RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491581.5

HDAC3-211, Transcript of histone deacetylase 3, humanhuman

TSL 3

Gene HDAC3, Length 777 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF823P16415 610 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 AMY2BP19961 511 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 PRTN3P24158 256 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 FPR2P25090 351 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 PAX6P26367 422 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 CD200P41217 278 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 RGS6P49758 472 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 RELBQ01201 579 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 FAM90A1Q86YD7 464 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 C1orf174Q8IYL3 243 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 PNKDQ8N490 385 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 GCSAMQ8N6F7 178 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 BBS1Q8NFJ9 593 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 OR5T2Q8NGG2 359 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 OR5L1Q8NGL2 311 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 ZFAND2BQ8WV99 257 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 UPRTQ96BW1 309 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 TBX15Q96SF7 602 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 COPS4Q9BT78 406 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 WACQ9BTA9 647 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 NDEL1Q9GZM8 345 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 IL20Q9NYY1 176 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 LRCH1Q9Y2L9 728 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 DHRS12A0PJE2 317 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 A6NLC8 198 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 PRR32B1ATL7 298 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 M0R129 80 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 NDUFAB1O14561 156 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 ADAM20O43506 726 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 CCNB2O95067 398 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 PRKACGP22612 351 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 GATA3P23771 443 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 PSMB10P40306 273 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 MAGEA2P43356 314 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 CX3CR1P49238 355 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 ENTPD1P49961 510 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 HMGA2P52926 109 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 TPTEP56180 551 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 OR8B8Q15620 311 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 TMEM236Q5W0B7 351 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 FAM57BQ71RH2 274 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 DPY19L4Q7Z388 723 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 BATF2Q8N1L9 274 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 KIR3DL3Q8N743 410 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 FAM216BQ8N7L0 139 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 OR8B3Q8NGG8 313 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 OR6N2Q8NGY6 317 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 PPP1R14AQ96A00 147 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 SGK3Q96BR1 496 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 OR8B2Q96RD0 313 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 CCL13Q99616 98 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 SNTG1Q9NSN8 517 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 CLN8Q9UBY8 286 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 ATPIF1Q9UII2 106 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 FAM181BA6NEQ2 426 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 MMP9P14780 707 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 TUBG1P23258 451 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 ACKR3P25106 362 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 CFHR2P36980 270 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 GATA4P43694 442 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 SMIM11AP58511 58 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 ARF6P62330 175 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 FAM3AP98173 230 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 MALLQ13021 153 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 KLRD1Q13241 179 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 PCK2Q16822 640 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 MICAQ29983 383 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF181Q2M3W8 571 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 SLC36A3Q495N2 470 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 OR2T5Q6IEZ7 315 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 C16orf89Q6UX73 402 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 DCDC5Q6ZRR9 648 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 SLC16A9Q7RTY1 509 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 PRSS45Q7RTY3 260 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 OR10G2Q8NGC3 310 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 OR52L1Q8NGH7 329 aa7.37□□□□□ -1.23
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