RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490425.1

NISCH-214, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 5

Gene NISCH, Length 559 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-214ENST00000490425 IL4I1Q96RQ9 567 aa10.12□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 TOR3AQ9H497 397 aa10.12□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 RIBC2Q9H4K1 309 aa10.12□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 ZNF319Q9P2F9 582 aa10.12□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 LAMP5Q9UJQ1 280 aa10.12□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 TMEM178BH3BS89 294 aa10.11□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 PSMD9O00233 223 aa10.11□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 XRCC2O43543 280 aa10.11□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 PLPP2O43688 288 aa10.11□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 ALOX5APP20292 161 aa10.11□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 HNF1AP20823 631 aa10.11□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 BTG1P62324 171 aa10.11□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 FAM3AP98173 230 aa10.11□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 MAB21L1Q13394 359 aa10.11□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 FAM201AQ5SY85 155 aa10.11□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 LCN1P1Q5VSP4 162 aa10.11□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa10.11□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 C12orf73Q69YU5 71 aa10.11□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 SLC16A9Q7RTY1 509 aa10.11□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 SPSB4Q96A44 273 aa10.11□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 REEP6Q96HR9 211 aa10.11□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 PGAM5Q96HS1 289 aa10.11□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 OSBPL10Q9BXB5 764 aa10.11□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 TTTY10Q9BZA0 68 aa10.11□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 PRRG3Q9BZD7 231 aa10.11□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 UFSP2Q9NUQ7 469 aa10.11□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 PRR32B1ATL7 298 aa10.1□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 IFNA2P01563 188 aa10.1□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 APOC1P02654 83 aa10.1□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 CD200P41217 278 aa10.1□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 RAD23AP54725 363 aa10.1□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 LCN2P80188 198 aa10.1□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 EFNB1P98172 346 aa10.1□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 MPPED2Q15777 294 aa10.1□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 AADACL4Q5VUY2 407 aa10.1□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 RHOUQ7L0Q8 258 aa10.1□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 KRT77Q7Z794 578 aa10.1□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 RFLNBQ8N5W9 214 aa10.1□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 TMEM163Q8TC26 289 aa10.1□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 FAHD2AQ96GK7 314 aa10.1□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 MDFIQ99750 246 aa10.1□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 YIPF3Q9GZM5 350 aa10.1□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 OR10A2Q9H208 303 aa10.1□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 SP140LQ9H930 580 aa10.1□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 ENOPH1Q9UHY7 261 aa10.1□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 PCDHB10Q9UN67 800 aa10.1□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 COPS3Q9UNS2 423 aa10.1□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 LRP12Q9Y561 859 aa10.1□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 ANK2Q01484 3957 aa10.1□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 TRAV20A0A0B4J274 112 aa10.09□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa10.09□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 IFNL4K9M1U5 179 aa10.09□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 FAM20BO75063 409 aa10.09□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 ANPEPP15144 967 aa10.09□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 SRP14P37108 136 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 MDH2P40926 338 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 GATA4P43694 442 aa10.09□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 GSK3AP49840 483 aa10.09□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 TMEM155Q4W5P6 130 aa10.09□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 ZFP1Q6P2D0 407 aa10.09□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 KLHL36Q8N4N3 616 aa10.09□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 SPICQ8N5J4 248 aa10.09□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa10.09□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 C19orf18Q8NEA5 215 aa10.09□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 OR8B12Q8NGG6 310 aa10.09□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 OR52H1Q8NGJ2 320 aa10.09□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 GABARAPL3Q9BY60 117 aa10.09□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 SLC22A4Q9H015 551 aa10.09□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 OPA3Q9H6K4 179 aa10.09□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa10.09□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 G6PC2Q9NQR9 355 aa10.09□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
NISCH-214ENST00000490425 LRRC30A6NM36 301 aa10.08□□□□□ -0.8
NISCH-214ENST00000490425 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa10.08□□□□□ -0.8
NISCH-214ENST00000490425 CEACAM18A8MTB9 384 aa10.08□□□□□ -0.8
NISCH-214ENST00000490425 EI24O14681 340 aa10.08□□□□□ -0.8
NISCH-214ENST00000490425 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
NISCH-214ENST00000490425 GMDSO60547 372 aa10.08□□□□□ -0.8
NISCH-214ENST00000490425 AVPP01185 164 aa10.08□□□□□ -0.8
NISCH-214ENST00000490425 GRPP07492 148 aa10.08□□□□□ -0.8
NISCH-214ENST00000490425 PCMT1P22061 227 aa10.08□□□□□ -0.8
NISCH-214ENST00000490425 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
NISCH-214ENST00000490425 NXNL2Q5VZ03 156 aa10.08□□□□□ -0.8
NISCH-214ENST00000490425 SLC35F2Q8IXU6 374 aa10.08□□□□□ -0.8
NISCH-214ENST00000490425 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
NISCH-214ENST00000490425 DEFB108BQ8NET1 73 aa10.08□□□□□ -0.8
NISCH-214ENST00000490425 OR11L1Q8NGX0 322 aa10.08□□□□□ -0.8
NISCH-214ENST00000490425 LYZL4Q96KX0 146 aa10.08□□□□□ -0.8
NISCH-214ENST00000490425 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms