RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480273.5

RTEL1-TNFRSF6B-201, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 2

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 5,751 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CBY1Q9Y3M2 126 aa15.53■□□□□ 0.08
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP15.53■□□□□ 0.08
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 EXT1Q16394 746 aa15.53■□□□□ 0.08
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC39A7Q92504 469 aa15.53■□□□□ 0.08
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TOLLIPQ9H0E2 274 aa15.53■□□□□ 0.08
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CYSLTR2Q9NS75 346 aa15.53■□□□□ 0.08
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SIRT5Q9NXA8 310 aa15.53■□□□□ 0.08
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa15.53■□□□□ 0.08
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 A0A1W2PPQ1 181 aa15.53■□□□□ 0.08
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 AQP7P3A6NL99 342 aa15.53■□□□□ 0.08
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC6A13Q9NSD5 602 aa15.53■□□□□ 0.08
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 WNT11O96014 354 aa15.52■□□□□ 0.08
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC25A6P12236 298 aa15.52■□□□□ 0.07
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CYB561P49447 251 aa15.52■□□□□ 0.07
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LRRTM1Q86UE6 522 aa15.52■□□□□ 0.07
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DHODHQ02127 395 aa15.52■□□□□ 0.07
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ST3GAL2Q16842 350 aa15.52■□□□□ 0.07
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IGLV3-27P01718 113 aa15.51■□□□□ 0.07
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa15.51■□□□□ 0.07
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 EDAQ92838 391 aa15.51■□□□□ 0.07
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa15.51■□□□□ 0.07
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GPR12P47775 334 aa15.51■□□□□ 0.07
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TAS2R45P59539 299 aa15.51■□□□□ 0.07
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HES1Q14469 280 aa15.51■□□□□ 0.07
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CMBLQ96DG6 245 aa15.51■□□□□ 0.07
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GNB4Q9HAV0 340 aa15.51■□□□□ 0.07
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 A0A1W2PPE2 198 aa15.51■□□□□ 0.07
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 A0A1W2PR64 198 aa15.51■□□□□ 0.07
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 A0A1W2PRV1 198 aa15.51■□□□□ 0.07
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SELEP16581 610 aa15.51■□□□□ 0.07
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FCER1GP30273 86 aa15.51■□□□□ 0.07
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CDC20BQ86Y33 519 aa15.51■□□□□ 0.07
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 COMMD1Q8N668 190 aa15.51■□□□□ 0.07
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FAM96BQ9Y3D0 163 aa15.51■□□□□ 0.07
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MPGP29372 298 aa15.5■□□□□ 0.07
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CCR2P41597 374 aa15.5■□□□□ 0.07
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa15.5■□□□□ 0.07
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 VAMP5O95183 116 aa15.5■□□□□ 0.07
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRTDAPP60985 99 aa15.5■□□□□ 0.07
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MOGAT2Q3SYC2 334 aa15.5■□□□□ 0.07
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SSX7Q7RTT5 188 aa15.5■□□□□ 0.07
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CORO2AQ92828 525 aa15.5■□□□□ 0.07
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