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	DDOST	P39656	456 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	SCGB2A2	Q13296	93 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	PTGES3	Q15185	160 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	OR8G1	Q15617	311 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	KLHL12	Q53G59	568 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	SPATC1	Q76KD6	591 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	MOGAT3	Q86VF5	341 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	KLB	Q86Z14	1044 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	BBS1	Q8NFJ9	593 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	OR56B2P	Q8NGI1	322 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	OR52H1	Q8NGJ2	320 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	KRT84	Q9NSB2	600 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	ENOPH1	Q9UHY7	261 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	PCDHB10	Q9UN67	800 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	AP4S1	Q9Y587	144 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	hCG_38984	A0A1B0GV85	526 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	CEACAM18	A8MTB9	384 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	TBX1	O43435	398 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	CIB2	O75838	187 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	CYB5R3	P00387	301 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	H2BFM	P0C1H6	154 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	CFL1	P23528	166 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	NAA10	P41227	235 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	ZNF121	P58317	390 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	PSMA6	P60900	246 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	RPS7	P62081	194 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	LCN2	P80188	198 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	APOF	Q13790	326 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	SNAPC1	Q16533	368 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	TIGD6	Q17RP2	521 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	ZNF404	Q494X3	552 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	LCN1P1	Q5VSP4	162 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	KDM4D	Q6B0I6	523 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	FAHD2B	Q6P2I3	314 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	ASRGL1	Q7L266	308 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	SLC16A9	Q7RTY1	509 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	C1QL2	Q7Z5L3	287 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	ZDHHC13	Q8IUH4	622 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	PHC2	Q8IXK0	858 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	SPERT	Q8NA61	448 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	PLPP7	Q8NBV4	271 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	FAHD2A	Q96GK7	314 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	RGCC	Q9H4X1	137 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	NIPAL2	Q9H841	368 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	TVP23B	Q9NYZ1	205 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	CCDC182	A6NF36	153 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	ZAR1L	A6NP61	321 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	TCF21	O43680	179 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	FAM20B	O75063	409 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	AVP	P01185	164 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	IRF2	P14316	349 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	ALOX5AP	P20292	161 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	PMEL	P40967	661 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	FAM3A	P98173	230 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	MZT1	Q08AG7	82 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	ESCO2	Q56NI9	601 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	PRAMEF6	Q5VXH4	476 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	SLX4IP	Q5VYV7	408 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	FAM57B	Q71RH2	274 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	OR11L1	Q8NGX0	322 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	LRTOMT	Q8WZ04	291 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	REEP6	Q96HR9	211 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	YIPF3	Q9GZM5	350 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	OR10A2	Q9H208	303 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	METTL17	Q9H7H0	456 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	FN3KRP	Q9HA64	309 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	TMEM165	Q9HC07	324 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	DNAJC27	Q9NZQ0	273 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	METRN	Q9UJH8	293 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	KLHDC2	Q9Y2U9	406 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	LOC105371242	A0A075B767	164 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327		A0A0A6YYJ9	748 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	KIR2DP1	A0A0G2JNF4	349 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	IGHV3-64D	A0A0J9YX35	117 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	ANKRD30BL	A7E2S9	258 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	PRKY	O43930	277 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	FSHB	P01225	129 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	RPS2	P15880	293 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	OR8B8	Q15620	311 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	MPPED2	Q15777	294 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	SNCB	Q16143	134 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	C12orf73	Q69YU5	71 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	DEGS2	Q6QHC5	323 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	LRRN1	Q6UXK5	716 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	HIST2H2AB	Q8IUE6	130 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	THEM6	Q8WUY1	208 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	SGK3	Q96BR1	496 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	PGAM5	Q96HS1	289 aa		11.17	□□□□□ -0.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39 ms