RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483873.6

GTF3C4-202, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 4, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene GTF3C4, Length 1,417 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4-202ENST00000483873 XRCC2O43543 280 aa22.45■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 ENTPD6O75354 484 aa22.45■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 CXCR4P61073 352 aa22.45■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 IL18R1Q13478 541 aa22.45■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 SLC25A30Q5SVS4 291 aa22.45■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 OR13G1Q8NGZ3 307 aa22.45■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 ITLN1Q8WWA0 313 aa22.45■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 PGAM5Q96HS1 289 aa22.45■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 OR8B4Q96RC9 309 aa22.45■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 TBX5Q99593 518 aa22.45■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 CLN6Q9NWW5 311 aa22.45■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa22.45■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 PPIHO43447 177 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 MPZL2O60487 215 aa22.44■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 HLA-DPB1P04440 258 aa22.44■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 TNFSF4P23510 183 aa22.44■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 ISL1P61371 349 aa22.44■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 OCLNQ16625 522 aa22.44■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 TIGD6Q17RP2 521 aa22.44■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 GFOD2Q3B7J2 385 aa22.44■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 SETD9Q8NE22 299 aa22.44■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 SPSB4Q96A44 273 aa22.44■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 SGK3Q96BR1 496 aa22.44■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 REEP6Q96HR9 211 aa22.44■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 OR2V2Q96R30 315 aa22.44■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 RASSF4Q9H2L5 321 aa22.44■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 IKZF2Q9UKS7 526 aa22.44■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 GGT3PA6NGU5 568 aa22.43■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 TACSTD2P09758 323 aa22.43■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 ROM1Q03395 351 aa22.43■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 SSX6Q7RTT6 188 aa22.43■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 OR56B2PQ8NGI1 322 aa22.43■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 ASB17Q8WXJ9 295 aa22.43■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 CCL17Q92583 94 aa22.43■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 NARFLQ9H6Q4 476 aa22.43■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 NIPAL2Q9H841 368 aa22.43■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 SP140LQ9H930 580 aa22.43■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 TMEM100Q9NV29 134 aa22.43■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 DCAF16Q9NXF7 216 aa22.43■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 IL19Q9UHD0 177 aa22.43■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 A0A1B0GWJ7 208 aa22.42■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa22.42■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 F5H5P2 479 aa22.42■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 WNT9BO14905 357 aa22.42■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 WBP4O75554 376 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 IL2RGP31785 369 aa22.42■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 HSPA13P48723 471 aa22.42■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 TMEM33P57088 247 aa22.42■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 HFEQ30201 348 aa22.42■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 AVPI1Q5T686 147 aa22.42■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 MEDAGQ5VYS4 303 aa22.42■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 DEGS2Q6QHC5 323 aa22.42■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 ZNF679Q8IYX0 411 aa22.42■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 OR8B12Q8NGG6 310 aa22.42■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 OR52H1Q8NGJ2 320 aa22.42■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 CNIH3Q8TBE1 160 aa22.42■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 RFKQ969G6 155 aa22.42■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 MROQ9BYG7 248 aa22.42■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 OR10A2Q9H208 303 aa22.42■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa22.41■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 IGHV4-31P0DP07 118 aa22.41■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 FAM3AP98173 230 aa22.41■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 POU4F2Q12837 409 aa22.41■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 MEGF10Q96KG7 1140 aa22.41■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 MNTQ99583 582 aa22.41■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 SOX7Q9BT81 388 aa22.41■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 OPA3Q9H6K4 179 aa22.41■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 FAM206AQ9NX38 181 aa22.41■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa22.41■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa22.4■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 CLDN25C9JDP6 229 aa22.4■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 CA6P23280 308 aa22.4■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 RIDAP52758 137 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 MVKQ03426 396 aa22.4■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 TMED1Q13445 227 aa22.4■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa22.4■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 PHYHO14832 338 aa22.4■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 CD5LO43866 347 aa22.4■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 ZNF254O75437 659 aa22.4■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 TNFRSF1AP19438 455 aa22.4■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 CHN2P52757 468 aa22.4■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 OR10H4Q8NGA5 316 aa22.4■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 LYZL4Q96KX0 146 aa22.4■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 ANKRD60Q9BZ19 345 aa22.4■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP22.4■■□□□ 1.18
GTF3C4-202ENST00000483873 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.1 ms