RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 STARD4Q96DR4 205 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 TEAD3Q99594 435 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 REEP1Q9H902 201 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 FLVCR2Q9UPI3 526 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 GOLGA8JA6NMD2 632 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 TAAR5O14804 337 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 ETHE1O95571 254 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 GOLGA8HP0CJ92 632 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 MYCNOSP40205 109 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 CCNG1P51959 295 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 PSMC5P62195 406 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 MPV17L2Q567V2 206 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 UBALD2Q8IYN6 164 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF414Q96IQ9 312 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 HES2Q9Y543 173 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 KPTNQ9Y664 436 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 SMIM26A0A096LP01 95 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 CHST10O43529 356 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 CSTAP01040 98 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 PTHP01270 115 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 GFERP55789 205 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 CDK5Q00535 292 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF691Q5VV52 312 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 WDR86Q86TI4 376 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 RAB43Q86YS6 212 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 WDFY1Q8IWB7 410 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 ARHGAP18Q8N392 663 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 C19orf18Q8NEA5 215 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 OR4K5Q8NGD3 323 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 OR6K6Q8NGW6 343 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM175Q9BSA9 504 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 OR52D1Q9H346 318 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 TREX1Q9NSU2 369 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 TNFRSF11BO00300 401 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 SOCS1O15524 211 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 LCA5LO95447 670 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF688P0C7X2 276 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 PCK1P35558 622 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 CACNG7P62955 275 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 CRADDP78560 199 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 Q6ZR03 302 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 RTL4Q6ZR62 310 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 NDUFAF7Q7L592 441 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 SLC16A13Q7RTY0 426 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 OR13C9Q8NGT0 318 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 SYNPRQ8TBG9 265 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 SAMD10Q9BYL1 202 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 CES1P1Q9UKY3 287 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 PTPRTO14522 1441 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 KRBOX1C9JBD0 128 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 KDELR3O43731 214 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 SPOPO43791 374 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 HLA-DQA1P01909 254 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 PTNP21246 168 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 IVDP26440 423 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 NDUFA8P51970 172 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 OR2T5Q6IEZ7 315 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 FAM58AQ8N1B3 248 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 OR6N1Q8NGY5 312 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 OR2T29Q8NH02 315 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 FAM131CQ96AQ9 280 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF488Q96MN9 340 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 RSG1Q9BU20 258 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 SBNO1A3KN83 1393 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 HECW2Q9P2P5 1572 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 CTNSO60931 367 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC172P0C7W6 258 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 ARL2P36404 184 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 IFITM3Q01628 133 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 PNOCQ13519 176 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 Q5W150 140 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 LINC00469Q8N7U9 141 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 WDR31Q8NA23 367 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 GATSQ8NAP1 163 aa4.72□□□□□ -1.65
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